Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.59■■□□□ 1.05
HRT3Q12347 NSR1YGR159C 1245 nt21.26■□□□□ 0.99
HRT3Q12347 NOP1YDL014W 984 nt21.09■□□□□ 0.97
HRT3Q12347 YKL036CYKL036C 393 nt19.71■□□□□ 0.75
HRT3Q12347 MDJ1YFL016C 1536 nt18.64■□□□□ 0.57
HRT3Q12347 Q0297Q0297 156 nt18.58■□□□□ 0.56
HRT3Q12347 SRX1YKL086W 384 nt18.46■□□□□ 0.55
HRT3Q12347 YJL027CYJL027C 417 nt18.43■□□□□ 0.54
HRT3Q12347 SCS3YGL126W 1143 nt18.07■□□□□ 0.48
HRT3Q12347 YCR051WYCR051W 669 nt17.5■□□□□ 0.39
HRT3Q12347 YOL085CYOL085C 342 nt17.07■□□□□ 0.32
HRT3Q12347 PKP1YIL042C 1185 nt16.76■□□□□ 0.27
HRT3Q12347 RPP1BYDL130W 321 nt16.66■□□□□ 0.26
HRT3Q12347 DBP2YNL112W 1641 nt16.62■□□□□ 0.25
HRT3Q12347 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.54■□□□□ 0.24
HRT3Q12347 CCC1YLR220W 969 nt16.34■□□□□ 0.21
HRT3Q12347 SCJ1YMR214W 1134 nt16.33■□□□□ 0.2
HRT3Q12347 ATS1YAL020C 1002 nt16.23■□□□□ 0.19
HRT3Q12347 PET122YER153C 765 nt15.88■□□□□ 0.13
HRT3Q12347 YBR190WYBR190W 312 nt15.84■□□□□ 0.13
HRT3Q12347 SCR1SCR1 522 nt15.76■□□□□ 0.11
HRT3Q12347 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.73■□□□□ 0.11
HRT3Q12347 RVS167YDR388W 1449 nt15.64■□□□□ 0.09
HRT3Q12347 RTC3YHR087W 336 nt15.47■□□□□ 0.07
HRT3Q12347 RRN5YLR141W 1092 nt15.46■□□□□ 0.07
HRT3Q12347 YDJ1YNL064C 1230 nt15.22■□□□□ 0.03
HRT3Q12347 RSB1YOR049C 1065 nt15.19■□□□□ 0.02
HRT3Q12347 SHR5YOL110W 714 nt15.18■□□□□ 0.02
HRT3Q12347 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.16■□□□□ 0.02
HRT3Q12347 PST2YDR032C 597 nt15□□□□□ -0.01
HRT3Q12347 GAR1YHR089C 618 nt14.82□□□□□ -0.04
HRT3Q12347 DEP1YAL013W 1218 nt14.64□□□□□ -0.07
HRT3Q12347 URN1YPR152C 1398 nt14.59□□□□□ -0.07
HRT3Q12347 SSA3YBL075C 1950 nt14.52□□□□□ -0.09
HRT3Q12347 YKL097CYKL097C 411 nt14.51□□□□□ -0.09
HRT3Q12347 YNL208WYNL208W 600 nt14.46□□□□□ -0.09
HRT3Q12347 RPN10YHR200W 807 nt14.42□□□□□ -0.1
HRT3Q12347 PUT4YOR348C 1884 nt14.35□□□□□ -0.11
HRT3Q12347 OPI9YLR338W 858 nt14.35□□□□□ -0.11
HRT3Q12347 TIR1YER011W 765 nt14.32□□□□□ -0.12
HRT3Q12347 SHU1YHL006C 453 nt14.32□□□□□ -0.12
HRT3Q12347 SAH1YER043C 1350 nt14.17□□□□□ -0.14
HRT3Q12347 SSA1YAL005C 1929 nt14.11□□□□□ -0.15
HRT3Q12347 ARE1YCR048W 1833 nt14.01□□□□□ -0.17
HRT3Q12347 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.01□□□□□ -0.17
HRT3Q12347 YJR018WYJR018W 363 nt13.94□□□□□ -0.18
HRT3Q12347 SRB2YHR041C 633 nt13.93□□□□□ -0.18
HRT3Q12347 PUN1YLR414C 792 nt13.92□□□□□ -0.18
HRT3Q12347 YOR139CYOR139C 393 nt13.91□□□□□ -0.18
HRT3Q12347 POA1YBR022W 534 nt13.9□□□□□ -0.18
HRT3Q12347 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.82□□□□□ -0.2
HRT3Q12347 YJR120WYJR120W 351 nt13.82□□□□□ -0.2
HRT3Q12347 WWM1YFL010C 636 nt13.74□□□□□ -0.21
HRT3Q12347 YGR021WYGR021W 873 nt13.73□□□□□ -0.21
HRT3Q12347 RPP2BYDR382W 333 nt13.71□□□□□ -0.21
HRT3Q12347 NPL3YDR432W 1245 nt13.71□□□□□ -0.21
HRT3Q12347 HOM6YJR139C 1080 nt13.71□□□□□ -0.21
HRT3Q12347 PTC2YER089C 1395 nt13.7□□□□□ -0.22
HRT3Q12347 BSC6YOL137W 1494 nt13.67□□□□□ -0.22
HRT3Q12347 MNP1YGL068W 585 nt13.67□□□□□ -0.22
HRT3Q12347 YOL037CYOL037C 354 nt13.54□□□□□ -0.24
HRT3Q12347 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.52□□□□□ -0.25
HRT3Q12347 BUD23YCR047C 828 nt13.5□□□□□ -0.25
HRT3Q12347 BDH2YAL061W 1254 nt13.5□□□□□ -0.25
HRT3Q12347 RKM5YLR137W 1104 nt13.5□□□□□ -0.25
HRT3Q12347 NAB2YGL122C 1578 nt13.49□□□□□ -0.25
HRT3Q12347 INM2YDR287W 879 nt13.41□□□□□ -0.26
HRT3Q12347 LSM3YLR438C-A 270 nt13.38□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 DAL1YIR027C 1383 nt13.36□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.35□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.35□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.35□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.35□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.35□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 FIS1YIL065C 468 nt13.34□□□□□ -0.27
HRT3Q12347 YBL100CYBL100C 315 nt13.32□□□□□ -0.28
HRT3Q12347 SPT5YML010W 3192 nt13.31□□□□□ -0.28
HRT3Q12347 FPR4YLR449W 1179 nt13.31□□□□□ -0.28
HRT3Q12347 PHO4YFR034C 939 nt13.24□□□□□ -0.29
HRT3Q12347 YLR281CYLR281C 468 nt13.22□□□□□ -0.29
HRT3Q12347 TRM9YML014W 840 nt13.19□□□□□ -0.3
HRT3Q12347 FUN26YAL022C 1554 nt13.18□□□□□ -0.3
HRT3Q12347 PUS2YGL063W 1113 nt13.15□□□□□ -0.3
HRT3Q12347 WHI5YOR083W 888 nt13.13□□□□□ -0.31
HRT3Q12347 SSA4YER103W 1929 nt13.11□□□□□ -0.31
HRT3Q12347 CCT6YDR188W 1641 nt13.06□□□□□ -0.32
HRT3Q12347 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.93□□□□□ -0.34
HRT3Q12347 MOT3YMR070W 1473 nt12.92□□□□□ -0.34
HRT3Q12347 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.91□□□□□ -0.34
HRT3Q12347 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.91□□□□□ -0.34
HRT3Q12347 ALF1YNL148C 765 nt12.91□□□□□ -0.34
HRT3Q12347 YPS1YLR120C 1710 nt12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms