Protein–RNA interactions for Protein: Q12334

SCM3, Protein SCM3, yeastyeast

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SCM3Q12334 NSR1YGR159C 1245 nt17.47■□□□□ 0.39
SCM3Q12334 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.86■□□□□ 0.29
SCM3Q12334 MDJ1YFL016C 1536 nt16.2■□□□□ 0.18
SCM3Q12334 NOP1YDL014W 984 nt16.12■□□□□ 0.17
SCM3Q12334 SSA3YBL075C 1950 nt15.1■□□□□ 0.01
SCM3Q12334 YJL027CYJL027C 417 nt14.92□□□□□ -0.02
SCM3Q12334 YKL036CYKL036C 393 nt14.12□□□□□ -0.15
SCM3Q12334 SRX1YKL086W 384 nt14.06□□□□□ -0.16
SCM3Q12334 YBR190WYBR190W 312 nt14.06□□□□□ -0.16
SCM3Q12334 DBP2YNL112W 1641 nt14.01□□□□□ -0.17
SCM3Q12334 Q0297Q0297 156 nt13.83□□□□□ -0.2
SCM3Q12334 RTC3YHR087W 336 nt13.7□□□□□ -0.22
SCM3Q12334 Q0182Q0182 405 nt13.45□□□□□ -0.26
SCM3Q12334 PUT4YOR348C 1884 nt13.39□□□□□ -0.27
SCM3Q12334 YCR051WYCR051W 669 nt13.27□□□□□ -0.29
SCM3Q12334 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.17□□□□□ -0.3
SCM3Q12334 SSA4YER103W 1929 nt13.07□□□□□ -0.32
SCM3Q12334 RVS167YDR388W 1449 nt13.06□□□□□ -0.32
SCM3Q12334 CCC1YLR220W 969 nt13.01□□□□□ -0.33
SCM3Q12334 SPT5YML010W 3192 nt12.95□□□□□ -0.34
SCM3Q12334 POA1YBR022W 534 nt12.91□□□□□ -0.34
SCM3Q12334 ARE1YCR048W 1833 nt12.86□□□□□ -0.35
SCM3Q12334 BSC6YOL137W 1494 nt12.82□□□□□ -0.36
SCM3Q12334 SCJ1YMR214W 1134 nt12.77□□□□□ -0.37
SCM3Q12334 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.71□□□□□ -0.37
SCM3Q12334 PAC11YDR488C 1602 nt12.7□□□□□ -0.38
SCM3Q12334 BDF1YLR399C 2061 nt12.66□□□□□ -0.38
SCM3Q12334 MOT3YMR070W 1473 nt12.65□□□□□ -0.38
SCM3Q12334 SAH1YER043C 1350 nt12.62□□□□□ -0.39
SCM3Q12334 URN1YPR152C 1398 nt12.53□□□□□ -0.4
SCM3Q12334 OPI9YLR338W 858 nt12.52□□□□□ -0.41
SCM3Q12334 TAT1YBR069C 1860 nt12.46□□□□□ -0.41
SCM3Q12334 SCS3YGL126W 1143 nt12.41□□□□□ -0.42
SCM3Q12334 RPP1BYDL130W 321 nt12.4□□□□□ -0.42
SCM3Q12334 SHR5YOL110W 714 nt12.4□□□□□ -0.42
SCM3Q12334 NVJ2YPR091C 2313 nt12.39□□□□□ -0.43
SCM3Q12334 BUD23YCR047C 828 nt12.35□□□□□ -0.43
SCM3Q12334 DEP1YAL013W 1218 nt12.28□□□□□ -0.44
SCM3Q12334 YOL085CYOL085C 342 nt12.24□□□□□ -0.45
SCM3Q12334 RPN10YHR200W 807 nt12.2□□□□□ -0.46
SCM3Q12334 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.19□□□□□ -0.46
SCM3Q12334 PUN1YLR414C 792 nt12.16□□□□□ -0.46
SCM3Q12334 MEP2YNL142W 1500 nt12.14□□□□□ -0.47
SCM3Q12334 PTC2YER089C 1395 nt12.13□□□□□ -0.47
SCM3Q12334 PKP1YIL042C 1185 nt12.12□□□□□ -0.47
SCM3Q12334 NAB2YGL122C 1578 nt12.09□□□□□ -0.47
SCM3Q12334 YNL208WYNL208W 600 nt12.04□□□□□ -0.48
SCM3Q12334 SSA1YAL005C 1929 nt12.01□□□□□ -0.49
SCM3Q12334 PET122YER153C 765 nt11.93□□□□□ -0.5
SCM3Q12334 DCW1YKL046C 1350 nt11.92□□□□□ -0.5
SCM3Q12334 YJR018WYJR018W 363 nt11.91□□□□□ -0.5
SCM3Q12334 YBR220CYBR220C 1683 nt11.87□□□□□ -0.51
SCM3Q12334 FPS1YLL043W 2010 nt11.86□□□□□ -0.51
SCM3Q12334 YDJ1YNL064C 1230 nt11.83□□□□□ -0.52
SCM3Q12334 FIS1YIL065C 468 nt11.82□□□□□ -0.52
SCM3Q12334 YMR090WYMR090W 684 nt11.79□□□□□ -0.52
SCM3Q12334 DAL1YIR027C 1383 nt11.78□□□□□ -0.52
SCM3Q12334 EMI2YDR516C 1503 nt11.74□□□□□ -0.53
SCM3Q12334 PCH2YBR186W 1695 nt11.73□□□□□ -0.53
SCM3Q12334 FPR4YLR449W 1179 nt11.72□□□□□ -0.53
SCM3Q12334 YPS1YLR120C 1710 nt11.72□□□□□ -0.53
SCM3Q12334 GUT2YIL155C 1950 nt11.69□□□□□ -0.54
SCM3Q12334 GAR1YHR089C 618 nt11.67□□□□□ -0.54
SCM3Q12334 PHO4YFR034C 939 nt11.66□□□□□ -0.54
SCM3Q12334 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.64□□□□□ -0.55
SCM3Q12334 SEC11YIR022W 504 nt11.63□□□□□ -0.55
SCM3Q12334 SCR1SCR1 522 nt11.62□□□□□ -0.55
SCM3Q12334 SDH1YKL148C 1923 nt11.62□□□□□ -0.55
SCM3Q12334 INM2YDR287W 879 nt11.61□□□□□ -0.55
SCM3Q12334 YDL221WYDL221W 552 nt11.55□□□□□ -0.56
SCM3Q12334 YDR095CYDR095C 411 nt11.52□□□□□ -0.57
SCM3Q12334 YJR120WYJR120W 351 nt11.52□□□□□ -0.57
SCM3Q12334 RRN5YLR141W 1092 nt11.51□□□□□ -0.57
SCM3Q12334 RPP2BYDR382W 333 nt11.48□□□□□ -0.57
SCM3Q12334 UME6YDR207C 2511 nt11.46□□□□□ -0.58
SCM3Q12334 PIB2YGL023C 1908 nt11.44□□□□□ -0.58
SCM3Q12334 SCC4YER147C 1875 nt11.39□□□□□ -0.59
SCM3Q12334 BOR1YNL275W 1731 nt11.38□□□□□ -0.59
SCM3Q12334 CAC2YML102W 1407 nt11.36□□□□□ -0.59
SCM3Q12334 YBL100CYBL100C 315 nt11.35□□□□□ -0.59
SCM3Q12334 RTF1YGL244W 1677 nt11.33□□□□□ -0.6
SCM3Q12334 PTP1YDL230W 1008 nt11.32□□□□□ -0.6
SCM3Q12334 TIR1YER011W 765 nt11.31□□□□□ -0.6
SCM3Q12334 RPP2AYOL039W 321 nt11.31□□□□□ -0.6
SCM3Q12334 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.27□□□□□ -0.61
SCM3Q12334 YSC84YHR016C 1407 nt11.26□□□□□ -0.61
SCM3Q12334 YJL225CYJL225C 5277 nt11.24□□□□□ -0.61
SCM3Q12334 ALF1YNL148C 765 nt11.21□□□□□ -0.61
SCM3Q12334 IRC15YPL017C 1500 nt11.2□□□□□ -0.62
SCM3Q12334 BOP3YNL042W 1191 nt11.18□□□□□ -0.62
SCM3Q12334 FUN26YAL022C 1554 nt11.18□□□□□ -0.62
SCM3Q12334 GIS3YLR094C 1509 nt11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.2 ms