Protein–RNA interactions for Protein: P25375

PRD1, Saccharolysin, yeastyeast

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1P25375 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.2■■□□□ 1.78
PRD1P25375 NSR1YGR159C 1245 nt25.91■■□□□ 1.74
PRD1P25375 NOP1YDL014W 984 nt25.39■■□□□ 1.66
PRD1P25375 YKL036CYKL036C 393 nt23.51■■□□□ 1.35
PRD1P25375 MDJ1YFL016C 1536 nt23.08■■□□□ 1.29
PRD1P25375 Q0297Q0297 156 nt22.26■■□□□ 1.15
PRD1P25375 SRX1YKL086W 384 nt22.21■■□□□ 1.15
PRD1P25375 YJL027CYJL027C 417 nt22■■□□□ 1.11
PRD1P25375 SCS3YGL126W 1143 nt21.47■■□□□ 1.03
PRD1P25375 YCR051WYCR051W 669 nt21.15■□□□□ 0.98
PRD1P25375 DBP2YNL112W 1641 nt20.43■□□□□ 0.86
PRD1P25375 YOL085CYOL085C 342 nt20.4■□□□□ 0.86
PRD1P25375 PKP1YIL042C 1185 nt20.17■□□□□ 0.82
PRD1P25375 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.07■□□□□ 0.8
PRD1P25375 RPP1BYDL130W 321 nt20■□□□□ 0.79
PRD1P25375 CCC1YLR220W 969 nt19.97■□□□□ 0.79
PRD1P25375 YBR190WYBR190W 312 nt19.56■□□□□ 0.72
PRD1P25375 RTC3YHR087W 336 nt19.21■□□□□ 0.67
PRD1P25375 ATS1YAL020C 1002 nt19.2■□□□□ 0.66
PRD1P25375 PET122YER153C 765 nt19.15■□□□□ 0.66
PRD1P25375 SCJ1YMR214W 1134 nt19.14■□□□□ 0.65
PRD1P25375 RVS167YDR388W 1449 nt19.12■□□□□ 0.65
PRD1P25375 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.03■□□□□ 0.64
PRD1P25375 SCR1SCR1 522 nt18.88■□□□□ 0.61
PRD1P25375 RRN5YLR141W 1092 nt18.61■□□□□ 0.57
PRD1P25375 SHR5YOL110W 714 nt18.48■□□□□ 0.55
PRD1P25375 YDJ1YNL064C 1230 nt18.34■□□□□ 0.53
PRD1P25375 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.24■□□□□ 0.51
PRD1P25375 RSB1YOR049C 1065 nt18.23■□□□□ 0.51
PRD1P25375 DEP1YAL013W 1218 nt18.07■□□□□ 0.48
PRD1P25375 GAR1YHR089C 618 nt18.03■□□□□ 0.48
PRD1P25375 URN1YPR152C 1398 nt17.99■□□□□ 0.47
PRD1P25375 PUT4YOR348C 1884 nt17.79■□□□□ 0.44
PRD1P25375 PST2YDR032C 597 nt17.77■□□□□ 0.44
PRD1P25375 OPI9YLR338W 858 nt17.68■□□□□ 0.42
PRD1P25375 YNL208WYNL208W 600 nt17.67■□□□□ 0.42
PRD1P25375 RPN10YHR200W 807 nt17.64■□□□□ 0.41
PRD1P25375 SAH1YER043C 1350 nt17.63■□□□□ 0.41
PRD1P25375 ARE1YCR048W 1833 nt17.5■□□□□ 0.39
PRD1P25375 TIR1YER011W 765 nt17.39■□□□□ 0.37
PRD1P25375 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.27■□□□□ 0.36
PRD1P25375 POA1YBR022W 534 nt17.27■□□□□ 0.36
PRD1P25375 SSA1YAL005C 1929 nt17.21■□□□□ 0.35
PRD1P25375 YJR018WYJR018W 363 nt17.15■□□□□ 0.34
PRD1P25375 PUN1YLR414C 792 nt17.13■□□□□ 0.33
PRD1P25375 SHU1YHL006C 453 nt17.08■□□□□ 0.32
PRD1P25375 YKL097CYKL097C 411 nt17.08■□□□□ 0.32
PRD1P25375 SRB2YHR041C 633 nt17.01■□□□□ 0.31
PRD1P25375 PTC2YER089C 1395 nt17■□□□□ 0.31
PRD1P25375 YJR120WYJR120W 351 nt16.94■□□□□ 0.3
PRD1P25375 BUD23YCR047C 828 nt16.9■□□□□ 0.3
PRD1P25375 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.88■□□□□ 0.29
PRD1P25375 BSC6YOL137W 1494 nt16.86■□□□□ 0.29
PRD1P25375 RPP2BYDR382W 333 nt16.76■□□□□ 0.27
PRD1P25375 NAB2YGL122C 1578 nt16.72■□□□□ 0.27
PRD1P25375 WWM1YFL010C 636 nt16.68■□□□□ 0.26
PRD1P25375 FPR4YLR449W 1179 nt16.55■□□□□ 0.24
PRD1P25375 FIS1YIL065C 468 nt16.52■□□□□ 0.24
PRD1P25375 DAL1YIR027C 1383 nt16.51■□□□□ 0.23
PRD1P25375 MNP1YGL068W 585 nt16.49■□□□□ 0.23
PRD1P25375 YGR021WYGR021W 873 nt16.48■□□□□ 0.23
PRD1P25375 HOM6YJR139C 1080 nt16.48■□□□□ 0.23
PRD1P25375 INM2YDR287W 879 nt16.47■□□□□ 0.23
PRD1P25375 BDH2YAL061W 1254 nt16.46■□□□□ 0.23
PRD1P25375 YOR139CYOR139C 393 nt16.44■□□□□ 0.22
PRD1P25375 SSA3YBL075C 1950 nt16.44■□□□□ 0.22
PRD1P25375 PHO4YFR034C 939 nt16.38■□□□□ 0.21
PRD1P25375 YBL100CYBL100C 315 nt16.38■□□□□ 0.21
PRD1P25375 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.31■□□□□ 0.2
PRD1P25375 NPL3YDR432W 1245 nt16.24■□□□□ 0.19
PRD1P25375 RKM5YLR137W 1104 nt16.24■□□□□ 0.19
PRD1P25375 LSM3YLR438C-A 270 nt16.22■□□□□ 0.19
PRD1P25375 FUN26YAL022C 1554 nt16.2■□□□□ 0.18
PRD1P25375 TRM9YML014W 840 nt16.15■□□□□ 0.18
PRD1P25375 YOL037CYOL037C 354 nt16.1■□□□□ 0.17
PRD1P25375 YPS1YLR120C 1710 nt16.03■□□□□ 0.16
PRD1P25375 SPT5YML010W 3192 nt16■□□□□ 0.15
PRD1P25375 CCT6YDR188W 1641 nt15.97■□□□□ 0.15
PRD1P25375 YDR095CYDR095C 411 nt15.92■□□□□ 0.14
PRD1P25375 ALF1YNL148C 765 nt15.92■□□□□ 0.14
PRD1P25375 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.86■□□□□ 0.13
PRD1P25375 MEP2YNL142W 1500 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.79■□□□□ 0.12
PRD1P25375 YLR281CYLR281C 468 nt15.78■□□□□ 0.12
PRD1P25375 WHI5YOR083W 888 nt15.75■□□□□ 0.11
PRD1P25375 PUS2YGL063W 1113 nt15.69■□□□□ 0.1
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