RNA–Protein interactions for RNA: YMR219W

ESC1, Transcript of Protein localized to the nuclear periphery, yeast

Gene ESC1, Length 4,977 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ESC1	YMR219W	ACA1	P39970	489 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SOK1	P40317	901 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	ARG2	P40360	574 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YML6	P51998	286 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PEX8	P53248	589 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SNF12	P53628	566 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YNL260C	P53846	198 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YNL143C	P53908	130 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.59	□□□□□ -2	not detected
ESC1	YMR219W	PGC1	Q08959	321 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	AEP3	Q12089	606 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	GIS3	Q12418	502 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	FMP16	Q12497	93 aa		2.59	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	GAL1	P04385	528 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	STF2	P16965	84 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	RIT1	P23796	513 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	ATG22	P25568	528 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SPT10	P35208	640 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YBR096W	P38256	230 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	TOS1	P38288	455 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	IDP2	P41939	412 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YNL320W	P42840	284 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	RTT101	P47050	842 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	EFM3	P47163	339 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YPL034W	Q03083	165 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YMR279C	Q03263	540 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	VHS1	Q03785	461 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	RAD30	Q04049	632 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PPN1	Q04119	674 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PNP1	Q05788	311 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	ECI1	Q05871	280 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	HER1	Q12276	1246 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	BNI1	P41832	1953 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	AMD2	P22580	549 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	RDH54	P38086	958 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	BIM1	P40013	344 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	ROM1	P53046	1155 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	USE1	P53146	245 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YGR035C	P53222	116 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YDR476C	Q03362	224 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SPH1	Q06160	661 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	RSC58	Q07979	502 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	FLO11	P08640	1367 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	HOP1	P20050	605 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PRP28	P23394	588 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	MRM1	P25270	412 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	LYP1	P32487	611 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	NGG1	P32494	702 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SBE22	P38814	852 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YHR219W	P38900	624 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	HOL1	P53389	586 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	CWC24	P53769	259 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YML037C	Q03703	340 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	CDA1	Q06702	301 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	NTG2	Q08214	380 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	GSH2	Q08220	491 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YPL216W	Q08964	1102 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YPR022C	Q12139	1133 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	CHS2	P14180	963 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PUT4	P15380	627 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	CMK2	P22517	447 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	MTC2	P34246	357 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	CLG1	P35190	452 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YKR075C	P36155	307 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SEA4	P38164	1038 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SHG1	P38337	142 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	LNP1	P38878	278 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	EAF5	P39995	279 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	TGL3	P40308	642 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YJL016W	P47072	561 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	BIR1	P47134	954 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YGL117W	P53133	265 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YNL146W	P53906	100 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	UBP16	Q02863	499 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	PDR8	Q06149	701 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	VPS74	Q06385	345 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	YLR352W	Q06479	807 aa		2.58	□□□□□ -2
ESC1	YMR219W	ESC8	Q08119	714 aa		2.58	□□□□□ -2

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