RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	CLN1	P20437	546 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	LSB5	P25369	354 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	SIN4	P32259	974 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	YME2	P32843	850 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	KKQ8	P36004	724 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	REE1	P40893	198 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	PEX25	Q02969	394 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	MRPL35	Q06678	367 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	SCM3	Q12334	223 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	SNT1	P25357	1226 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	ITR1	P30605	584 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	BYE1	P36106	594 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	SWD3	P38123	315 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	MMS4	P38257	691 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	PAN6	P40459	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	ERO1	Q03103	563 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	HRT3	Q12347	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	RIM15	P43565	1770 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	SEC63	P14906	663 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	KRE2	P27809	442 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	HIR2	P32480	875 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	PHB2	P50085	310 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	YGR117C	P53270	476 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	RSN1	Q03516	953 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	ORT1	Q12375	292 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YKR070W	YKR070W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	TRP1	P00912	224 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	YCR051W	P25631	222 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	NPL6	P32832	435 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SKO1	Q02100	647 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	KAP120	Q02932	1032 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	DON1	Q05610	365 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SOR2	Q07786	357 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	NFU1	P32860	256 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RFC3	P38629	340 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	AZR1	P50080	613 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	GIP3	Q03016	1276 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SPC19	Q03954	165 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	ROY1	Q04847	553 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	MDM30	Q05930	598 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	AFI1	Q99222	893 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	GSC2	P40989	1895 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	HOM3	P10869	527 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	TFB1	P32776	642 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	MSG5	P38590	489 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	YRM1	Q12340	786 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SCEI	P03882	235 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	URA4	P20051	364 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	CTR86	P25355	563 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	BRF1	P29056	596 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	MRPL10	P36520	322 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RRN10	P38204	145 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	MTM1	P53320	366 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	MHR1	Q06630	226 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RBD2	Q12270	262 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	NAM2	P11325	894 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	POP5	P28005	173 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	CAB3	P36076	571 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	YBR056W	P38081	501 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	YBR137W	P38276	179 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RRT2	P38332	387 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	PHO86	P46956	311 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	SHY1	P53266	389 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	GPI15	P53961	229 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	YMR027W	Q04371	470 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	RMD5	Q12508	421 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	TAF12	Q03761	539 aa		3.28	□□□□□ -1.88
YKR070W	YKR070W	DCS1	Q06151	350 aa		3.28	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26 ms