RNA–Protein interactions for RNA: YHR199C-A

NBL1, Transcript of Subunit of the conserved chromosomal passenger complex (CPC), yeast

Gene NBL1, Length 222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NBL1	YHR199C-A	CAT8	P39113	1433 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	PDR11	P40550	1411 aa		0.81	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	0.81	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY1B-H	O13535	1793 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY1B-PR2	P0C2J0	1756 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	POL1	P13382	1468 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	PDR12	Q02785	1511 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	MSN4	P33749	630 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YUH1	P35127	236 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	ECM4	P36156	370 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	CAT5	P41735	233 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TOS8	P53147	276 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	HOP2	P53187	214 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YMD8	Q03697	442 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	KRE28	Q04431	385 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	PAM18	Q07914	168 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	GRE1	Q08969	168 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YLR126C	Q12288	251 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	MED4	Q12343	284 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	DOP1	Q03921	1698 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	FLO9	P39712	1322 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-C	P25384	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YIL177C	P40434	1758 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YJL225C	P40889	1758 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-B	Q12491	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	BCK1	Q01389	1478 aa		0.8	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	IML1	P47170	1584 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	SPO14	P36126	1683 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	DNF3	Q12674	1656 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	ERD2	P18414	219 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RIB1	P38066	345 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YBR063C	P38083	404 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	CUE1	P38428	203 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RPA43	P46669	326 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	NUP84	P52891	726 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RRN5	Q02983	363 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YLR173W	Q06247	608 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YOR029W	Q12243	111 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TUS1	Q06412	1307 aa		0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	MLP2	P40457	1679 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	CDC8	P00572	216 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	NTG1	P31378	399 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	SRB4	P32569	687 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	YKL075C	P36083	450 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	ECM33	P38248	429 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	PGD1	P40356	397 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	TIR3	P40552	269 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	HOC1	P47124	396 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	GIM3	P53900	129 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	SRB8	P25648	1427 aa		0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
NBL1	YHR199C-A	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MRPS28	P21771	286 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MEI4	P29467	408 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	SIP3	P38717	1229 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	ICE2	P40499	491 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MCM22	P47167	239 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	AIF1	P52923	378 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	FUS2	Q05670	677 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	MSA1	Q08471	629 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RAD9	P14737	1309 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	RSF2	P46974	1380 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	YSP2	Q06681	1438 aa		0.77	□□□□□ -2.29
NBL1	YHR199C-A	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29

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