Protein–RNA interactions for Protein: Q12270

RBD2, Rhomboid protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RBD2Q12270 NSR1YGR159C 1245 nt18.37■□□□□ 0.53
RBD2Q12270 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.99■□□□□ 0.47
RBD2Q12270 NOP1YDL014W 984 nt17.27■□□□□ 0.36
RBD2Q12270 MDJ1YFL016C 1536 nt16.81■□□□□ 0.28
RBD2Q12270 YJL027CYJL027C 417 nt15.45■□□□□ 0.06
RBD2Q12270 YKL036CYKL036C 393 nt15.43■□□□□ 0.06
RBD2Q12270 SRX1YKL086W 384 nt15.09■□□□□ 0.01
RBD2Q12270 Q0297Q0297 156 nt14.96□□□□□ -0.01
RBD2Q12270 DBP2YNL112W 1641 nt14.68□□□□□ -0.06
RBD2Q12270 YBR190WYBR190W 312 nt14.49□□□□□ -0.09
RBD2Q12270 YCR051WYCR051W 669 nt14.26□□□□□ -0.13
RBD2Q12270 RTC3YHR087W 336 nt14.1□□□□□ -0.15
RBD2Q12270 SSA3YBL075C 1950 nt14.02□□□□□ -0.16
RBD2Q12270 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.98□□□□□ -0.17
RBD2Q12270 CCC1YLR220W 969 nt13.79□□□□□ -0.2
RBD2Q12270 SCS3YGL126W 1143 nt13.77□□□□□ -0.21
RBD2Q12270 RVS167YDR388W 1449 nt13.64□□□□□ -0.23
RBD2Q12270 PUT4YOR348C 1884 nt13.59□□□□□ -0.23
RBD2Q12270 SCJ1YMR214W 1134 nt13.49□□□□□ -0.25
RBD2Q12270 RPP1BYDL130W 321 nt13.41□□□□□ -0.26
RBD2Q12270 YOL085CYOL085C 342 nt13.39□□□□□ -0.27
RBD2Q12270 PKP1YIL042C 1185 nt13.23□□□□□ -0.29
RBD2Q12270 ARE1YCR048W 1833 nt13.17□□□□□ -0.3
RBD2Q12270 POA1YBR022W 534 nt13.09□□□□□ -0.31
RBD2Q12270 SHR5YOL110W 714 nt13.06□□□□□ -0.32
RBD2Q12270 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.04□□□□□ -0.32
RBD2Q12270 URN1YPR152C 1398 nt13.02□□□□□ -0.33
RBD2Q12270 SAH1YER043C 1350 nt13□□□□□ -0.33
RBD2Q12270 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.99□□□□□ -0.33
RBD2Q12270 OPI9YLR338W 858 nt12.96□□□□□ -0.33
RBD2Q12270 BSC6YOL137W 1494 nt12.92□□□□□ -0.34
RBD2Q12270 PET122YER153C 765 nt12.88□□□□□ -0.35
RBD2Q12270 DEP1YAL013W 1218 nt12.84□□□□□ -0.35
RBD2Q12270 SPT5YML010W 3192 nt12.77□□□□□ -0.36
RBD2Q12270 RPN10YHR200W 807 nt12.7□□□□□ -0.38
RBD2Q12270 YDJ1YNL064C 1230 nt12.63□□□□□ -0.39
RBD2Q12270 BUD23YCR047C 828 nt12.62□□□□□ -0.39
RBD2Q12270 YNL208WYNL208W 600 nt12.6□□□□□ -0.39
RBD2Q12270 SCR1SCR1 522 nt12.58□□□□□ -0.4
RBD2Q12270 PUN1YLR414C 792 nt12.57□□□□□ -0.4
RBD2Q12270 SSA4YER103W 1929 nt12.56□□□□□ -0.4
RBD2Q12270 PTC2YER089C 1395 nt12.5□□□□□ -0.41
RBD2Q12270 RRN5YLR141W 1092 nt12.44□□□□□ -0.42
RBD2Q12270 NAB2YGL122C 1578 nt12.43□□□□□ -0.42
RBD2Q12270 GAR1YHR089C 618 nt12.4□□□□□ -0.42
RBD2Q12270 YJR018WYJR018W 363 nt12.39□□□□□ -0.43
RBD2Q12270 FIS1YIL065C 468 nt12.21□□□□□ -0.45
RBD2Q12270 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.2□□□□□ -0.46
RBD2Q12270 MEP2YNL142W 1500 nt12.2□□□□□ -0.46
RBD2Q12270 ATS1YAL020C 1002 nt12.16□□□□□ -0.46
RBD2Q12270 DAL1YIR027C 1383 nt12.16□□□□□ -0.46
RBD2Q12270 BDF1YLR399C 2061 nt12.14□□□□□ -0.47
RBD2Q12270 YJR120WYJR120W 351 nt12.11□□□□□ -0.47
RBD2Q12270 FPR4YLR449W 1179 nt12.08□□□□□ -0.48
RBD2Q12270 PHO4YFR034C 939 nt12.05□□□□□ -0.48
RBD2Q12270 TIR1YER011W 765 nt12.03□□□□□ -0.48
RBD2Q12270 INM2YDR287W 879 nt12.02□□□□□ -0.49
RBD2Q12270 YPS1YLR120C 1710 nt12.01□□□□□ -0.49
RBD2Q12270 RSB1YOR049C 1065 nt12.01□□□□□ -0.49
RBD2Q12270 SSA1YAL005C 1929 nt12□□□□□ -0.49
RBD2Q12270 DCW1YKL046C 1350 nt11.98□□□□□ -0.49
RBD2Q12270 RPP2BYDR382W 333 nt11.98□□□□□ -0.49
RBD2Q12270 TAT1YBR069C 1860 nt11.97□□□□□ -0.49
RBD2Q12270 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.89□□□□□ -0.51
RBD2Q12270 YDR095CYDR095C 411 nt11.86□□□□□ -0.51
RBD2Q12270 EMI2YDR516C 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
RBD2Q12270 YBL100CYBL100C 315 nt11.81□□□□□ -0.52
RBD2Q12270 YBR220CYBR220C 1683 nt11.79□□□□□ -0.52
RBD2Q12270 YMR090WYMR090W 684 nt11.76□□□□□ -0.53
RBD2Q12270 Q0182Q0182 405 nt11.72□□□□□ -0.53
RBD2Q12270 SRB2YHR041C 633 nt11.71□□□□□ -0.53
RBD2Q12270 YDL221WYDL221W 552 nt11.69□□□□□ -0.54
RBD2Q12270 BDH2YAL061W 1254 nt11.67□□□□□ -0.54
RBD2Q12270 FUN26YAL022C 1554 nt11.66□□□□□ -0.54
RBD2Q12270 SDH1YKL148C 1923 nt11.65□□□□□ -0.54
RBD2Q12270 PTP1YDL230W 1008 nt11.65□□□□□ -0.54
RBD2Q12270 CAC2YML102W 1407 nt11.65□□□□□ -0.54
RBD2Q12270 RPP2AYOL039W 321 nt11.62□□□□□ -0.55
RBD2Q12270 ALF1YNL148C 765 nt11.59□□□□□ -0.55
RBD2Q12270 TRM9YML014W 840 nt11.52□□□□□ -0.57
RBD2Q12270 PAC11YDR488C 1602 nt11.52□□□□□ -0.57
RBD2Q12270 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
RBD2Q12270 IRC15YPL017C 1500 nt11.48□□□□□ -0.57
RBD2Q12270 PCH2YBR186W 1695 nt11.47□□□□□ -0.57
RBD2Q12270 CCT6YDR188W 1641 nt11.46□□□□□ -0.57
RBD2Q12270 SIS1YNL007C 1059 nt11.46□□□□□ -0.57
RBD2Q12270 SEC11YIR022W 504 nt11.44□□□□□ -0.58
RBD2Q12270 GUT2YIL155C 1950 nt11.43□□□□□ -0.58
RBD2Q12270 LSM3YLR438C-A 270 nt11.42□□□□□ -0.58
RBD2Q12270 GIS3YLR094C 1509 nt11.4□□□□□ -0.58
RBD2Q12270 WWM1YFL010C 636 nt11.4□□□□□ -0.58
RBD2Q12270 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16 ms