Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.49■■□□□ 1.35
SRF1Q12516 NOP1YDL014W 984 nt23.23■■□□□ 1.31
SRF1Q12516 NSR1YGR159C 1245 nt22.54■■□□□ 1.2
SRF1Q12516 YKL036CYKL036C 393 nt22.2■■□□□ 1.14
SRF1Q12516 YJL027CYJL027C 417 nt20.92■□□□□ 0.94
SRF1Q12516 SCS3YGL126W 1143 nt20.6■□□□□ 0.89
SRF1Q12516 Q0297Q0297 156 nt20.52■□□□□ 0.88
SRF1Q12516 SRX1YKL086W 384 nt20.23■□□□□ 0.83
SRF1Q12516 SCJ1YMR214W 1134 nt19.36■□□□□ 0.69
SRF1Q12516 YCR051WYCR051W 669 nt19.34■□□□□ 0.69
SRF1Q12516 MDJ1YFL016C 1536 nt19.17■□□□□ 0.66
SRF1Q12516 YOL085CYOL085C 342 nt19.16■□□□□ 0.66
SRF1Q12516 PKP1YIL042C 1185 nt18.8■□□□□ 0.6
SRF1Q12516 ATS1YAL020C 1002 nt18.69■□□□□ 0.58
SRF1Q12516 RPP1BYDL130W 321 nt18.45■□□□□ 0.54
SRF1Q12516 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.73■□□□□ 0.43
SRF1Q12516 CCC1YLR220W 969 nt17.68■□□□□ 0.42
SRF1Q12516 SCR1SCR1 522 nt17.66■□□□□ 0.42
SRF1Q12516 RTC3YHR087W 336 nt17.63■□□□□ 0.41
SRF1Q12516 PET122YER153C 765 nt17.49■□□□□ 0.39
SRF1Q12516 DBP2YNL112W 1641 nt17.22■□□□□ 0.35
SRF1Q12516 PST2YDR032C 597 nt17.12■□□□□ 0.33
SRF1Q12516 RRN5YLR141W 1092 nt17.11■□□□□ 0.33
SRF1Q12516 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.1■□□□□ 0.33
SRF1Q12516 RSB1YOR049C 1065 nt17.07■□□□□ 0.32
SRF1Q12516 YKL097CYKL097C 411 nt16.99■□□□□ 0.31
SRF1Q12516 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.76■□□□□ 0.27
SRF1Q12516 RVS167YDR388W 1449 nt16.6■□□□□ 0.25
SRF1Q12516 YDJ1YNL064C 1230 nt16.53■□□□□ 0.24
SRF1Q12516 SHU1YHL006C 453 nt16.22■□□□□ 0.19
SRF1Q12516 SHR5YOL110W 714 nt16.14■□□□□ 0.17
SRF1Q12516 YBR190WYBR190W 312 nt16.13■□□□□ 0.17
SRF1Q12516 GAR1YHR089C 618 nt16.07■□□□□ 0.16
SRF1Q12516 YOR139CYOR139C 393 nt16.04■□□□□ 0.16
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SRF1Q12516 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.74■□□□□ 0.11
SRF1Q12516 TIR1YER011W 765 nt15.46■□□□□ 0.07
SRF1Q12516 BSC6YOL137W 1494 nt15.42■□□□□ 0.06
SRF1Q12516 DEP1YAL013W 1218 nt15.42■□□□□ 0.06
SRF1Q12516 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.37■□□□□ 0.05
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SRF1Q12516 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.37■□□□□ 0.05
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SRF1Q12516 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.37■□□□□ 0.05
SRF1Q12516 RPN10YHR200W 807 nt15.28■□□□□ 0.04
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SRF1Q12516 RKM5YLR137W 1104 nt14.87□□□□□ -0.03
SRF1Q12516 YLR281CYLR281C 468 nt14.81□□□□□ -0.04
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SRF1Q12516 UBX6YJL048C 1191 nt14.68□□□□□ -0.06
SRF1Q12516 WHI5YOR083W 888 nt14.66□□□□□ -0.06
SRF1Q12516 ADO1YJR105W 1023 nt14.65□□□□□ -0.06
SRF1Q12516 FMP45YDL222C 930 nt14.63□□□□□ -0.07
SRF1Q12516 RPP2BYDR382W 333 nt14.55□□□□□ -0.08
SRF1Q12516 YCH1YGR203W 447 nt14.54□□□□□ -0.08
SRF1Q12516 YJR018WYJR018W 363 nt14.53□□□□□ -0.08
SRF1Q12516 DSK2YMR276W 1122 nt14.45□□□□□ -0.1
SRF1Q12516 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.42□□□□□ -0.1
SRF1Q12516 YEL076CYEL076C 651 nt14.42□□□□□ -0.1
SRF1Q12516 YLR464WYLR464W 651 nt14.42□□□□□ -0.1
SRF1Q12516 SAH1YER043C 1350 nt14.41□□□□□ -0.1
SRF1Q12516 IMP2'YIL154C 1041 nt14.38□□□□□ -0.11
SRF1Q12516 Q0182Q0182 405 nt14.37□□□□□ -0.11
SRF1Q12516 YPR011CYPR011C 981 nt14.37□□□□□ -0.11
SRF1Q12516 PUN1YLR414C 792 nt14.36□□□□□ -0.11
SRF1Q12516 YJR120WYJR120W 351 nt14.33□□□□□ -0.12
SRF1Q12516 BDH2YAL061W 1254 nt14.32□□□□□ -0.12
SRF1Q12516 LSM3YLR438C-A 270 nt14.31□□□□□ -0.12
SRF1Q12516 YLR236CYLR236C 324 nt14.3□□□□□ -0.12
SRF1Q12516 SIS1YNL007C 1059 nt14.22□□□□□ -0.13
SRF1Q12516 SSA3YBL075C 1950 nt14.21□□□□□ -0.13
SRF1Q12516 RTG1YOL067C 534 nt14.15□□□□□ -0.14
SRF1Q12516 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.14□□□□□ -0.15
SRF1Q12516 YDR094WYDR094W 336 nt14.11□□□□□ -0.15
SRF1Q12516 SPP1YPL138C 1062 nt14.1□□□□□ -0.15
SRF1Q12516 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.05□□□□□ -0.16
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SRF1Q12516 HUA1YGR268C 597 nt14.03□□□□□ -0.16
SRF1Q12516 PTC2YER089C 1395 nt14.01□□□□□ -0.17
SRF1Q12516 ERV46YAL042W 1248 nt13.96□□□□□ -0.17
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