Protein–RNA interactions for Protein: P32259

SIN4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, yeastyeast

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN4P32259 NSR1YGR159C 1245 nt19.49■□□□□ 0.71
SIN4P32259 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.18■□□□□ 0.66
SIN4P32259 NOP1YDL014W 984 nt18.78■□□□□ 0.6
SIN4P32259 MDJ1YFL016C 1536 nt17.95■□□□□ 0.46
SIN4P32259 YKL036CYKL036C 393 nt17.61■□□□□ 0.41
SIN4P32259 Q0297Q0297 156 nt16.53■□□□□ 0.24
SIN4P32259 YJL027CYJL027C 417 nt16.5■□□□□ 0.23
SIN4P32259 SRX1YKL086W 384 nt16.41■□□□□ 0.22
SIN4P32259 SCS3YGL126W 1143 nt16.17■□□□□ 0.18
SIN4P32259 YCR051WYCR051W 669 nt15.6■□□□□ 0.09
SIN4P32259 DBP2YNL112W 1641 nt15.6■□□□□ 0.09
SIN4P32259 YBR190WYBR190W 312 nt15.49■□□□□ 0.07
SIN4P32259 SSA3YBL075C 1950 nt15.31■□□□□ 0.04
SIN4P32259 YOL085CYOL085C 342 nt15.25■□□□□ 0.03
SIN4P32259 RTC3YHR087W 336 nt15.11■□□□□ 0.01
SIN4P32259 PKP1YIL042C 1185 nt14.99□□□□□ -0.01
SIN4P32259 RPP1BYDL130W 321 nt14.84□□□□□ -0.03
SIN4P32259 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.78□□□□□ -0.04
SIN4P32259 SCJ1YMR214W 1134 nt14.72□□□□□ -0.05
SIN4P32259 CCC1YLR220W 969 nt14.63□□□□□ -0.07
SIN4P32259 PUT4YOR348C 1884 nt14.58□□□□□ -0.08
SIN4P32259 ATS1YAL020C 1002 nt14.57□□□□□ -0.08
SIN4P32259 RVS167YDR388W 1449 nt14.52□□□□□ -0.08
SIN4P32259 PET122YER153C 765 nt14.13□□□□□ -0.15
SIN4P32259 ARE1YCR048W 1833 nt14.11□□□□□ -0.15
SIN4P32259 SCR1SCR1 522 nt14.08□□□□□ -0.16
SIN4P32259 POA1YBR022W 534 nt14.07□□□□□ -0.16
SIN4P32259 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.97□□□□□ -0.17
SIN4P32259 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.94□□□□□ -0.18
SIN4P32259 SAH1YER043C 1350 nt13.92□□□□□ -0.18
SIN4P32259 BSC6YOL137W 1494 nt13.9□□□□□ -0.18
SIN4P32259 URN1YPR152C 1398 nt13.89□□□□□ -0.19
SIN4P32259 SHR5YOL110W 714 nt13.85□□□□□ -0.19
SIN4P32259 OPI9YLR338W 858 nt13.82□□□□□ -0.2
SIN4P32259 RRN5YLR141W 1092 nt13.78□□□□□ -0.2
SIN4P32259 SPT5YML010W 3192 nt13.76□□□□□ -0.21
SIN4P32259 DEP1YAL013W 1218 nt13.68□□□□□ -0.22
SIN4P32259 SSA4YER103W 1929 nt13.62□□□□□ -0.23
SIN4P32259 RSB1YOR049C 1065 nt13.58□□□□□ -0.24
SIN4P32259 BUD23YCR047C 828 nt13.56□□□□□ -0.24
SIN4P32259 RPN10YHR200W 807 nt13.53□□□□□ -0.24
SIN4P32259 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.51□□□□□ -0.25
SIN4P32259 YDJ1YNL064C 1230 nt13.5□□□□□ -0.25
SIN4P32259 PST2YDR032C 597 nt13.44□□□□□ -0.26
SIN4P32259 PUN1YLR414C 792 nt13.42□□□□□ -0.26
SIN4P32259 YNL208WYNL208W 600 nt13.4□□□□□ -0.26
SIN4P32259 PTC2YER089C 1395 nt13.38□□□□□ -0.27
SIN4P32259 NAB2YGL122C 1578 nt13.29□□□□□ -0.28
SIN4P32259 YJR018WYJR018W 363 nt13.2□□□□□ -0.3
SIN4P32259 GAR1YHR089C 618 nt13.17□□□□□ -0.3
SIN4P32259 BDF1YLR399C 2061 nt13.16□□□□□ -0.3
SIN4P32259 MEP2YNL142W 1500 nt13.13□□□□□ -0.31
SIN4P32259 YKL097CYKL097C 411 nt13.06□□□□□ -0.32
SIN4P32259 FIS1YIL065C 468 nt13.03□□□□□ -0.32
SIN4P32259 DAL1YIR027C 1383 nt12.99□□□□□ -0.33
SIN4P32259 TAT1YBR069C 1860 nt12.97□□□□□ -0.33
SIN4P32259 FPR4YLR449W 1179 nt12.95□□□□□ -0.34
SIN4P32259 DCW1YKL046C 1350 nt12.9□□□□□ -0.34
SIN4P32259 PHO4YFR034C 939 nt12.87□□□□□ -0.35
SIN4P32259 YPS1YLR120C 1710 nt12.86□□□□□ -0.35
SIN4P32259 YJR120WYJR120W 351 nt12.85□□□□□ -0.35
SIN4P32259 INM2YDR287W 879 nt12.82□□□□□ -0.36
SIN4P32259 SHU1YHL006C 453 nt12.82□□□□□ -0.36
SIN4P32259 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.77□□□□□ -0.37
SIN4P32259 RPP2BYDR382W 333 nt12.76□□□□□ -0.37
SIN4P32259 TIR1YER011W 765 nt12.72□□□□□ -0.37
SIN4P32259 EMI2YDR516C 1503 nt12.71□□□□□ -0.38
SIN4P32259 YBR220CYBR220C 1683 nt12.7□□□□□ -0.38
SIN4P32259 SSA1YAL005C 1929 nt12.7□□□□□ -0.38
SIN4P32259 YMR090WYMR090W 684 nt12.69□□□□□ -0.38
SIN4P32259 YDR095CYDR095C 411 nt12.67□□□□□ -0.38
SIN4P32259 PAC11YDR488C 1602 nt12.64□□□□□ -0.39
SIN4P32259 YBL100CYBL100C 315 nt12.59□□□□□ -0.39
SIN4P32259 YDL221WYDL221W 552 nt12.56□□□□□ -0.4
SIN4P32259 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.54□□□□□ -0.4
SIN4P32259 SDH1YKL148C 1923 nt12.54□□□□□ -0.4
SIN4P32259 CAC2YML102W 1407 nt12.48□□□□□ -0.41
SIN4P32259 YOR139CYOR139C 393 nt12.48□□□□□ -0.41
SIN4P32259 PTP1YDL230W 1008 nt12.46□□□□□ -0.41
SIN4P32259 RPP2AYOL039W 321 nt12.44□□□□□ -0.42
SIN4P32259 FUN26YAL022C 1554 nt12.42□□□□□ -0.42
SIN4P32259 PCH2YBR186W 1695 nt12.4□□□□□ -0.42
SIN4P32259 ALF1YNL148C 765 nt12.39□□□□□ -0.43
SIN4P32259 BDH2YAL061W 1254 nt12.38□□□□□ -0.43
SIN4P32259 SCC4YER147C 1875 nt12.36□□□□□ -0.43
SIN4P32259 SRB2YHR041C 633 nt12.36□□□□□ -0.43
SIN4P32259 SEC11YIR022W 504 nt12.36□□□□□ -0.43
SIN4P32259 GUT2YIL155C 1950 nt12.35□□□□□ -0.43
SIN4P32259 NPL3YDR432W 1245 nt12.31□□□□□ -0.44
SIN4P32259 IRC15YPL017C 1500 nt12.3□□□□□ -0.44
SIN4P32259 TRM9YML014W 840 nt12.27□□□□□ -0.45
SIN4P32259 GIS3YLR094C 1509 nt12.23□□□□□ -0.45
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