Protein–RNA interactions for Protein: Q12674

DNF3, Probable phospholipid-transporting ATPase DNF3, yeastyeast

Predictions only

Length 1,656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF3Q12674 YML009W-BYML009W-B 477 nt29.89■■■□□ 2.38
DNF3Q12674 NOP1YDL014W 984 nt28.9■■■□□ 2.22
DNF3Q12674 NSR1YGR159C 1245 nt28.34■■■□□ 2.13
DNF3Q12674 YKL036CYKL036C 393 nt27.85■■■□□ 2.05
DNF3Q12674 YJL027CYJL027C 417 nt26.15■■□□□ 1.78
DNF3Q12674 SCS3YGL126W 1143 nt26.03■■□□□ 1.76
DNF3Q12674 Q0297Q0297 156 nt25.78■■□□□ 1.72
DNF3Q12674 SRX1YKL086W 384 nt25.56■■□□□ 1.68
DNF3Q12674 MDJ1YFL016C 1536 nt24.8■■□□□ 1.56
DNF3Q12674 YCR051WYCR051W 669 nt24.37■■□□□ 1.49
DNF3Q12674 YOL085CYOL085C 342 nt23.95■■□□□ 1.42
DNF3Q12674 SCJ1YMR214W 1134 nt23.87■■□□□ 1.41
DNF3Q12674 PKP1YIL042C 1185 nt23.77■■□□□ 1.4
DNF3Q12674 ATS1YAL020C 1002 nt23.26■■□□□ 1.31
DNF3Q12674 RPP1BYDL130W 321 nt23.13■■□□□ 1.29
DNF3Q12674 TRN1tP(UGG)A 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 SUF9tP(UGG)F 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 SUF8tP(UGG)H 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 SUF7tP(UGG)M 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 SUF11tP(UGG)O2 72 nt22.66■■□□□ 1.22
DNF3Q12674 CCC1YLR220W 969 nt22.33■■□□□ 1.17
DNF3Q12674 PET122YER153C 765 nt22.23■■□□□ 1.15
DNF3Q12674 DBP2YNL112W 1641 nt22.18■■□□□ 1.14
DNF3Q12674 SCR1SCR1 522 nt22.04■■□□□ 1.12
DNF3Q12674 RTC3YHR087W 336 nt21.95■■□□□ 1.1
DNF3Q12674 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt21.62■■□□□ 1.05
DNF3Q12674 RSB1YOR049C 1065 nt21.5■■□□□ 1.03
DNF3Q12674 RRN5YLR141W 1092 nt21.45■■□□□ 1.02
DNF3Q12674 PST2YDR032C 597 nt21.34■■□□□ 1.01
DNF3Q12674 YKL097CYKL097C 411 nt21.21■□□□□ 0.99
DNF3Q12674 YER088W-BYER088W-B 147 nt21.08■□□□□ 0.96
DNF3Q12674 RVS167YDR388W 1449 nt20.93■□□□□ 0.94
DNF3Q12674 YDJ1YNL064C 1230 nt20.75■□□□□ 0.91
DNF3Q12674 YBR190WYBR190W 312 nt20.5■□□□□ 0.87
DNF3Q12674 SHR5YOL110W 714 nt20.49■□□□□ 0.87
DNF3Q12674 SHU1YHL006C 453 nt20.48■□□□□ 0.87
DNF3Q12674 GAR1YHR089C 618 nt20.3■□□□□ 0.84
DNF3Q12674 YOR139CYOR139C 393 nt20.26■□□□□ 0.83
DNF3Q12674 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt19.97■□□□□ 0.79
DNF3Q12674 NPL3YDR432W 1245 nt19.81■□□□□ 0.76
DNF3Q12674 DEP1YAL013W 1218 nt19.78■□□□□ 0.76
DNF3Q12674 TIR1YER011W 765 nt19.54■□□□□ 0.72
DNF3Q12674 MNP1YGL068W 585 nt19.46■□□□□ 0.71
DNF3Q12674 URN1YPR152C 1398 nt19.43■□□□□ 0.7
DNF3Q12674 SRB2YHR041C 633 nt19.28■□□□□ 0.68
DNF3Q12674 YNL208WYNL208W 600 nt19.27■□□□□ 0.67
DNF3Q12674 YOL037CYOL037C 354 nt19.25■□□□□ 0.67
DNF3Q12674 RPN10YHR200W 807 nt19.21■□□□□ 0.67
DNF3Q12674 SSA1YAL005C 1929 nt19.16■□□□□ 0.66
DNF3Q12674 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt19.12■□□□□ 0.65
DNF3Q12674 IMT4tM(CAU)E 72 nt19.12■□□□□ 0.65
DNF3Q12674 IMT3tM(CAU)J3 72 nt19.12■□□□□ 0.65
DNF3Q12674 IMT1tM(CAU)O1 72 nt19.12■□□□□ 0.65
DNF3Q12674 IMT2tM(CAU)P 72 nt19.12■□□□□ 0.65
DNF3Q12674 HOM6YJR139C 1080 nt19.11■□□□□ 0.65
DNF3Q12674 YGR021WYGR021W 873 nt19.03■□□□□ 0.64
DNF3Q12674 WWM1YFL010C 636 nt19■□□□□ 0.63
DNF3Q12674 MOT3YMR070W 1473 nt18.99■□□□□ 0.63
DNF3Q12674 BSC6YOL137W 1494 nt18.97■□□□□ 0.63
DNF3Q12674 RKM5YLR137W 1104 nt18.79■□□□□ 0.6
DNF3Q12674 OPI9YLR338W 858 nt18.77■□□□□ 0.6
DNF3Q12674 PUS2YGL063W 1113 nt18.76■□□□□ 0.59
DNF3Q12674 YJR120WYJR120W 351 nt18.68■□□□□ 0.58
DNF3Q12674 YLR281CYLR281C 468 nt18.57■□□□□ 0.56
DNF3Q12674 SAH1YER043C 1350 nt18.56■□□□□ 0.56
DNF3Q12674 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt18.54■□□□□ 0.56
DNF3Q12674 YJR018WYJR018W 363 nt18.48■□□□□ 0.55
DNF3Q12674 FMP45YDL222C 930 nt18.44■□□□□ 0.54
DNF3Q12674 WHI5YOR083W 888 nt18.42■□□□□ 0.54
DNF3Q12674 SSA3YBL075C 1950 nt18.38■□□□□ 0.53
DNF3Q12674 YLR236CYLR236C 324 nt18.38■□□□□ 0.53
DNF3Q12674 MRPL8YJL063C 717 nt18.37■□□□□ 0.53
DNF3Q12674 UBX6YJL048C 1191 nt18.31■□□□□ 0.52
DNF3Q12674 RPP2BYDR382W 333 nt18.3■□□□□ 0.52
DNF3Q12674 YPR011CYPR011C 981 nt18.23■□□□□ 0.51
DNF3Q12674 PUN1YLR414C 792 nt18.22■□□□□ 0.51
DNF3Q12674 BDH2YAL061W 1254 nt18.19■□□□□ 0.5
DNF3Q12674 DSK2YMR276W 1122 nt18.19■□□□□ 0.5
DNF3Q12674 YCH1YGR203W 447 nt18.12■□□□□ 0.49
DNF3Q12674 ADO1YJR105W 1023 nt18.08■□□□□ 0.48
DNF3Q12674 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt18.06■□□□□ 0.48
DNF3Q12674 YEL076CYEL076C 651 nt18.06■□□□□ 0.48
DNF3Q12674 YLR464WYLR464W 651 nt18.06■□□□□ 0.48
DNF3Q12674 ARE1YCR048W 1833 nt18.05■□□□□ 0.48
DNF3Q12674 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.04■□□□□ 0.48
DNF3Q12674 RTG1YOL067C 534 nt17.99■□□□□ 0.47
DNF3Q12674 PUT4YOR348C 1884 nt17.97■□□□□ 0.47
DNF3Q12674 LPX1YOR084W 1164 nt17.94■□□□□ 0.46
DNF3Q12674 IMP2'YIL154C 1041 nt17.93■□□□□ 0.46
DNF3Q12674 SPP1YPL138C 1062 nt17.92■□□□□ 0.46
DNF3Q12674 PTC2YER089C 1395 nt17.84■□□□□ 0.45
DNF3Q12674 LSM3YLR438C-A 270 nt17.83■□□□□ 0.45
DNF3Q12674 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt17.83■□□□□ 0.44
DNF3Q12674 YBL100CYBL100C 315 nt17.79■□□□□ 0.44
DNF3Q12674 ERV46YAL042W 1248 nt17.71■□□□□ 0.43
DNF3Q12674 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt17.71■□□□□ 0.42
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