Protein–RNA interactions for Protein: P47054

NUP192, Nucleoporin NUP192, yeastyeast

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP192P47054 YML009W-BYML009W-B 477 nt28.81■■■□□ 2.2
NUP192P47054 NSR1YGR159C 1245 nt27.77■■■□□ 2.04
NUP192P47054 NOP1YDL014W 984 nt27.57■■■□□ 2
NUP192P47054 YKL036CYKL036C 393 nt26.19■■□□□ 1.78
NUP192P47054 MDJ1YFL016C 1536 nt24.9■■□□□ 1.58
NUP192P47054 YJL027CYJL027C 417 nt24.52■■□□□ 1.52
NUP192P47054 Q0297Q0297 156 nt24.47■■□□□ 1.51
NUP192P47054 SRX1YKL086W 384 nt24.43■■□□□ 1.5
NUP192P47054 SCS3YGL126W 1143 nt24.32■■□□□ 1.48
NUP192P47054 YCR051WYCR051W 669 nt23.28■■□□□ 1.32
NUP192P47054 YOL085CYOL085C 342 nt22.54■■□□□ 1.2
NUP192P47054 PKP1YIL042C 1185 nt22.49■■□□□ 1.19
NUP192P47054 DBP2YNL112W 1641 nt22.09■■□□□ 1.13
NUP192P47054 TRN1tP(UGG)A 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 SUF9tP(UGG)F 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 SUF8tP(UGG)H 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 SUF7tP(UGG)M 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 SUF11tP(UGG)O2 72 nt21.98■■□□□ 1.11
NUP192P47054 RPP1BYDL130W 321 nt21.95■■□□□ 1.1
NUP192P47054 SCJ1YMR214W 1134 nt21.77■■□□□ 1.08
NUP192P47054 CCC1YLR220W 969 nt21.73■■□□□ 1.07
NUP192P47054 ATS1YAL020C 1002 nt21.59■■□□□ 1.05
NUP192P47054 PET122YER153C 765 nt21.22■□□□□ 0.99
NUP192P47054 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt20.83■□□□□ 0.92
NUP192P47054 SCR1SCR1 522 nt20.83■□□□□ 0.92
NUP192P47054 YBR190WYBR190W 312 nt20.67■□□□□ 0.9
NUP192P47054 RVS167YDR388W 1449 nt20.53■□□□□ 0.88
NUP192P47054 RRN5YLR141W 1092 nt20.45■□□□□ 0.86
NUP192P47054 RTC3YHR087W 336 nt20.32■□□□□ 0.84
NUP192P47054 RSB1YOR049C 1065 nt20.3■□□□□ 0.84
NUP192P47054 YER088W-BYER088W-B 147 nt20.07■□□□□ 0.8
NUP192P47054 SHR5YOL110W 714 nt20.01■□□□□ 0.79
NUP192P47054 YDJ1YNL064C 1230 nt19.94■□□□□ 0.78
NUP192P47054 PST2YDR032C 597 nt19.85■□□□□ 0.77
NUP192P47054 GAR1YHR089C 618 nt19.66■□□□□ 0.74
NUP192P47054 DEP1YAL013W 1218 nt19.62■□□□□ 0.73
NUP192P47054 YKL097CYKL097C 411 nt19.57■□□□□ 0.72
NUP192P47054 URN1YPR152C 1398 nt19.38■□□□□ 0.69
NUP192P47054 SHU1YHL006C 453 nt19.18■□□□□ 0.66
NUP192P47054 YNL208WYNL208W 600 nt18.95■□□□□ 0.62
NUP192P47054 TIR1YER011W 765 nt18.92■□□□□ 0.62
NUP192P47054 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt18.91■□□□□ 0.62
NUP192P47054 RPN10YHR200W 807 nt18.85■□□□□ 0.61
NUP192P47054 SRB2YHR041C 633 nt18.84■□□□□ 0.61
NUP192P47054 SAH1YER043C 1350 nt18.82■□□□□ 0.6
NUP192P47054 OPI9YLR338W 858 nt18.82■□□□□ 0.6
NUP192P47054 YOR139CYOR139C 393 nt18.79■□□□□ 0.6
NUP192P47054 SSA1YAL005C 1929 nt18.74■□□□□ 0.59
NUP192P47054 PUT4YOR348C 1884 nt18.66■□□□□ 0.58
NUP192P47054 ARE1YCR048W 1833 nt18.55■□□□□ 0.56
NUP192P47054 YJR120WYJR120W 351 nt18.54■□□□□ 0.56
NUP192P47054 MNP1YGL068W 585 nt18.52■□□□□ 0.56
NUP192P47054 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.47■□□□□ 0.55
NUP192P47054 NPL3YDR432W 1245 nt18.42■□□□□ 0.54
NUP192P47054 YJR018WYJR018W 363 nt18.38■□□□□ 0.53
NUP192P47054 WWM1YFL010C 636 nt18.36■□□□□ 0.53
NUP192P47054 HOM6YJR139C 1080 nt18.22■□□□□ 0.51
NUP192P47054 PUN1YLR414C 792 nt18.2■□□□□ 0.5
NUP192P47054 POA1YBR022W 534 nt18.15■□□□□ 0.5
NUP192P47054 YGR021WYGR021W 873 nt18.09■□□□□ 0.49
NUP192P47054 YOL037CYOL037C 354 nt18.09■□□□□ 0.49
NUP192P47054 SSA3YBL075C 1950 nt18.01■□□□□ 0.47
NUP192P47054 PTC2YER089C 1395 nt18.01■□□□□ 0.47
NUP192P47054 BUD23YCR047C 828 nt17.97■□□□□ 0.47
NUP192P47054 RPP2BYDR382W 333 nt17.96■□□□□ 0.47
NUP192P47054 RKM5YLR137W 1104 nt17.9■□□□□ 0.46
NUP192P47054 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt17.82■□□□□ 0.44
NUP192P47054 FIS1YIL065C 468 nt17.82■□□□□ 0.44
NUP192P47054 BDH2YAL061W 1254 nt17.81■□□□□ 0.44
NUP192P47054 BSC6YOL137W 1494 nt17.76■□□□□ 0.43
NUP192P47054 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt17.71■□□□□ 0.43
NUP192P47054 IMT4tM(CAU)E 72 nt17.71■□□□□ 0.43
NUP192P47054 IMT3tM(CAU)J3 72 nt17.71■□□□□ 0.43
NUP192P47054 IMT1tM(CAU)O1 72 nt17.71■□□□□ 0.43
NUP192P47054 IMT2tM(CAU)P 72 nt17.71■□□□□ 0.43
NUP192P47054 NAB2YGL122C 1578 nt17.66■□□□□ 0.42
NUP192P47054 YBL100CYBL100C 315 nt17.64■□□□□ 0.42
NUP192P47054 FPR4YLR449W 1179 nt17.61■□□□□ 0.41
NUP192P47054 PHO4YFR034C 939 nt17.6■□□□□ 0.41
NUP192P47054 PUS2YGL063W 1113 nt17.55■□□□□ 0.4
NUP192P47054 DAL1YIR027C 1383 nt17.5■□□□□ 0.39
NUP192P47054 YLR281CYLR281C 468 nt17.48■□□□□ 0.39
NUP192P47054 MOT3YMR070W 1473 nt17.45■□□□□ 0.38
NUP192P47054 WHI5YOR083W 888 nt17.43■□□□□ 0.38
NUP192P47054 YLR236CYLR236C 324 nt17.39■□□□□ 0.37
NUP192P47054 INM2YDR287W 879 nt17.37■□□□□ 0.37
NUP192P47054 LSM3YLR438C-A 270 nt17.35■□□□□ 0.37
NUP192P47054 FUN26YAL022C 1554 nt17.33■□□□□ 0.36
NUP192P47054 YPR011CYPR011C 981 nt17.28■□□□□ 0.36
NUP192P47054 FMP45YDL222C 930 nt17.26■□□□□ 0.35
NUP192P47054 TRM9YML014W 840 nt17.23■□□□□ 0.35
NUP192P47054 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.18■□□□□ 0.34
NUP192P47054 CCT6YDR188W 1641 nt17.15■□□□□ 0.34
NUP192P47054 DSK2YMR276W 1122 nt17.14■□□□□ 0.33
NUP192P47054 LPX1YOR084W 1164 nt17.02■□□□□ 0.32
NUP192P47054 YDR095CYDR095C 411 nt17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms