Protein–RNA interactions for Protein: Q02100

SKO1, CRE-binding bZIP protein SKO1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKO1Q02100 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.55■□□□□ 0.4
SKO1Q02100 NSR1YGR159C 1245 nt17.36■□□□□ 0.37
SKO1Q02100 NOP1YDL014W 984 nt17.13■□□□□ 0.33
SKO1Q02100 YKL036CYKL036C 393 nt15.92■□□□□ 0.14
SKO1Q02100 MDJ1YFL016C 1536 nt15.27■□□□□ 0.03
SKO1Q02100 Q0297Q0297 156 nt15.05■□□□□ -0
SKO1Q02100 SRX1YKL086W 384 nt14.97□□□□□ -0.01
SKO1Q02100 YJL027CYJL027C 417 nt14.86□□□□□ -0.03
SKO1Q02100 SCS3YGL126W 1143 nt14.53□□□□□ -0.08
SKO1Q02100 YCR051WYCR051W 669 nt14.18□□□□□ -0.14
SKO1Q02100 YOL085CYOL085C 342 nt13.78□□□□□ -0.2
SKO1Q02100 DBP2YNL112W 1641 nt13.57□□□□□ -0.24
SKO1Q02100 PKP1YIL042C 1185 nt13.53□□□□□ -0.24
SKO1Q02100 RPP1BYDL130W 321 nt13.49□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.46□□□□□ -0.25
SKO1Q02100 CCC1YLR220W 969 nt13.29□□□□□ -0.28
SKO1Q02100 YBR190WYBR190W 312 nt13.1□□□□□ -0.31
SKO1Q02100 SCJ1YMR214W 1134 nt13.07□□□□□ -0.32
SKO1Q02100 ATS1YAL020C 1002 nt13.04□□□□□ -0.32
SKO1Q02100 SSA3YBL075C 1950 nt12.91□□□□□ -0.34
SKO1Q02100 PET122YER153C 765 nt12.86□□□□□ -0.35
SKO1Q02100 RVS167YDR388W 1449 nt12.79□□□□□ -0.36
SKO1Q02100 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.77□□□□□ -0.37
SKO1Q02100 SCR1SCR1 522 nt12.76□□□□□ -0.37
SKO1Q02100 RTC3YHR087W 336 nt12.7□□□□□ -0.38
SKO1Q02100 RRN5YLR141W 1092 nt12.5□□□□□ -0.41
SKO1Q02100 PUT4YOR348C 1884 nt12.4□□□□□ -0.42
SKO1Q02100 SHR5YOL110W 714 nt12.38□□□□□ -0.43
SKO1Q02100 YDJ1YNL064C 1230 nt12.37□□□□□ -0.43
SKO1Q02100 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.27□□□□□ -0.45
SKO1Q02100 RSB1YOR049C 1065 nt12.27□□□□□ -0.45
SKO1Q02100 PST2YDR032C 597 nt12.06□□□□□ -0.48
SKO1Q02100 GAR1YHR089C 618 nt12.04□□□□□ -0.48
SKO1Q02100 ARE1YCR048W 1833 nt12.01□□□□□ -0.49
SKO1Q02100 Q0182Q0182 405 nt12□□□□□ -0.49
SKO1Q02100 DEP1YAL013W 1218 nt11.96□□□□□ -0.49
SKO1Q02100 URN1YPR152C 1398 nt11.94□□□□□ -0.5
SKO1Q02100 POA1YBR022W 534 nt11.87□□□□□ -0.51
SKO1Q02100 SPT5YML010W 3192 nt11.85□□□□□ -0.51
SKO1Q02100 RPN10YHR200W 807 nt11.82□□□□□ -0.52
SKO1Q02100 YNL208WYNL208W 600 nt11.82□□□□□ -0.52
SKO1Q02100 SAH1YER043C 1350 nt11.78□□□□□ -0.52
SKO1Q02100 OPI9YLR338W 858 nt11.76□□□□□ -0.53
SKO1Q02100 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.75□□□□□ -0.53
SKO1Q02100 BSC6YOL137W 1494 nt11.74□□□□□ -0.53
SKO1Q02100 TIR1YER011W 765 nt11.65□□□□□ -0.54
SKO1Q02100 YKL097CYKL097C 411 nt11.64□□□□□ -0.55
SKO1Q02100 SHU1YHL006C 453 nt11.53□□□□□ -0.56
SKO1Q02100 SSA4YER103W 1929 nt11.51□□□□□ -0.57
SKO1Q02100 SSA1YAL005C 1929 nt11.48□□□□□ -0.57
SKO1Q02100 PUN1YLR414C 792 nt11.43□□□□□ -0.58
SKO1Q02100 YJR018WYJR018W 363 nt11.41□□□□□ -0.58
SKO1Q02100 BUD23YCR047C 828 nt11.36□□□□□ -0.59
SKO1Q02100 MOT3YMR070W 1473 nt11.33□□□□□ -0.6
SKO1Q02100 SRB2YHR041C 633 nt11.3□□□□□ -0.6
SKO1Q02100 PTC2YER089C 1395 nt11.29□□□□□ -0.6
SKO1Q02100 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.29□□□□□ -0.6
SKO1Q02100 YJR120WYJR120W 351 nt11.27□□□□□ -0.61
SKO1Q02100 BDF1YLR399C 2061 nt11.23□□□□□ -0.61
SKO1Q02100 NAB2YGL122C 1578 nt11.22□□□□□ -0.61
SKO1Q02100 RPP2BYDR382W 333 nt11.21□□□□□ -0.61
SKO1Q02100 YOR139CYOR139C 393 nt11.16□□□□□ -0.62
SKO1Q02100 WWM1YFL010C 636 nt11.15□□□□□ -0.62
SKO1Q02100 YGR021WYGR021W 873 nt11.14□□□□□ -0.63
SKO1Q02100 HOM6YJR139C 1080 nt11.1□□□□□ -0.63
SKO1Q02100 MEP2YNL142W 1500 nt11.09□□□□□ -0.63
SKO1Q02100 FIS1YIL065C 468 nt11.09□□□□□ -0.63
SKO1Q02100 MNP1YGL068W 585 nt11.04□□□□□ -0.64
SKO1Q02100 TAT1YBR069C 1860 nt11.04□□□□□ -0.64
SKO1Q02100 NPL3YDR432W 1245 nt11.03□□□□□ -0.64
SKO1Q02100 BDH2YAL061W 1254 nt11.02□□□□□ -0.65
SKO1Q02100 INM2YDR287W 879 nt11□□□□□ -0.65
SKO1Q02100 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.98□□□□□ -0.65
SKO1Q02100 DAL1YIR027C 1383 nt10.98□□□□□ -0.65
SKO1Q02100 RKM5YLR137W 1104 nt10.94□□□□□ -0.66
SKO1Q02100 YOL037CYOL037C 354 nt10.94□□□□□ -0.66
SKO1Q02100 DCW1YKL046C 1350 nt10.93□□□□□ -0.66
SKO1Q02100 LSM3YLR438C-A 270 nt10.92□□□□□ -0.66
SKO1Q02100 FPR4YLR449W 1179 nt10.92□□□□□ -0.66
SKO1Q02100 YBL100CYBL100C 315 nt10.91□□□□□ -0.66
SKO1Q02100 YPS1YLR120C 1710 nt10.91□□□□□ -0.66
SKO1Q02100 PHO4YFR034C 939 nt10.89□□□□□ -0.67
SKO1Q02100 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.79□□□□□ -0.68
SKO1Q02100 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.79□□□□□ -0.68
SKO1Q02100 FUN26YAL022C 1554 nt10.78□□□□□ -0.68
SKO1Q02100 TRM9YML014W 840 nt10.78□□□□□ -0.68
SKO1Q02100 YBR220CYBR220C 1683 nt10.78□□□□□ -0.68
SKO1Q02100 YDR095CYDR095C 411 nt10.75□□□□□ -0.69
SKO1Q02100 EMI2YDR516C 1503 nt10.73□□□□□ -0.69
SKO1Q02100 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.72□□□□□ -0.69
SKO1Q02100 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.72□□□□□ -0.69
SKO1Q02100 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.72□□□□□ -0.69
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