Protein–RNA interactions for Protein: P35127

YUH1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase YUH1, yeastyeast

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YUH1P35127 NSR1YGR159C 1245 nt17.1■□□□□ 0.33
YUH1P35127 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.94■□□□□ 0.3
YUH1P35127 NOP1YDL014W 984 nt16.43■□□□□ 0.22
YUH1P35127 MDJ1YFL016C 1536 nt15.37■□□□□ 0.05
YUH1P35127 YKL036CYKL036C 393 nt14.87□□□□□ -0.03
YUH1P35127 SRX1YKL086W 384 nt14.3□□□□□ -0.12
YUH1P35127 YJL027CYJL027C 417 nt14.24□□□□□ -0.13
YUH1P35127 Q0297Q0297 156 nt14.23□□□□□ -0.13
YUH1P35127 YCR051WYCR051W 669 nt13.58□□□□□ -0.24
YUH1P35127 DBP2YNL112W 1641 nt13.46□□□□□ -0.26
YUH1P35127 SCS3YGL126W 1143 nt13.33□□□□□ -0.28
YUH1P35127 YBR190WYBR190W 312 nt13.23□□□□□ -0.29
YUH1P35127 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.05□□□□□ -0.32
YUH1P35127 CCC1YLR220W 969 nt12.98□□□□□ -0.33
YUH1P35127 RTC3YHR087W 336 nt12.96□□□□□ -0.33
YUH1P35127 YOL085CYOL085C 342 nt12.86□□□□□ -0.35
YUH1P35127 RPP1BYDL130W 321 nt12.78□□□□□ -0.36
YUH1P35127 RVS167YDR388W 1449 nt12.72□□□□□ -0.37
YUH1P35127 PKP1YIL042C 1185 nt12.69□□□□□ -0.38
YUH1P35127 SCJ1YMR214W 1134 nt12.46□□□□□ -0.41
YUH1P35127 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.29□□□□□ -0.44
YUH1P35127 SSA3YBL075C 1950 nt12.24□□□□□ -0.45
YUH1P35127 PET122YER153C 765 nt12.21□□□□□ -0.45
YUH1P35127 SHR5YOL110W 714 nt12.16□□□□□ -0.46
YUH1P35127 PUT4YOR348C 1884 nt12.14□□□□□ -0.47
YUH1P35127 SCR1SCR1 522 nt12.09□□□□□ -0.47
YUH1P35127 Q0182Q0182 405 nt12.08□□□□□ -0.48
YUH1P35127 URN1YPR152C 1398 nt11.99□□□□□ -0.49
YUH1P35127 YDJ1YNL064C 1230 nt11.91□□□□□ -0.5
YUH1P35127 DEP1YAL013W 1218 nt11.9□□□□□ -0.5
YUH1P35127 ATS1YAL020C 1002 nt11.88□□□□□ -0.51
YUH1P35127 RRN5YLR141W 1092 nt11.86□□□□□ -0.51
YUH1P35127 OPI9YLR338W 858 nt11.86□□□□□ -0.51
YUH1P35127 SSA1YAL005C 1929 nt11.85□□□□□ -0.51
YUH1P35127 ARE1YCR048W 1833 nt11.84□□□□□ -0.51
YUH1P35127 SAH1YER043C 1350 nt11.84□□□□□ -0.51
YUH1P35127 RPN10YHR200W 807 nt11.81□□□□□ -0.52
YUH1P35127 POA1YBR022W 534 nt11.8□□□□□ -0.52
YUH1P35127 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.73□□□□□ -0.53
YUH1P35127 YNL208WYNL208W 600 nt11.71□□□□□ -0.53
YUH1P35127 GAR1YHR089C 618 nt11.68□□□□□ -0.54
YUH1P35127 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.61□□□□□ -0.55
YUH1P35127 BSC6YOL137W 1494 nt11.57□□□□□ -0.56
YUH1P35127 RSB1YOR049C 1065 nt11.56□□□□□ -0.56
YUH1P35127 PUN1YLR414C 792 nt11.55□□□□□ -0.56
YUH1P35127 BUD23YCR047C 828 nt11.48□□□□□ -0.57
YUH1P35127 PTC2YER089C 1395 nt11.43□□□□□ -0.58
YUH1P35127 YJR018WYJR018W 363 nt11.43□□□□□ -0.58
YUH1P35127 FPS1YLL043W 2010 nt11.42□□□□□ -0.58
YUH1P35127 NAB2YGL122C 1578 nt11.33□□□□□ -0.6
YUH1P35127 TIR1YER011W 765 nt11.29□□□□□ -0.6
YUH1P35127 RPP2BYDR382W 333 nt11.18□□□□□ -0.62
YUH1P35127 FPR4YLR449W 1179 nt11.13□□□□□ -0.63
YUH1P35127 DAL1YIR027C 1383 nt11.12□□□□□ -0.63
YUH1P35127 MOT3YMR070W 1473 nt11.11□□□□□ -0.63
YUH1P35127 SPT5YML010W 3192 nt11.11□□□□□ -0.63
YUH1P35127 INM2YDR287W 879 nt11.1□□□□□ -0.63
YUH1P35127 YJR120WYJR120W 351 nt11.09□□□□□ -0.63
YUH1P35127 FIS1YIL065C 468 nt11.06□□□□□ -0.64
YUH1P35127 PST2YDR032C 597 nt11.03□□□□□ -0.64
YUH1P35127 NVJ2YPR091C 2313 nt11.02□□□□□ -0.64
YUH1P35127 PHO4YFR034C 939 nt10.99□□□□□ -0.65
YUH1P35127 SSA4YER103W 1929 nt10.9□□□□□ -0.66
YUH1P35127 YBL100CYBL100C 315 nt10.9□□□□□ -0.66
YUH1P35127 MEP2YNL142W 1500 nt10.89□□□□□ -0.67
YUH1P35127 SRB2YHR041C 633 nt10.86□□□□□ -0.67
YUH1P35127 BDH2YAL061W 1254 nt10.86□□□□□ -0.67
YUH1P35127 YPS1YLR120C 1710 nt10.86□□□□□ -0.67
YUH1P35127 PAC11YDR488C 1602 nt10.81□□□□□ -0.68
YUH1P35127 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.81□□□□□ -0.68
YUH1P35127 FUN26YAL022C 1554 nt10.77□□□□□ -0.69
YUH1P35127 YDR095CYDR095C 411 nt10.75□□□□□ -0.69
YUH1P35127 TRM9YML014W 840 nt10.75□□□□□ -0.69
YUH1P35127 WWM1YFL010C 636 nt10.73□□□□□ -0.69
YUH1P35127 ALF1YNL148C 765 nt10.72□□□□□ -0.69
YUH1P35127 LSM3YLR438C-A 270 nt10.69□□□□□ -0.7
YUH1P35127 DCW1YKL046C 1350 nt10.68□□□□□ -0.7
YUH1P35127 YGR021WYGR021W 873 nt10.64□□□□□ -0.71
YUH1P35127 SHU1YHL006C 453 nt10.63□□□□□ -0.71
YUH1P35127 RPM1RPM1 483 nt10.62□□□□□ -0.71
YUH1P35127 YMR090WYMR090W 684 nt10.61□□□□□ -0.71
YUH1P35127 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.6□□□□□ -0.71
YUH1P35127 CCT6YDR188W 1641 nt10.59□□□□□ -0.71
YUH1P35127 RPP2AYOL039W 321 nt10.59□□□□□ -0.71
YUH1P35127 EMI2YDR516C 1503 nt10.58□□□□□ -0.72
YUH1P35127 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.58□□□□□ -0.72
YUH1P35127 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.58□□□□□ -0.72
YUH1P35127 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.56□□□□□ -0.72
YUH1P35127 HOM6YJR139C 1080 nt10.53□□□□□ -0.72
YUH1P35127 PTP1YDL230W 1008 nt10.51□□□□□ -0.73
YUH1P35127 SIS1YNL007C 1059 nt10.5□□□□□ -0.73
YUH1P35127 YKL097CYKL097C 411 nt10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.4 ms