Protein–RNA interactions for Protein: Q03761

TAF12, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, yeastyeast

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF12Q03761 NSR1YGR159C 1245 nt20.15■□□□□ 0.82
TAF12Q03761 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.11■□□□□ 0.81
TAF12Q03761 NOP1YDL014W 984 nt19.48■□□□□ 0.71
TAF12Q03761 MDJ1YFL016C 1536 nt18.02■□□□□ 0.47
TAF12Q03761 YKL036CYKL036C 393 nt17.87■□□□□ 0.45
TAF12Q03761 Q0297Q0297 156 nt17.08■□□□□ 0.32
TAF12Q03761 SRX1YKL086W 384 nt17.08■□□□□ 0.32
TAF12Q03761 YJL027CYJL027C 417 nt16.63■□□□□ 0.25
TAF12Q03761 SCS3YGL126W 1143 nt16.22■□□□□ 0.19
TAF12Q03761 YCR051WYCR051W 669 nt16.12■□□□□ 0.17
TAF12Q03761 DBP2YNL112W 1641 nt15.95■□□□□ 0.14
TAF12Q03761 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.55■□□□□ 0.08
TAF12Q03761 YOL085CYOL085C 342 nt15.5■□□□□ 0.07
TAF12Q03761 YBR190WYBR190W 312 nt15.42■□□□□ 0.06
TAF12Q03761 RPP1BYDL130W 321 nt15.3■□□□□ 0.04
TAF12Q03761 CCC1YLR220W 969 nt15.29■□□□□ 0.04
TAF12Q03761 PKP1YIL042C 1185 nt15.24■□□□□ 0.03
TAF12Q03761 RTC3YHR087W 336 nt14.98□□□□□ -0.01
TAF12Q03761 RVS167YDR388W 1449 nt14.86□□□□□ -0.03
TAF12Q03761 SCJ1YMR214W 1134 nt14.84□□□□□ -0.03
TAF12Q03761 PET122YER153C 765 nt14.64□□□□□ -0.07
TAF12Q03761 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.63□□□□□ -0.07
TAF12Q03761 SSA3YBL075C 1950 nt14.61□□□□□ -0.07
TAF12Q03761 ATS1YAL020C 1002 nt14.45□□□□□ -0.1
TAF12Q03761 SCR1SCR1 522 nt14.39□□□□□ -0.11
TAF12Q03761 SHR5YOL110W 714 nt14.36□□□□□ -0.11
TAF12Q03761 RRN5YLR141W 1092 nt14.19□□□□□ -0.14
TAF12Q03761 YDJ1YNL064C 1230 nt14.18□□□□□ -0.14
TAF12Q03761 PUT4YOR348C 1884 nt14.14□□□□□ -0.15
TAF12Q03761 URN1YPR152C 1398 nt14.03□□□□□ -0.16
TAF12Q03761 DEP1YAL013W 1218 nt13.95□□□□□ -0.18
TAF12Q03761 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.92□□□□□ -0.18
TAF12Q03761 OPI9YLR338W 858 nt13.88□□□□□ -0.19
TAF12Q03761 ARE1YCR048W 1833 nt13.85□□□□□ -0.19
TAF12Q03761 GAR1YHR089C 618 nt13.83□□□□□ -0.2
TAF12Q03761 RSB1YOR049C 1065 nt13.82□□□□□ -0.2
TAF12Q03761 SAH1YER043C 1350 nt13.81□□□□□ -0.2
TAF12Q03761 RPN10YHR200W 807 nt13.76□□□□□ -0.21
TAF12Q03761 YNL208WYNL208W 600 nt13.74□□□□□ -0.21
TAF12Q03761 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.62□□□□□ -0.23
TAF12Q03761 POA1YBR022W 534 nt13.62□□□□□ -0.23
TAF12Q03761 PST2YDR032C 597 nt13.45□□□□□ -0.26
TAF12Q03761 PUN1YLR414C 792 nt13.45□□□□□ -0.26
TAF12Q03761 TIR1YER011W 765 nt13.4□□□□□ -0.26
TAF12Q03761 BSC6YOL137W 1494 nt13.39□□□□□ -0.27
TAF12Q03761 YJR018WYJR018W 363 nt13.37□□□□□ -0.27
TAF12Q03761 PTC2YER089C 1395 nt13.3□□□□□ -0.28
TAF12Q03761 SSA1YAL005C 1929 nt13.29□□□□□ -0.28
TAF12Q03761 BUD23YCR047C 828 nt13.24□□□□□ -0.29
TAF12Q03761 YJR120WYJR120W 351 nt13.23□□□□□ -0.29
TAF12Q03761 NAB2YGL122C 1578 nt13.16□□□□□ -0.3
TAF12Q03761 SRB2YHR041C 633 nt13.08□□□□□ -0.32
TAF12Q03761 RPP2BYDR382W 333 nt13.02□□□□□ -0.33
TAF12Q03761 FIS1YIL065C 468 nt13.02□□□□□ -0.33
TAF12Q03761 SPT5YML010W 3192 nt12.98□□□□□ -0.33
TAF12Q03761 DAL1YIR027C 1383 nt12.96□□□□□ -0.33
TAF12Q03761 SHU1YHL006C 453 nt12.92□□□□□ -0.34
TAF12Q03761 INM2YDR287W 879 nt12.91□□□□□ -0.34
TAF12Q03761 PHO4YFR034C 939 nt12.85□□□□□ -0.35
TAF12Q03761 FPR4YLR449W 1179 nt12.85□□□□□ -0.35
TAF12Q03761 BDH2YAL061W 1254 nt12.8□□□□□ -0.36
TAF12Q03761 WWM1YFL010C 636 nt12.79□□□□□ -0.36
TAF12Q03761 YKL097CYKL097C 411 nt12.78□□□□□ -0.36
TAF12Q03761 YBL100CYBL100C 315 nt12.76□□□□□ -0.37
TAF12Q03761 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.73□□□□□ -0.37
TAF12Q03761 YPS1YLR120C 1710 nt12.68□□□□□ -0.38
TAF12Q03761 YGR021WYGR021W 873 nt12.67□□□□□ -0.38
TAF12Q03761 HOM6YJR139C 1080 nt12.65□□□□□ -0.38
TAF12Q03761 FUN26YAL022C 1554 nt12.62□□□□□ -0.39
TAF12Q03761 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.6□□□□□ -0.39
TAF12Q03761 LSM3YLR438C-A 270 nt12.6□□□□□ -0.39
TAF12Q03761 MEP2YNL142W 1500 nt12.6□□□□□ -0.39
TAF12Q03761 YDR095CYDR095C 411 nt12.58□□□□□ -0.4
TAF12Q03761 MNP1YGL068W 585 nt12.54□□□□□ -0.4
TAF12Q03761 TRM9YML014W 840 nt12.54□□□□□ -0.4
TAF12Q03761 SSA4YER103W 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
TAF12Q03761 CCT6YDR188W 1641 nt12.48□□□□□ -0.41
TAF12Q03761 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.47□□□□□ -0.41
TAF12Q03761 RKM5YLR137W 1104 nt12.45□□□□□ -0.42
TAF12Q03761 ALF1YNL148C 765 nt12.42□□□□□ -0.42
TAF12Q03761 DCW1YKL046C 1350 nt12.4□□□□□ -0.42
TAF12Q03761 YOR139CYOR139C 393 nt12.36□□□□□ -0.43
TAF12Q03761 PTP1YDL230W 1008 nt12.34□□□□□ -0.43
TAF12Q03761 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.33□□□□□ -0.44
TAF12Q03761 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.33□□□□□ -0.44
TAF12Q03761 PAC11YDR488C 1602 nt12.33□□□□□ -0.44
TAF12Q03761 SIS1YNL007C 1059 nt12.32□□□□□ -0.44
TAF12Q03761 RPP2AYOL039W 321 nt12.32□□□□□ -0.44
TAF12Q03761 NVJ2YPR091C 2313 nt12.29□□□□□ -0.44
TAF12Q03761 YOL037CYOL037C 354 nt12.28□□□□□ -0.44
TAF12Q03761 CAC2YML102W 1407 nt12.23□□□□□ -0.45
TAF12Q03761 EMI2YDR516C 1503 nt12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms