Protein–RNA interactions for Protein: P35208

SPT10, Protein SPT10, yeastyeast

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT10P35208 NSR1YGR159C 1245 nt17.98■□□□□ 0.47
SPT10P35208 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.82■□□□□ 0.44
SPT10P35208 NOP1YDL014W 984 nt17.28■□□□□ 0.36
SPT10P35208 MDJ1YFL016C 1536 nt16.13■□□□□ 0.17
SPT10P35208 YKL036CYKL036C 393 nt15.85■□□□□ 0.13
SPT10P35208 SRX1YKL086W 384 nt15.07■□□□□ 0
SPT10P35208 Q0297Q0297 156 nt15.03■□□□□ -0
SPT10P35208 YJL027CYJL027C 417 nt14.92□□□□□ -0.02
SPT10P35208 SCS3YGL126W 1143 nt14.44□□□□□ -0.1
SPT10P35208 YCR051WYCR051W 669 nt14.24□□□□□ -0.13
SPT10P35208 DBP2YNL112W 1641 nt14.18□□□□□ -0.14
SPT10P35208 YBR190WYBR190W 312 nt13.89□□□□□ -0.19
SPT10P35208 SSA3YBL075C 1950 nt13.8□□□□□ -0.2
SPT10P35208 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.78□□□□□ -0.2
SPT10P35208 YOL085CYOL085C 342 nt13.71□□□□□ -0.21
SPT10P35208 CCC1YLR220W 969 nt13.58□□□□□ -0.24
SPT10P35208 RTC3YHR087W 336 nt13.52□□□□□ -0.25
SPT10P35208 PKP1YIL042C 1185 nt13.49□□□□□ -0.25
SPT10P35208 RPP1BYDL130W 321 nt13.47□□□□□ -0.25
SPT10P35208 RVS167YDR388W 1449 nt13.34□□□□□ -0.27
SPT10P35208 SCJ1YMR214W 1134 nt13.15□□□□□ -0.3
SPT10P35208 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.93□□□□□ -0.34
SPT10P35208 ATS1YAL020C 1002 nt12.9□□□□□ -0.34
SPT10P35208 PET122YER153C 765 nt12.88□□□□□ -0.35
SPT10P35208 SHR5YOL110W 714 nt12.81□□□□□ -0.36
SPT10P35208 PUT4YOR348C 1884 nt12.77□□□□□ -0.37
SPT10P35208 SCR1SCR1 522 nt12.75□□□□□ -0.37
SPT10P35208 URN1YPR152C 1398 nt12.57□□□□□ -0.4
SPT10P35208 YDJ1YNL064C 1230 nt12.55□□□□□ -0.4
SPT10P35208 RRN5YLR141W 1092 nt12.48□□□□□ -0.41
SPT10P35208 OPI9YLR338W 858 nt12.47□□□□□ -0.41
SPT10P35208 ARE1YCR048W 1833 nt12.46□□□□□ -0.42
SPT10P35208 DEP1YAL013W 1218 nt12.45□□□□□ -0.42
SPT10P35208 SAH1YER043C 1350 nt12.41□□□□□ -0.42
SPT10P35208 RPN10YHR200W 807 nt12.39□□□□□ -0.43
SPT10P35208 POA1YBR022W 534 nt12.33□□□□□ -0.44
SPT10P35208 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.3□□□□□ -0.44
SPT10P35208 YNL208WYNL208W 600 nt12.3□□□□□ -0.44
SPT10P35208 GAR1YHR089C 618 nt12.26□□□□□ -0.45
SPT10P35208 RSB1YOR049C 1065 nt12.25□□□□□ -0.45
SPT10P35208 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.24□□□□□ -0.45
SPT10P35208 PUN1YLR414C 792 nt12.13□□□□□ -0.47
SPT10P35208 BSC6YOL137W 1494 nt12.13□□□□□ -0.47
SPT10P35208 YJR018WYJR018W 363 nt11.99□□□□□ -0.49
SPT10P35208 BUD23YCR047C 828 nt11.98□□□□□ -0.49
SPT10P35208 PTC2YER089C 1395 nt11.97□□□□□ -0.49
SPT10P35208 PST2YDR032C 597 nt11.94□□□□□ -0.5
SPT10P35208 NAB2YGL122C 1578 nt11.88□□□□□ -0.51
SPT10P35208 TIR1YER011W 765 nt11.88□□□□□ -0.51
SPT10P35208 SSA1YAL005C 1929 nt11.76□□□□□ -0.53
SPT10P35208 SPT5YML010W 3192 nt11.74□□□□□ -0.53
SPT10P35208 YJR120WYJR120W 351 nt11.72□□□□□ -0.53
SPT10P35208 NVJ2YPR091C 2313 nt11.72□□□□□ -0.53
SPT10P35208 RPP2BYDR382W 333 nt11.71□□□□□ -0.53
SPT10P35208 PAC11YDR488C 1602 nt11.7□□□□□ -0.54
SPT10P35208 DAL1YIR027C 1383 nt11.68□□□□□ -0.54
SPT10P35208 FIS1YIL065C 468 nt11.68□□□□□ -0.54
SPT10P35208 INM2YDR287W 879 nt11.63□□□□□ -0.55
SPT10P35208 SSA4YER103W 1929 nt11.62□□□□□ -0.55
SPT10P35208 FPR4YLR449W 1179 nt11.6□□□□□ -0.55
SPT10P35208 PHO4YFR034C 939 nt11.56□□□□□ -0.56
SPT10P35208 FPS1YLL043W 2010 nt11.52□□□□□ -0.56
SPT10P35208 YKL097CYKL097C 411 nt11.51□□□□□ -0.57
SPT10P35208 SRB2YHR041C 633 nt11.46□□□□□ -0.57
SPT10P35208 SHU1YHL006C 453 nt11.45□□□□□ -0.58
SPT10P35208 YBL100CYBL100C 315 nt11.45□□□□□ -0.58
SPT10P35208 MEP2YNL142W 1500 nt11.42□□□□□ -0.58
SPT10P35208 BDH2YAL061W 1254 nt11.42□□□□□ -0.58
SPT10P35208 YPS1YLR120C 1710 nt11.42□□□□□ -0.58
SPT10P35208 BDF1YLR399C 2061 nt11.4□□□□□ -0.58
SPT10P35208 Q0182Q0182 405 nt11.39□□□□□ -0.59
SPT10P35208 YDR095CYDR095C 411 nt11.33□□□□□ -0.6
SPT10P35208 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.31□□□□□ -0.6
SPT10P35208 FUN26YAL022C 1554 nt11.29□□□□□ -0.6
SPT10P35208 WWM1YFL010C 636 nt11.28□□□□□ -0.6
SPT10P35208 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.25□□□□□ -0.61
SPT10P35208 LSM3YLR438C-A 270 nt11.24□□□□□ -0.61
SPT10P35208 TRM9YML014W 840 nt11.24□□□□□ -0.61
SPT10P35208 YGR021WYGR021W 873 nt11.22□□□□□ -0.61
SPT10P35208 ALF1YNL148C 765 nt11.21□□□□□ -0.61
SPT10P35208 TAT1YBR069C 1860 nt11.2□□□□□ -0.62
SPT10P35208 DCW1YKL046C 1350 nt11.19□□□□□ -0.62
SPT10P35208 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.16□□□□□ -0.62
SPT10P35208 CCT6YDR188W 1641 nt11.15□□□□□ -0.62
SPT10P35208 HOM6YJR139C 1080 nt11.12□□□□□ -0.63
SPT10P35208 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.11□□□□□ -0.63
SPT10P35208 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.11□□□□□ -0.63
SPT10P35208 RPP2AYOL039W 321 nt11.11□□□□□ -0.63
SPT10P35208 EMI2YDR516C 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
SPT10P35208 YMR090WYMR090W 684 nt11.08□□□□□ -0.64
SPT10P35208 PTP1YDL230W 1008 nt11.06□□□□□ -0.64
SPT10P35208 MNP1YGL068W 585 nt11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms