RNA–Protein interactions for RNA: YKL209C

STE6, Transcript of Plasma membrane ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene STE6, Length 3,873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STE6	YKL209C	TOS1	P38288	455 aa		3.9	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PSH1	Q12161	406 aa		3.9	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	DPH6	Q12429	685 aa		3.9	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	ERO1	Q03103	563 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MCD4	P36051	919 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PEA2	P40091	420 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	GYP7	P48365	746 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.89	□□□□□ -1.79	not detected
STE6	YKL209C	SIT4	P20604	311 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	TPD3	P31383	635 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MDL2	P33311	773 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MAM1	P40065	302 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	NCB2	Q92317	146 aa		3.89	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	UBX2	Q04228	584 aa		3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	DPL1	Q05567	589 aa		3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	YDL144C	Q07589	356 aa		3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	SRS2	P12954	1174 aa		3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	GAL2	P13181	574 aa		3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	NTH2	P35172	780 aa		3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	DNM1	P54861	757 aa		3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PUS5	Q06244	254 aa		3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	ISW2	Q08773	1120 aa		3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	ZDS2	P54786	942 aa		3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PEX29	Q03370	554 aa		3.87	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	EMP47	P43555	445 aa		3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	BDP1	P46678	594 aa		3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	NUP145	P49687	1317 aa		3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	GLC3	P32775	704 aa		3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PAH1	P32567	862 aa		3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PSF2	P40359	213 aa		3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	GIN4	Q12263	1142 aa		3.86	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	CLB5	P30283	435 aa		3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MRP7	P12687	371 aa		3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	YGL081W	P53156	320 aa		3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	YNL050C	P53952	270 aa		3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MHP1	P43638	1398 aa		3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MAC1	P35192	417 aa		3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	KIN4	Q01919	800 aa		3.85	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	YLR278C	Q05854	1341 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	TRK1	P12685	1235 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	YCK3	P39962	524 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	NIT1	P40447	199 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	YIL089W	P40500	205 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PIP2	P52960	996 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PUS6	P53294	404 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	PSF3	Q12146	194 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	MAM3	Q12296	706 aa		3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
STE6	YKL209C	SIR4	P11978	1358 aa		3.84	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YML133C	Q03099	1374 aa		3.84	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.84	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YBL028C	P38202	106 aa		3.84	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	THI3	Q07471	609 aa		3.84	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	NUP192	P47054	1683 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	RAD2	P07276	1031 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SWC3	P31376	625 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	CST6	P40535	587 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	FCP1	Q03254	732 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	RKM4	Q12504	494 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	CSR2	Q12734	1121 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YPR117W	Q06116	2489 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	PBY1	P38254	753 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	HUL5	P53119	910 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	VPS13	Q07878	3144 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	COQ4	O13525	335 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	MGM1	P32266	881 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YGR117C	P53270	476 aa		3.83	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	FBP1	P09201	348 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.82	□□□□□ -1.8	RIP-Chip
STE6	YKL209C	PNT1	P38969	423 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	VAB2	P40003	282 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	RBA50	Q04418	439 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	RLF2	Q12495	606 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	PRD1	P25375	712 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	KRE2	P27809	442 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	YAF9	P53930	226 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	SRF1	Q12516	437 aa		3.82	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	GCN2	P15442	1659 aa		3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
STE6	YKL209C	NCS6	P53088	359 aa		3.81	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 97.1 ms