Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 NSR1YGR159C 1245 nt15.93■□□□□ 0.14
PGD1P40356 YML009W-BYML009W-B 477 nt15.25■□□□□ 0.03
PGD1P40356 MDJ1YFL016C 1536 nt14.88□□□□□ -0.03
PGD1P40356 NOP1YDL014W 984 nt14.59□□□□□ -0.07
PGD1P40356 YJL027CYJL027C 417 nt13.7□□□□□ -0.22
PGD1P40356 SSA3YBL075C 1950 nt13.67□□□□□ -0.22
PGD1P40356 YKL036CYKL036C 393 nt13.11□□□□□ -0.31
PGD1P40356 YBR190WYBR190W 312 nt12.97□□□□□ -0.33
PGD1P40356 DBP2YNL112W 1641 nt12.82□□□□□ -0.36
PGD1P40356 SRX1YKL086W 384 nt12.78□□□□□ -0.36
PGD1P40356 Q0297Q0297 156 nt12.67□□□□□ -0.38
PGD1P40356 RTC3YHR087W 336 nt12.61□□□□□ -0.39
PGD1P40356 PUT4YOR348C 1884 nt12.38□□□□□ -0.43
PGD1P40356 YCR051WYCR051W 669 nt12.07□□□□□ -0.48
PGD1P40356 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 RVS167YDR388W 1449 nt11.94□□□□□ -0.5
PGD1P40356 SSA4YER103W 1929 nt11.93□□□□□ -0.5
PGD1P40356 POA1YBR022W 534 nt11.92□□□□□ -0.5
PGD1P40356 ARE1YCR048W 1833 nt11.89□□□□□ -0.51
PGD1P40356 SPT5YML010W 3192 nt11.89□□□□□ -0.51
PGD1P40356 BSC6YOL137W 1494 nt11.84□□□□□ -0.51
PGD1P40356 CCC1YLR220W 969 nt11.8□□□□□ -0.52
PGD1P40356 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.76□□□□□ -0.53
PGD1P40356 SCS3YGL126W 1143 nt11.74□□□□□ -0.53
PGD1P40356 SCJ1YMR214W 1134 nt11.62□□□□□ -0.55
PGD1P40356 SAH1YER043C 1350 nt11.62□□□□□ -0.55
PGD1P40356 BDF1YLR399C 2061 nt11.55□□□□□ -0.56
PGD1P40356 OPI9YLR338W 858 nt11.51□□□□□ -0.57
PGD1P40356 URN1YPR152C 1398 nt11.49□□□□□ -0.57
PGD1P40356 PAC11YDR488C 1602 nt11.43□□□□□ -0.58
PGD1P40356 BUD23YCR047C 828 nt11.42□□□□□ -0.58
PGD1P40356 TAT1YBR069C 1860 nt11.38□□□□□ -0.59
PGD1P40356 YOL085CYOL085C 342 nt11.38□□□□□ -0.59
PGD1P40356 RPP1BYDL130W 321 nt11.37□□□□□ -0.59
PGD1P40356 SHR5YOL110W 714 nt11.3□□□□□ -0.6
PGD1P40356 PKP1YIL042C 1185 nt11.25□□□□□ -0.61
PGD1P40356 DEP1YAL013W 1218 nt11.22□□□□□ -0.61
PGD1P40356 MEP2YNL142W 1500 nt11.22□□□□□ -0.61
PGD1P40356 PUN1YLR414C 792 nt11.18□□□□□ -0.62
PGD1P40356 RPN10YHR200W 807 nt11.17□□□□□ -0.62
PGD1P40356 PTC2YER089C 1395 nt11.16□□□□□ -0.62
PGD1P40356 NAB2YGL122C 1578 nt11.16□□□□□ -0.62
PGD1P40356 NVJ2YPR091C 2313 nt11.13□□□□□ -0.63
PGD1P40356 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt11.03□□□□□ -0.64
PGD1P40356 YNL208WYNL208W 600 nt11□□□□□ -0.65
PGD1P40356 DCW1YKL046C 1350 nt10.98□□□□□ -0.65
PGD1P40356 YBR220CYBR220C 1683 nt10.92□□□□□ -0.66
PGD1P40356 PET122YER153C 765 nt10.92□□□□□ -0.66
PGD1P40356 YJR018WYJR018W 363 nt10.92□□□□□ -0.66
PGD1P40356 YMR090WYMR090W 684 nt10.9□□□□□ -0.66
PGD1P40356 FIS1YIL065C 468 nt10.88□□□□□ -0.67
PGD1P40356 EMI2YDR516C 1503 nt10.84□□□□□ -0.67
PGD1P40356 DAL1YIR027C 1383 nt10.84□□□□□ -0.67
PGD1P40356 YPS1YLR120C 1710 nt10.82□□□□□ -0.68
PGD1P40356 FPR4YLR449W 1179 nt10.78□□□□□ -0.68
PGD1P40356 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.77□□□□□ -0.69
PGD1P40356 PCH2YBR186W 1695 nt10.76□□□□□ -0.69
PGD1P40356 PHO4YFR034C 939 nt10.73□□□□□ -0.69
PGD1P40356 SDH1YKL148C 1923 nt10.72□□□□□ -0.69
PGD1P40356 GUT2YIL155C 1950 nt10.72□□□□□ -0.69
PGD1P40356 SEC11YIR022W 504 nt10.71□□□□□ -0.69
PGD1P40356 YDJ1YNL064C 1230 nt10.7□□□□□ -0.7
PGD1P40356 YDL221WYDL221W 552 nt10.69□□□□□ -0.7
PGD1P40356 INM2YDR287W 879 nt10.66□□□□□ -0.7
PGD1P40356 SCR1SCR1 522 nt10.65□□□□□ -0.7
PGD1P40356 FPS1YLL043W 2010 nt10.64□□□□□ -0.71
PGD1P40356 YDR095CYDR095C 411 nt10.63□□□□□ -0.71
PGD1P40356 SSA1YAL005C 1929 nt10.58□□□□□ -0.72
PGD1P40356 GAR1YHR089C 618 nt10.56□□□□□ -0.72
PGD1P40356 YJL225CYJL225C 5277 nt10.56□□□□□ -0.72
PGD1P40356 RRN5YLR141W 1092 nt10.55□□□□□ -0.72
PGD1P40356 SCC4YER147C 1875 nt10.53□□□□□ -0.72
PGD1P40356 YJR120WYJR120W 351 nt10.52□□□□□ -0.73
PGD1P40356 CAC2YML102W 1407 nt10.51□□□□□ -0.73
PGD1P40356 RPP2BYDR382W 333 nt10.5□□□□□ -0.73
PGD1P40356 PIB2YGL023C 1908 nt10.49□□□□□ -0.73
PGD1P40356 PTP1YDL230W 1008 nt10.45□□□□□ -0.74
PGD1P40356 RPP2AYOL039W 321 nt10.44□□□□□ -0.74
PGD1P40356 RTF1YGL244W 1677 nt10.41□□□□□ -0.74
PGD1P40356 YBL100CYBL100C 315 nt10.4□□□□□ -0.74
PGD1P40356 YSC84YHR016C 1407 nt10.37□□□□□ -0.75
PGD1P40356 ATS1YAL020C 1002 nt10.37□□□□□ -0.75
PGD1P40356 IRC15YPL017C 1500 nt10.37□□□□□ -0.75
PGD1P40356 YER088W-BYER088W-B 147 nt10.35□□□□□ -0.75
PGD1P40356 BOR1YNL275W 1731 nt10.32□□□□□ -0.76
PGD1P40356 GIS3YLR094C 1509 nt10.32□□□□□ -0.76
PGD1P40356 UME6YDR207C 2511 nt10.31□□□□□ -0.76
PGD1P40356 BOP3YNL042W 1191 nt10.3□□□□□ -0.76
PGD1P40356 ALF1YNL148C 765 nt10.3□□□□□ -0.76
PGD1P40356 YHL050CYHL050C 2094 nt10.27□□□□□ -0.76
PGD1P40356 TIR1YER011W 765 nt10.25□□□□□ -0.77
PGD1P40356 FUN26YAL022C 1554 nt10.24□□□□□ -0.77
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