Protein–RNA interactions for Protein: P47072

YJL016W, Uncharacterized protein YJL016W, yeastyeast

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL016WP47072 NSR1YGR159C 1245 nt17.77■□□□□ 0.44
YJL016WP47072 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.65■□□□□ 0.42
YJL016WP47072 NOP1YDL014W 984 nt17.2■□□□□ 0.34
YJL016WP47072 MDJ1YFL016C 1536 nt15.78■□□□□ 0.12
YJL016WP47072 YKL036CYKL036C 393 nt15.7■□□□□ 0.1
YJL016WP47072 Q0297Q0297 156 nt15.01□□□□□ -0.01
YJL016WP47072 SRX1YKL086W 384 nt15.01□□□□□ -0.01
YJL016WP47072 YJL027CYJL027C 417 nt14.62□□□□□ -0.07
YJL016WP47072 SCS3YGL126W 1143 nt14.18□□□□□ -0.14
YJL016WP47072 YCR051WYCR051W 669 nt14.14□□□□□ -0.15
YJL016WP47072 DBP2YNL112W 1641 nt13.96□□□□□ -0.17
YJL016WP47072 SSA3YBL075C 1950 nt13.95□□□□□ -0.18
YJL016WP47072 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.65□□□□□ -0.22
YJL016WP47072 YBR190WYBR190W 312 nt13.6□□□□□ -0.23
YJL016WP47072 YOL085CYOL085C 342 nt13.58□□□□□ -0.24
YJL016WP47072 RPP1BYDL130W 321 nt13.44□□□□□ -0.26
YJL016WP47072 CCC1YLR220W 969 nt13.39□□□□□ -0.27
YJL016WP47072 PKP1YIL042C 1185 nt13.29□□□□□ -0.28
YJL016WP47072 RTC3YHR087W 336 nt13.2□□□□□ -0.3
YJL016WP47072 RVS167YDR388W 1449 nt13.14□□□□□ -0.31
YJL016WP47072 SCJ1YMR214W 1134 nt12.97□□□□□ -0.33
YJL016WP47072 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.84□□□□□ -0.35
YJL016WP47072 PET122YER153C 765 nt12.81□□□□□ -0.36
YJL016WP47072 SCR1SCR1 522 nt12.69□□□□□ -0.38
YJL016WP47072 ATS1YAL020C 1002 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL016WP47072 SHR5YOL110W 714 nt12.65□□□□□ -0.38
YJL016WP47072 YDJ1YNL064C 1230 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL016WP47072 PUT4YOR348C 1884 nt12.43□□□□□ -0.42
YJL016WP47072 RRN5YLR141W 1092 nt12.41□□□□□ -0.42
YJL016WP47072 URN1YPR152C 1398 nt12.32□□□□□ -0.44
YJL016WP47072 OPI9YLR338W 858 nt12.23□□□□□ -0.45
YJL016WP47072 RPN10YHR200W 807 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL016WP47072 DEP1YAL013W 1218 nt12.2□□□□□ -0.46
YJL016WP47072 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.19□□□□□ -0.46
YJL016WP47072 ARE1YCR048W 1833 nt12.14□□□□□ -0.47
YJL016WP47072 YNL208WYNL208W 600 nt12.13□□□□□ -0.47
YJL016WP47072 GAR1YHR089C 618 nt12.12□□□□□ -0.47
YJL016WP47072 SAH1YER043C 1350 nt12.11□□□□□ -0.47
YJL016WP47072 RSB1YOR049C 1065 nt12.11□□□□□ -0.47
YJL016WP47072 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.97□□□□□ -0.49
YJL016WP47072 POA1YBR022W 534 nt11.96□□□□□ -0.49
YJL016WP47072 SSA4YER103W 1929 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL016WP47072 SPT5YML010W 3192 nt11.91□□□□□ -0.5
YJL016WP47072 PUN1YLR414C 792 nt11.9□□□□□ -0.5
YJL016WP47072 YJR018WYJR018W 363 nt11.77□□□□□ -0.53
YJL016WP47072 BSC6YOL137W 1494 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL016WP47072 PST2YDR032C 597 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL016WP47072 TIR1YER011W 765 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL016WP47072 PAC11YDR488C 1602 nt11.74□□□□□ -0.53
YJL016WP47072 PTC2YER089C 1395 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL016WP47072 BDF1YLR399C 2061 nt11.67□□□□□ -0.54
YJL016WP47072 NVJ2YPR091C 2313 nt11.64□□□□□ -0.55
YJL016WP47072 BUD23YCR047C 828 nt11.63□□□□□ -0.55
YJL016WP47072 SSA1YAL005C 1929 nt11.62□□□□□ -0.55
YJL016WP47072 NAB2YGL122C 1578 nt11.62□□□□□ -0.55
YJL016WP47072 YJR120WYJR120W 351 nt11.54□□□□□ -0.56
YJL016WP47072 RPP2BYDR382W 333 nt11.52□□□□□ -0.57
YJL016WP47072 TAT1YBR069C 1860 nt11.48□□□□□ -0.57
YJL016WP47072 DAL1YIR027C 1383 nt11.44□□□□□ -0.58
YJL016WP47072 FIS1YIL065C 468 nt11.43□□□□□ -0.58
YJL016WP47072 INM2YDR287W 879 nt11.42□□□□□ -0.58
YJL016WP47072 SRB2YHR041C 633 nt11.34□□□□□ -0.59
YJL016WP47072 PHO4YFR034C 939 nt11.31□□□□□ -0.6
YJL016WP47072 FPR4YLR449W 1179 nt11.3□□□□□ -0.6
YJL016WP47072 BDH2YAL061W 1254 nt11.28□□□□□ -0.6
YJL016WP47072 FPS1YLL043W 2010 nt11.26□□□□□ -0.61
YJL016WP47072 SHU1YHL006C 453 nt11.26□□□□□ -0.61
YJL016WP47072 YBL100CYBL100C 315 nt11.24□□□□□ -0.61
YJL016WP47072 YKL097CYKL097C 411 nt11.2□□□□□ -0.62
YJL016WP47072 YGR021WYGR021W 873 nt11.18□□□□□ -0.62
YJL016WP47072 WWM1YFL010C 636 nt11.17□□□□□ -0.62
YJL016WP47072 YPS1YLR120C 1710 nt11.15□□□□□ -0.62
YJL016WP47072 LSM3YLR438C-A 270 nt11.14□□□□□ -0.63
YJL016WP47072 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.1□□□□□ -0.63
YJL016WP47072 FUN26YAL022C 1554 nt11.1□□□□□ -0.63
YJL016WP47072 HOM6YJR139C 1080 nt11.09□□□□□ -0.63
YJL016WP47072 MEP2YNL142W 1500 nt11.09□□□□□ -0.63
YJL016WP47072 YDR095CYDR095C 411 nt11.08□□□□□ -0.64
YJL016WP47072 TRM9YML014W 840 nt11.06□□□□□ -0.64
YJL016WP47072 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.05□□□□□ -0.64
YJL016WP47072 CCT6YDR188W 1641 nt11□□□□□ -0.65
YJL016WP47072 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11□□□□□ -0.65
YJL016WP47072 ALF1YNL148C 765 nt10.97□□□□□ -0.65
YJL016WP47072 MNP1YGL068W 585 nt10.93□□□□□ -0.66
YJL016WP47072 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.93□□□□□ -0.66
YJL016WP47072 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.93□□□□□ -0.66
YJL016WP47072 RKM5YLR137W 1104 nt10.92□□□□□ -0.66
YJL016WP47072 RPP2AYOL039W 321 nt10.86□□□□□ -0.67
YJL016WP47072 YJL225CYJL225C 5277 nt10.86□□□□□ -0.67
YJL016WP47072 SIS1YNL007C 1059 nt10.85□□□□□ -0.67
YJL016WP47072 DCW1YKL046C 1350 nt10.84□□□□□ -0.67
YJL016WP47072 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.83□□□□□ -0.68
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