Protein–RNA interactions for Protein: P53900

GIM3, Prefoldin subunit 4, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GIM3P53900 NSR1YGR159C 1245 nt17.53■□□□□ 0.4
GIM3P53900 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.15■□□□□ 0.34
GIM3P53900 NOP1YDL014W 984 nt16.65■□□□□ 0.26
GIM3P53900 MDJ1YFL016C 1536 nt15.82■□□□□ 0.12
GIM3P53900 YKL036CYKL036C 393 nt14.85□□□□□ -0.03
GIM3P53900 YJL027CYJL027C 417 nt14.7□□□□□ -0.06
GIM3P53900 SRX1YKL086W 384 nt14.46□□□□□ -0.09
GIM3P53900 Q0297Q0297 156 nt14.33□□□□□ -0.12
GIM3P53900 DBP2YNL112W 1641 nt13.79□□□□□ -0.2
GIM3P53900 YBR190WYBR190W 312 nt13.75□□□□□ -0.21
GIM3P53900 YCR051WYCR051W 669 nt13.63□□□□□ -0.23
GIM3P53900 RTC3YHR087W 336 nt13.39□□□□□ -0.27
GIM3P53900 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.3□□□□□ -0.28
GIM3P53900 SSA3YBL075C 1950 nt13.19□□□□□ -0.3
GIM3P53900 SCS3YGL126W 1143 nt13.18□□□□□ -0.3
GIM3P53900 RVS167YDR388W 1449 nt13.12□□□□□ -0.31
GIM3P53900 CCC1YLR220W 969 nt13.09□□□□□ -0.31
GIM3P53900 RPP1BYDL130W 321 nt12.85□□□□□ -0.35
GIM3P53900 YOL085CYOL085C 342 nt12.81□□□□□ -0.36
GIM3P53900 PUT4YOR348C 1884 nt12.72□□□□□ -0.37
GIM3P53900 SCJ1YMR214W 1134 nt12.7□□□□□ -0.38
GIM3P53900 PKP1YIL042C 1185 nt12.57□□□□□ -0.4
GIM3P53900 SHR5YOL110W 714 nt12.47□□□□□ -0.41
GIM3P53900 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.43□□□□□ -0.42
GIM3P53900 URN1YPR152C 1398 nt12.33□□□□□ -0.44
GIM3P53900 ARE1YCR048W 1833 nt12.32□□□□□ -0.44
GIM3P53900 OPI9YLR338W 858 nt12.28□□□□□ -0.44
GIM3P53900 POA1YBR022W 534 nt12.27□□□□□ -0.45
GIM3P53900 PET122YER153C 765 nt12.25□□□□□ -0.45
GIM3P53900 SAH1YER043C 1350 nt12.23□□□□□ -0.45
GIM3P53900 RPN10YHR200W 807 nt12.23□□□□□ -0.45
GIM3P53900 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.22□□□□□ -0.45
GIM3P53900 SSA1YAL005C 1929 nt12.19□□□□□ -0.46
GIM3P53900 SCR1SCR1 522 nt12.17□□□□□ -0.46
GIM3P53900 BSC6YOL137W 1494 nt12.11□□□□□ -0.47
GIM3P53900 DEP1YAL013W 1218 nt12.11□□□□□ -0.47
GIM3P53900 YDJ1YNL064C 1230 nt12.1□□□□□ -0.47
GIM3P53900 YNL208WYNL208W 600 nt12.05□□□□□ -0.48
GIM3P53900 PUN1YLR414C 792 nt12□□□□□ -0.49
GIM3P53900 FPS1YLL043W 2010 nt11.91□□□□□ -0.5
GIM3P53900 BUD23YCR047C 828 nt11.9□□□□□ -0.5
GIM3P53900 RRN5YLR141W 1092 nt11.86□□□□□ -0.51
GIM3P53900 PTC2YER089C 1395 nt11.81□□□□□ -0.52
GIM3P53900 GAR1YHR089C 618 nt11.8□□□□□ -0.52
GIM3P53900 NAB2YGL122C 1578 nt11.79□□□□□ -0.52
GIM3P53900 SPT5YML010W 3192 nt11.78□□□□□ -0.52
GIM3P53900 YJR018WYJR018W 363 nt11.77□□□□□ -0.53
GIM3P53900 YJL225CYJL225C 5277 nt11.75□□□□□ -0.53
GIM3P53900 Q0182Q0182 405 nt11.72□□□□□ -0.53
GIM3P53900 ATS1YAL020C 1002 nt11.69□□□□□ -0.54
GIM3P53900 NVJ2YPR091C 2313 nt11.66□□□□□ -0.54
GIM3P53900 SSA4YER103W 1929 nt11.65□□□□□ -0.54
GIM3P53900 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.62□□□□□ -0.55
GIM3P53900 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.59□□□□□ -0.55
GIM3P53900 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.59□□□□□ -0.55
GIM3P53900 PAC11YDR488C 1602 nt11.58□□□□□ -0.56
GIM3P53900 DAL1YIR027C 1383 nt11.54□□□□□ -0.56
GIM3P53900 RPP2BYDR382W 333 nt11.52□□□□□ -0.57
GIM3P53900 RSB1YOR049C 1065 nt11.52□□□□□ -0.57
GIM3P53900 INM2YDR287W 879 nt11.49□□□□□ -0.57
GIM3P53900 FIS1YIL065C 468 nt11.48□□□□□ -0.57
GIM3P53900 TIR1YER011W 765 nt11.46□□□□□ -0.57
GIM3P53900 MEP2YNL142W 1500 nt11.45□□□□□ -0.58
GIM3P53900 FPR4YLR449W 1179 nt11.44□□□□□ -0.58
GIM3P53900 PHO4YFR034C 939 nt11.39□□□□□ -0.59
GIM3P53900 YJR120WYJR120W 351 nt11.33□□□□□ -0.6
GIM3P53900 YPS1YLR120C 1710 nt11.32□□□□□ -0.6
GIM3P53900 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.26□□□□□ -0.61
GIM3P53900 YBL100CYBL100C 315 nt11.23□□□□□ -0.61
GIM3P53900 YMR090WYMR090W 684 nt11.22□□□□□ -0.61
GIM3P53900 YDR095CYDR095C 411 nt11.21□□□□□ -0.61
GIM3P53900 BDF1YLR399C 2061 nt11.2□□□□□ -0.62
GIM3P53900 DCW1YKL046C 1350 nt11.14□□□□□ -0.63
GIM3P53900 BDH2YAL061W 1254 nt11.13□□□□□ -0.63
GIM3P53900 ALF1YNL148C 765 nt11.09□□□□□ -0.63
GIM3P53900 EMI2YDR516C 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
GIM3P53900 TAT1YBR069C 1860 nt11.08□□□□□ -0.64
GIM3P53900 FUN26YAL022C 1554 nt11.07□□□□□ -0.64
GIM3P53900 TRM9YML014W 840 nt11.02□□□□□ -0.65
GIM3P53900 RPP2AYOL039W 321 nt11.02□□□□□ -0.65
GIM3P53900 YDL221WYDL221W 552 nt11□□□□□ -0.65
GIM3P53900 YBR220CYBR220C 1683 nt11□□□□□ -0.65
GIM3P53900 RPM1RPM1 483 nt10.97□□□□□ -0.65
GIM3P53900 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.96□□□□□ -0.65
GIM3P53900 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.96□□□□□ -0.65
GIM3P53900 LSM3YLR438C-A 270 nt10.95□□□□□ -0.66
GIM3P53900 SDH1YKL148C 1923 nt10.93□□□□□ -0.66
GIM3P53900 CCT6YDR188W 1641 nt10.91□□□□□ -0.66
GIM3P53900 PTP1YDL230W 1008 nt10.89□□□□□ -0.67
GIM3P53900 SRB2YHR041C 633 nt10.89□□□□□ -0.67
GIM3P53900 PST2YDR032C 597 nt10.88□□□□□ -0.67
GIM3P53900 SEC11YIR022W 504 nt10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.3 ms