Protein–RNA interactions for Protein: P40317

SOK1, Protein SOK1, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK1P40317 NSR1YGR159C 1245 nt18.67■□□□□ 0.58
SOK1P40317 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.58■□□□□ 0.56
SOK1P40317 NOP1YDL014W 984 nt18.2■□□□□ 0.5
SOK1P40317 MDJ1YFL016C 1536 nt16.98■□□□□ 0.31
SOK1P40317 YKL036CYKL036C 393 nt16.81■□□□□ 0.28
SOK1P40317 Q0297Q0297 156 nt15.9■□□□□ 0.14
SOK1P40317 SRX1YKL086W 384 nt15.83■□□□□ 0.12
SOK1P40317 YJL027CYJL027C 417 nt15.7■□□□□ 0.1
SOK1P40317 SCS3YGL126W 1143 nt15.29■□□□□ 0.04
SOK1P40317 YCR051WYCR051W 669 nt15.02■□□□□ -0
SOK1P40317 DBP2YNL112W 1641 nt14.88□□□□□ -0.03
SOK1P40317 YBR190WYBR190W 312 nt14.61□□□□□ -0.07
SOK1P40317 YOL085CYOL085C 342 nt14.53□□□□□ -0.08
SOK1P40317 RPP1BYDL130W 321 nt14.27□□□□□ -0.13
SOK1P40317 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 PKP1YIL042C 1185 nt14.24□□□□□ -0.13
SOK1P40317 RTC3YHR087W 336 nt14.23□□□□□ -0.13
SOK1P40317 SSA3YBL075C 1950 nt14.16□□□□□ -0.14
SOK1P40317 CCC1YLR220W 969 nt14.08□□□□□ -0.16
SOK1P40317 RVS167YDR388W 1449 nt13.82□□□□□ -0.2
SOK1P40317 SCJ1YMR214W 1134 nt13.75□□□□□ -0.21
SOK1P40317 ATS1YAL020C 1002 nt13.72□□□□□ -0.21
SOK1P40317 PUT4YOR348C 1884 nt13.63□□□□□ -0.23
SOK1P40317 PET122YER153C 765 nt13.56□□□□□ -0.24
SOK1P40317 SCR1SCR1 522 nt13.55□□□□□ -0.24
SOK1P40317 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.51□□□□□ -0.25
SOK1P40317 SHR5YOL110W 714 nt13.27□□□□□ -0.29
SOK1P40317 ARE1YCR048W 1833 nt13.25□□□□□ -0.29
SOK1P40317 RRN5YLR141W 1092 nt13.19□□□□□ -0.3
SOK1P40317 URN1YPR152C 1398 nt13.17□□□□□ -0.3
SOK1P40317 POA1YBR022W 534 nt13.15□□□□□ -0.3
SOK1P40317 SAH1YER043C 1350 nt13.12□□□□□ -0.31
SOK1P40317 YDJ1YNL064C 1230 nt13.1□□□□□ -0.31
SOK1P40317 OPI9YLR338W 858 nt13.09□□□□□ -0.31
SOK1P40317 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.04□□□□□ -0.32
SOK1P40317 DEP1YAL013W 1218 nt13.03□□□□□ -0.32
SOK1P40317 RSB1YOR049C 1065 nt12.97□□□□□ -0.33
SOK1P40317 BSC6YOL137W 1494 nt12.96□□□□□ -0.34
SOK1P40317 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.94□□□□□ -0.34
SOK1P40317 RPN10YHR200W 807 nt12.85□□□□□ -0.35
SOK1P40317 YNL208WYNL208W 600 nt12.79□□□□□ -0.36
SOK1P40317 SPT5YML010W 3192 nt12.76□□□□□ -0.37
SOK1P40317 GAR1YHR089C 618 nt12.75□□□□□ -0.37
SOK1P40317 BUD23YCR047C 828 nt12.69□□□□□ -0.38
SOK1P40317 PST2YDR032C 597 nt12.69□□□□□ -0.38
SOK1P40317 PUN1YLR414C 792 nt12.69□□□□□ -0.38
SOK1P40317 PTC2YER089C 1395 nt12.61□□□□□ -0.39
SOK1P40317 YJR018WYJR018W 363 nt12.54□□□□□ -0.4
SOK1P40317 NAB2YGL122C 1578 nt12.52□□□□□ -0.41
SOK1P40317 SSA4YER103W 1929 nt12.47□□□□□ -0.41
SOK1P40317 TIR1YER011W 765 nt12.34□□□□□ -0.43
SOK1P40317 FIS1YIL065C 468 nt12.31□□□□□ -0.44
SOK1P40317 YJR120WYJR120W 351 nt12.3□□□□□ -0.44
SOK1P40317 YKL097CYKL097C 411 nt12.26□□□□□ -0.45
SOK1P40317 DAL1YIR027C 1383 nt12.26□□□□□ -0.45
SOK1P40317 SSA1YAL005C 1929 nt12.23□□□□□ -0.45
SOK1P40317 MEP2YNL142W 1500 nt12.21□□□□□ -0.45
SOK1P40317 FPR4YLR449W 1179 nt12.19□□□□□ -0.46
SOK1P40317 INM2YDR287W 879 nt12.16□□□□□ -0.46
SOK1P40317 PHO4YFR034C 939 nt12.15□□□□□ -0.46
SOK1P40317 RPP2BYDR382W 333 nt12.14□□□□□ -0.47
SOK1P40317 SHU1YHL006C 453 nt12.12□□□□□ -0.47
SOK1P40317 YPS1YLR120C 1710 nt12.09□□□□□ -0.47
SOK1P40317 BDF1YLR399C 2061 nt12.06□□□□□ -0.48
SOK1P40317 DCW1YKL046C 1350 nt12.02□□□□□ -0.49
SOK1P40317 SRB2YHR041C 633 nt11.97□□□□□ -0.49
SOK1P40317 YBL100CYBL100C 315 nt11.96□□□□□ -0.49
SOK1P40317 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.95□□□□□ -0.5
SOK1P40317 YDR095CYDR095C 411 nt11.94□□□□□ -0.5
SOK1P40317 TAT1YBR069C 1860 nt11.88□□□□□ -0.51
SOK1P40317 PAC11YDR488C 1602 nt11.87□□□□□ -0.51
SOK1P40317 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.87□□□□□ -0.51
SOK1P40317 BDH2YAL061W 1254 nt11.85□□□□□ -0.51
SOK1P40317 EMI2YDR516C 1503 nt11.84□□□□□ -0.51
SOK1P40317 YGR021WYGR021W 873 nt11.83□□□□□ -0.52
SOK1P40317 FUN26YAL022C 1554 nt11.81□□□□□ -0.52
SOK1P40317 YBR220CYBR220C 1683 nt11.8□□□□□ -0.52
SOK1P40317 YMR090WYMR090W 684 nt11.77□□□□□ -0.53
SOK1P40317 WWM1YFL010C 636 nt11.76□□□□□ -0.53
SOK1P40317 PTP1YDL230W 1008 nt11.75□□□□□ -0.53
SOK1P40317 CAC2YML102W 1407 nt11.72□□□□□ -0.53
SOK1P40317 YDL221WYDL221W 552 nt11.72□□□□□ -0.53
SOK1P40317 HOM6YJR139C 1080 nt11.71□□□□□ -0.53
SOK1P40317 RPP2AYOL039W 321 nt11.71□□□□□ -0.53
SOK1P40317 ALF1YNL148C 765 nt11.7□□□□□ -0.54
SOK1P40317 TRM9YML014W 840 nt11.69□□□□□ -0.54
SOK1P40317 YOR139CYOR139C 393 nt11.67□□□□□ -0.54
SOK1P40317 SDH1YKL148C 1923 nt11.66□□□□□ -0.54
SOK1P40317 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.65□□□□□ -0.54
SOK1P40317 NPL3YDR432W 1245 nt11.64□□□□□ -0.55
SOK1P40317 LSM3YLR438C-A 270 nt11.63□□□□□ -0.55
SOK1P40317 CCT6YDR188W 1641 nt11.62□□□□□ -0.55
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