Protein–RNA interactions for Protein: Q12508

RMD5, Sporulation protein RMD5, yeastyeast

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RMD5Q12508 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.48■□□□□ 0.87
RMD5Q12508 NSR1YGR159C 1245 nt20.31■□□□□ 0.84
RMD5Q12508 NOP1YDL014W 984 nt19.74■□□□□ 0.75
RMD5Q12508 MDJ1YFL016C 1536 nt18.27■□□□□ 0.51
RMD5Q12508 YKL036CYKL036C 393 nt18.21■□□□□ 0.51
RMD5Q12508 SRX1YKL086W 384 nt17.3■□□□□ 0.36
RMD5Q12508 Q0297Q0297 156 nt17.29■□□□□ 0.36
RMD5Q12508 YJL027CYJL027C 417 nt17.02■□□□□ 0.32
RMD5Q12508 SCS3YGL126W 1143 nt16.6■□□□□ 0.25
RMD5Q12508 YCR051WYCR051W 669 nt16.48■□□□□ 0.23
RMD5Q12508 DBP2YNL112W 1641 nt16.11■□□□□ 0.17
RMD5Q12508 YOL085CYOL085C 342 nt15.83■□□□□ 0.12
RMD5Q12508 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.72■□□□□ 0.11
RMD5Q12508 PKP1YIL042C 1185 nt15.7■□□□□ 0.1
RMD5Q12508 CCC1YLR220W 969 nt15.64■□□□□ 0.09
RMD5Q12508 RPP1BYDL130W 321 nt15.54■□□□□ 0.08
RMD5Q12508 YBR190WYBR190W 312 nt15.46■□□□□ 0.07
RMD5Q12508 RTC3YHR087W 336 nt15.18■□□□□ 0.02
RMD5Q12508 SCJ1YMR214W 1134 nt15.07■□□□□ 0
RMD5Q12508 RVS167YDR388W 1449 nt14.99□□□□□ -0.01
RMD5Q12508 PET122YER153C 765 nt14.93□□□□□ -0.02
RMD5Q12508 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.86□□□□□ -0.03
RMD5Q12508 ATS1YAL020C 1002 nt14.8□□□□□ -0.04
RMD5Q12508 SCR1SCR1 522 nt14.63□□□□□ -0.07
RMD5Q12508 RRN5YLR141W 1092 nt14.49□□□□□ -0.09
RMD5Q12508 SHR5YOL110W 714 nt14.49□□□□□ -0.09
RMD5Q12508 YDJ1YNL064C 1230 nt14.31□□□□□ -0.12
RMD5Q12508 DEP1YAL013W 1218 nt14.25□□□□□ -0.13
RMD5Q12508 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.19□□□□□ -0.14
RMD5Q12508 URN1YPR152C 1398 nt14.19□□□□□ -0.14
RMD5Q12508 RSB1YOR049C 1065 nt14.16□□□□□ -0.14
RMD5Q12508 PUT4YOR348C 1884 nt14.16□□□□□ -0.14
RMD5Q12508 GAR1YHR089C 618 nt14.12□□□□□ -0.15
RMD5Q12508 SAH1YER043C 1350 nt13.97□□□□□ -0.17
RMD5Q12508 OPI9YLR338W 858 nt13.96□□□□□ -0.17
RMD5Q12508 ARE1YCR048W 1833 nt13.9□□□□□ -0.18
RMD5Q12508 YNL208WYNL208W 600 nt13.87□□□□□ -0.19
RMD5Q12508 RPN10YHR200W 807 nt13.84□□□□□ -0.19
RMD5Q12508 POA1YBR022W 534 nt13.76□□□□□ -0.21
RMD5Q12508 PST2YDR032C 597 nt13.72□□□□□ -0.21
RMD5Q12508 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.72□□□□□ -0.21
RMD5Q12508 TIR1YER011W 765 nt13.6□□□□□ -0.23
RMD5Q12508 YJR018WYJR018W 363 nt13.51□□□□□ -0.25
RMD5Q12508 PUN1YLR414C 792 nt13.51□□□□□ -0.25
RMD5Q12508 SSA1YAL005C 1929 nt13.51□□□□□ -0.25
RMD5Q12508 SSA3YBL075C 1950 nt13.49□□□□□ -0.25
RMD5Q12508 BSC6YOL137W 1494 nt13.45□□□□□ -0.26
RMD5Q12508 PTC2YER089C 1395 nt13.45□□□□□ -0.26
RMD5Q12508 BUD23YCR047C 828 nt13.42□□□□□ -0.26
RMD5Q12508 SRB2YHR041C 633 nt13.39□□□□□ -0.27
RMD5Q12508 YJR120WYJR120W 351 nt13.38□□□□□ -0.27
RMD5Q12508 SHU1YHL006C 453 nt13.24□□□□□ -0.29
RMD5Q12508 NAB2YGL122C 1578 nt13.2□□□□□ -0.3
RMD5Q12508 RPP2BYDR382W 333 nt13.15□□□□□ -0.3
RMD5Q12508 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.13□□□□□ -0.31
RMD5Q12508 YKL097CYKL097C 411 nt13.12□□□□□ -0.31
RMD5Q12508 FPR4YLR449W 1179 nt13.09□□□□□ -0.31
RMD5Q12508 FIS1YIL065C 468 nt13.08□□□□□ -0.32
RMD5Q12508 WWM1YFL010C 636 nt13.05□□□□□ -0.32
RMD5Q12508 DAL1YIR027C 1383 nt13.04□□□□□ -0.32
RMD5Q12508 INM2YDR287W 879 nt12.97□□□□□ -0.33
RMD5Q12508 PHO4YFR034C 939 nt12.95□□□□□ -0.34
RMD5Q12508 BDH2YAL061W 1254 nt12.9□□□□□ -0.34
RMD5Q12508 YBL100CYBL100C 315 nt12.89□□□□□ -0.35
RMD5Q12508 MNP1YGL068W 585 nt12.86□□□□□ -0.35
RMD5Q12508 HOM6YJR139C 1080 nt12.84□□□□□ -0.35
RMD5Q12508 SPT5YML010W 3192 nt12.83□□□□□ -0.36
RMD5Q12508 YGR021WYGR021W 873 nt12.8□□□□□ -0.36
RMD5Q12508 FUN26YAL022C 1554 nt12.76□□□□□ -0.37
RMD5Q12508 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.72□□□□□ -0.37
RMD5Q12508 YPS1YLR120C 1710 nt12.71□□□□□ -0.38
RMD5Q12508 TRM9YML014W 840 nt12.68□□□□□ -0.38
RMD5Q12508 YOR139CYOR139C 393 nt12.68□□□□□ -0.38
RMD5Q12508 LSM3YLR438C-A 270 nt12.67□□□□□ -0.38
RMD5Q12508 RKM5YLR137W 1104 nt12.65□□□□□ -0.38
RMD5Q12508 YDR095CYDR095C 411 nt12.61□□□□□ -0.39
RMD5Q12508 MEP2YNL142W 1500 nt12.59□□□□□ -0.39
RMD5Q12508 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.59□□□□□ -0.39
RMD5Q12508 ALF1YNL148C 765 nt12.55□□□□□ -0.4
RMD5Q12508 CCT6YDR188W 1641 nt12.54□□□□□ -0.4
RMD5Q12508 NPL3YDR432W 1245 nt12.51□□□□□ -0.41
RMD5Q12508 DCW1YKL046C 1350 nt12.49□□□□□ -0.41
RMD5Q12508 YOL037CYOL037C 354 nt12.45□□□□□ -0.42
RMD5Q12508 PTP1YDL230W 1008 nt12.4□□□□□ -0.42
RMD5Q12508 SSA4YER103W 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
RMD5Q12508 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.39□□□□□ -0.43
RMD5Q12508 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.39□□□□□ -0.43
RMD5Q12508 RPP2AYOL039W 321 nt12.38□□□□□ -0.43
RMD5Q12508 SIS1YNL007C 1059 nt12.37□□□□□ -0.43
RMD5Q12508 CAC2YML102W 1407 nt12.35□□□□□ -0.43
RMD5Q12508 EMI2YDR516C 1503 nt12.27□□□□□ -0.45
RMD5Q12508 ART5YGR068C 1761 nt12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13 ms