Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 NSR1YGR159C 1245 nt18.65■□□□□ 0.58
BRX1Q08235 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.64■□□□□ 0.57
BRX1Q08235 NOP1YDL014W 984 nt18.1■□□□□ 0.49
BRX1Q08235 MDJ1YFL016C 1536 nt16.65■□□□□ 0.26
BRX1Q08235 YKL036CYKL036C 393 nt16.57■□□□□ 0.24
BRX1Q08235 SRX1YKL086W 384 nt15.8■□□□□ 0.12
BRX1Q08235 Q0297Q0297 156 nt15.79■□□□□ 0.12
BRX1Q08235 YJL027CYJL027C 417 nt15.44■□□□□ 0.06
BRX1Q08235 SCS3YGL126W 1143 nt14.99□□□□□ -0.01
BRX1Q08235 YCR051WYCR051W 669 nt14.98□□□□□ -0.01
BRX1Q08235 DBP2YNL112W 1641 nt14.68□□□□□ -0.06
BRX1Q08235 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 YOL085CYOL085C 342 nt14.35□□□□□ -0.11
BRX1Q08235 YBR190WYBR190W 312 nt14.25□□□□□ -0.13
BRX1Q08235 CCC1YLR220W 969 nt14.21□□□□□ -0.13
BRX1Q08235 RPP1BYDL130W 321 nt14.17□□□□□ -0.14
BRX1Q08235 PKP1YIL042C 1185 nt14.14□□□□□ -0.15
BRX1Q08235 SSA3YBL075C 1950 nt14.07□□□□□ -0.16
BRX1Q08235 RTC3YHR087W 336 nt13.93□□□□□ -0.18
BRX1Q08235 RVS167YDR388W 1449 nt13.81□□□□□ -0.2
BRX1Q08235 SCJ1YMR214W 1134 nt13.67□□□□□ -0.22
BRX1Q08235 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.54□□□□□ -0.24
BRX1Q08235 PET122YER153C 765 nt13.53□□□□□ -0.24
BRX1Q08235 ATS1YAL020C 1002 nt13.39□□□□□ -0.27
BRX1Q08235 SCR1SCR1 522 nt13.38□□□□□ -0.27
BRX1Q08235 SHR5YOL110W 714 nt13.28□□□□□ -0.28
BRX1Q08235 RRN5YLR141W 1092 nt13.15□□□□□ -0.3
BRX1Q08235 YDJ1YNL064C 1230 nt13.11□□□□□ -0.31
BRX1Q08235 PUT4YOR348C 1884 nt13.02□□□□□ -0.33
BRX1Q08235 URN1YPR152C 1398 nt12.98□□□□□ -0.33
BRX1Q08235 DEP1YAL013W 1218 nt12.94□□□□□ -0.34
BRX1Q08235 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.89□□□□□ -0.35
BRX1Q08235 RSB1YOR049C 1065 nt12.84□□□□□ -0.35
BRX1Q08235 GAR1YHR089C 618 nt12.83□□□□□ -0.36
BRX1Q08235 OPI9YLR338W 858 nt12.83□□□□□ -0.36
BRX1Q08235 RPN10YHR200W 807 nt12.78□□□□□ -0.36
BRX1Q08235 SAH1YER043C 1350 nt12.77□□□□□ -0.37
BRX1Q08235 ARE1YCR048W 1833 nt12.74□□□□□ -0.37
BRX1Q08235 YNL208WYNL208W 600 nt12.74□□□□□ -0.37
BRX1Q08235 POA1YBR022W 534 nt12.61□□□□□ -0.39
BRX1Q08235 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.58□□□□□ -0.4
BRX1Q08235 PUN1YLR414C 792 nt12.46□□□□□ -0.41
BRX1Q08235 PST2YDR032C 597 nt12.42□□□□□ -0.42
BRX1Q08235 TIR1YER011W 765 nt12.4□□□□□ -0.42
BRX1Q08235 YJR018WYJR018W 363 nt12.39□□□□□ -0.43
BRX1Q08235 BSC6YOL137W 1494 nt12.35□□□□□ -0.43
BRX1Q08235 PTC2YER089C 1395 nt12.32□□□□□ -0.44
BRX1Q08235 BUD23YCR047C 828 nt12.29□□□□□ -0.44
BRX1Q08235 SSA1YAL005C 1929 nt12.27□□□□□ -0.44
BRX1Q08235 FPS1YLL043W 2010 nt12.27□□□□□ -0.45
BRX1Q08235 NVJ2YPR091C 2313 nt12.2□□□□□ -0.46
BRX1Q08235 NAB2YGL122C 1578 nt12.18□□□□□ -0.46
BRX1Q08235 PAC11YDR488C 1602 nt12.15□□□□□ -0.46
BRX1Q08235 YJR120WYJR120W 351 nt12.14□□□□□ -0.47
BRX1Q08235 RPP2BYDR382W 333 nt12.12□□□□□ -0.47
BRX1Q08235 SRB2YHR041C 633 nt12.02□□□□□ -0.49
BRX1Q08235 DAL1YIR027C 1383 nt12□□□□□ -0.49
BRX1Q08235 INM2YDR287W 879 nt11.98□□□□□ -0.49
BRX1Q08235 FIS1YIL065C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
BRX1Q08235 FPR4YLR449W 1179 nt11.97□□□□□ -0.49
BRX1Q08235 SHU1YHL006C 453 nt11.94□□□□□ -0.5
BRX1Q08235 PHO4YFR034C 939 nt11.87□□□□□ -0.51
BRX1Q08235 YKL097CYKL097C 411 nt11.87□□□□□ -0.51
BRX1Q08235 BDH2YAL061W 1254 nt11.84□□□□□ -0.51
BRX1Q08235 SPT5YML010W 3192 nt11.83□□□□□ -0.51
BRX1Q08235 WWM1YFL010C 636 nt11.83□□□□□ -0.52
BRX1Q08235 YBL100CYBL100C 315 nt11.82□□□□□ -0.52
BRX1Q08235 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.79□□□□□ -0.52
BRX1Q08235 YGR021WYGR021W 873 nt11.74□□□□□ -0.53
BRX1Q08235 YPS1YLR120C 1710 nt11.69□□□□□ -0.54
BRX1Q08235 FUN26YAL022C 1554 nt11.68□□□□□ -0.54
BRX1Q08235 HOM6YJR139C 1080 nt11.68□□□□□ -0.54
BRX1Q08235 LSM3YLR438C-A 270 nt11.68□□□□□ -0.54
BRX1Q08235 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.66□□□□□ -0.54
BRX1Q08235 TRM9YML014W 840 nt11.66□□□□□ -0.54
BRX1Q08235 MEP2YNL142W 1500 nt11.61□□□□□ -0.55
BRX1Q08235 YDR095CYDR095C 411 nt11.6□□□□□ -0.55
BRX1Q08235 MNP1YGL068W 585 nt11.59□□□□□ -0.55
BRX1Q08235 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.57□□□□□ -0.56
BRX1Q08235 SSA4YER103W 1929 nt11.56□□□□□ -0.56
BRX1Q08235 ALF1YNL148C 765 nt11.55□□□□□ -0.56
BRX1Q08235 CCT6YDR188W 1641 nt11.53□□□□□ -0.56
BRX1Q08235 RKM5YLR137W 1104 nt11.51□□□□□ -0.57
BRX1Q08235 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.45□□□□□ -0.58
BRX1Q08235 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.45□□□□□ -0.58
BRX1Q08235 DCW1YKL046C 1350 nt11.41□□□□□ -0.58
BRX1Q08235 YOR139CYOR139C 393 nt11.4□□□□□ -0.58
BRX1Q08235 RPP2AYOL039W 321 nt11.39□□□□□ -0.59
BRX1Q08235 SIS1YNL007C 1059 nt11.37□□□□□ -0.59
BRX1Q08235 YOL037CYOL037C 354 nt11.37□□□□□ -0.59
BRX1Q08235 NPL3YDR432W 1245 nt11.35□□□□□ -0.59
BRX1Q08235 PTP1YDL230W 1008 nt11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.8 ms