Protein–RNA interactions for Protein: P53628

SNF12, Transcription regulatory protein SNF12, yeastyeast

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF12P53628 NSR1YGR159C 1245 nt18.69■□□□□ 0.58
SNF12P53628 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.41■□□□□ 0.54
SNF12P53628 NOP1YDL014W 984 nt17.75■□□□□ 0.43
SNF12P53628 MDJ1YFL016C 1536 nt17.06■□□□□ 0.32
SNF12P53628 YKL036CYKL036C 393 nt16.33■□□□□ 0.2
SNF12P53628 YJL027CYJL027C 417 nt15.64■□□□□ 0.09
SNF12P53628 Q0297Q0297 156 nt15.55■□□□□ 0.08
SNF12P53628 SRX1YKL086W 384 nt15.53■□□□□ 0.08
SNF12P53628 DBP2YNL112W 1641 nt14.96□□□□□ -0.01
SNF12P53628 SCS3YGL126W 1143 nt14.84□□□□□ -0.03
SNF12P53628 YCR051WYCR051W 669 nt14.7□□□□□ -0.06
SNF12P53628 YBR190WYBR190W 312 nt14.63□□□□□ -0.07
SNF12P53628 SSA3YBL075C 1950 nt14.36□□□□□ -0.11
SNF12P53628 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SNF12P53628 RTC3YHR087W 336 nt14.24□□□□□ -0.13
SNF12P53628 YOL085CYOL085C 342 nt14.15□□□□□ -0.14
SNF12P53628 CCC1YLR220W 969 nt14.11□□□□□ -0.15
SNF12P53628 RPP1BYDL130W 321 nt13.94□□□□□ -0.18
SNF12P53628 PKP1YIL042C 1185 nt13.93□□□□□ -0.18
SNF12P53628 RVS167YDR388W 1449 nt13.82□□□□□ -0.2
SNF12P53628 SCJ1YMR214W 1134 nt13.78□□□□□ -0.2
SNF12P53628 PUT4YOR348C 1884 nt13.7□□□□□ -0.22
SNF12P53628 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.36□□□□□ -0.27
SNF12P53628 PET122YER153C 765 nt13.33□□□□□ -0.28
SNF12P53628 ARE1YCR048W 1833 nt13.31□□□□□ -0.28
SNF12P53628 SHR5YOL110W 714 nt13.29□□□□□ -0.28
SNF12P53628 ATS1YAL020C 1002 nt13.25□□□□□ -0.29
SNF12P53628 URN1YPR152C 1398 nt13.21□□□□□ -0.29
SNF12P53628 POA1YBR022W 534 nt13.2□□□□□ -0.3
SNF12P53628 SAH1YER043C 1350 nt13.17□□□□□ -0.3
SNF12P53628 SCR1SCR1 522 nt13.15□□□□□ -0.3
SNF12P53628 OPI9YLR338W 858 nt13.13□□□□□ -0.31
SNF12P53628 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.1□□□□□ -0.31
SNF12P53628 DEP1YAL013W 1218 nt13.09□□□□□ -0.31
SNF12P53628 BSC6YOL137W 1494 nt13□□□□□ -0.33
SNF12P53628 RRN5YLR141W 1092 nt12.93□□□□□ -0.34
SNF12P53628 YDJ1YNL064C 1230 nt12.91□□□□□ -0.34
SNF12P53628 SPT5YML010W 3192 nt12.84□□□□□ -0.35
SNF12P53628 RPN10YHR200W 807 nt12.83□□□□□ -0.36
SNF12P53628 YNL208WYNL208W 600 nt12.79□□□□□ -0.36
SNF12P53628 BUD23YCR047C 828 nt12.74□□□□□ -0.37
SNF12P53628 GAR1YHR089C 618 nt12.71□□□□□ -0.37
SNF12P53628 PUN1YLR414C 792 nt12.7□□□□□ -0.38
SNF12P53628 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.68□□□□□ -0.38
SNF12P53628 PTC2YER089C 1395 nt12.65□□□□□ -0.38
SNF12P53628 RSB1YOR049C 1065 nt12.64□□□□□ -0.39
SNF12P53628 SSA4YER103W 1929 nt12.59□□□□□ -0.39
SNF12P53628 YJR018WYJR018W 363 nt12.57□□□□□ -0.4
SNF12P53628 NAB2YGL122C 1578 nt12.53□□□□□ -0.4
SNF12P53628 Q0182Q0182 405 nt12.42□□□□□ -0.42
SNF12P53628 YJR120WYJR120W 351 nt12.37□□□□□ -0.43
SNF12P53628 FIS1YIL065C 468 nt12.36□□□□□ -0.43
SNF12P53628 TIR1YER011W 765 nt12.3□□□□□ -0.44
SNF12P53628 SSA1YAL005C 1929 nt12.3□□□□□ -0.44
SNF12P53628 PST2YDR032C 597 nt12.29□□□□□ -0.44
SNF12P53628 DAL1YIR027C 1383 nt12.29□□□□□ -0.44
SNF12P53628 MEP2YNL142W 1500 nt12.26□□□□□ -0.45
SNF12P53628 FPR4YLR449W 1179 nt12.22□□□□□ -0.45
SNF12P53628 PHO4YFR034C 939 nt12.19□□□□□ -0.46
SNF12P53628 BDF1YLR399C 2061 nt12.17□□□□□ -0.46
SNF12P53628 INM2YDR287W 879 nt12.15□□□□□ -0.46
SNF12P53628 RPP2BYDR382W 333 nt12.13□□□□□ -0.47
SNF12P53628 YPS1YLR120C 1710 nt12.13□□□□□ -0.47
SNF12P53628 DCW1YKL046C 1350 nt12.08□□□□□ -0.48
SNF12P53628 SRB2YHR041C 633 nt12.07□□□□□ -0.48
SNF12P53628 TAT1YBR069C 1860 nt12□□□□□ -0.49
SNF12P53628 PAC11YDR488C 1602 nt11.99□□□□□ -0.49
SNF12P53628 YDR095CYDR095C 411 nt11.98□□□□□ -0.49
SNF12P53628 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.98□□□□□ -0.49
SNF12P53628 YBL100CYBL100C 315 nt11.98□□□□□ -0.49
SNF12P53628 EMI2YDR516C 1503 nt11.88□□□□□ -0.51
SNF12P53628 BDH2YAL061W 1254 nt11.88□□□□□ -0.51
SNF12P53628 YBR220CYBR220C 1683 nt11.84□□□□□ -0.51
SNF12P53628 FUN26YAL022C 1554 nt11.84□□□□□ -0.51
SNF12P53628 PTP1YDL230W 1008 nt11.8□□□□□ -0.52
SNF12P53628 SHU1YHL006C 453 nt11.8□□□□□ -0.52
SNF12P53628 CAC2YML102W 1407 nt11.79□□□□□ -0.52
SNF12P53628 YDL221WYDL221W 552 nt11.75□□□□□ -0.53
SNF12P53628 YKL097CYKL097C 411 nt11.75□□□□□ -0.53
SNF12P53628 YMR090WYMR090W 684 nt11.75□□□□□ -0.53
SNF12P53628 RPP2AYOL039W 321 nt11.73□□□□□ -0.53
SNF12P53628 SDH1YKL148C 1923 nt11.71□□□□□ -0.53
SNF12P53628 WWM1YFL010C 636 nt11.71□□□□□ -0.53
SNF12P53628 ALF1YNL148C 765 nt11.71□□□□□ -0.53
SNF12P53628 TRM9YML014W 840 nt11.7□□□□□ -0.54
SNF12P53628 MOT3YMR070W 1473 nt11.66□□□□□ -0.54
SNF12P53628 CCT6YDR188W 1641 nt11.64□□□□□ -0.55
SNF12P53628 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.63□□□□□ -0.55
SNF12P53628 NVJ2YPR091C 2313 nt11.63□□□□□ -0.55
SNF12P53628 LSM3YLR438C-A 270 nt11.62□□□□□ -0.55
SNF12P53628 SIS1YNL007C 1059 nt11.61□□□□□ -0.55
SNF12P53628 IRC15YPL017C 1500 nt11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.7 ms