RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	NUR1	Q12066	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YOR019W	Q99248	730 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YLR358C	O13565	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SWI6	P09959	803 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HSF1	P10961	833 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PHO3	P24031	467 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	NPP1	P25353	742 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	KIP1	P28742	1111 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	AFG2	P32794	780 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	KDX1	P36005	433 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	COS111	P38308	924 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SLX1	P38324	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	LAM1	P38851	1228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GIP4	P39732	760 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	OSW5	P40219	148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PSF2	P40359	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HFM1	P51979	1187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DAM1	P53267	343 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YNR068C	P53754	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	BSC5	P53755	489 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TOF1	P53840	1238 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	IRC4	Q03036	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	INP2	Q03824	705 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YHM2	Q04013	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	AIM32	Q04689	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SPH1	Q06160	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GGA1	Q06336	557 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RSC3	Q06639	885 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HUA2	Q12134	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	APC2	Q12440	853 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PCD1	Q12524	340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	FLO11	P08640	1367 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ADE8	P04161	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HMG1	P12683	1054 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ADK2	P26364	225 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YEL043W	P32618	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SUR1	P33300	382 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DAD2	P36162	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MRPL40	P36534	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	STV1	P37296	890 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SIF2	P38262	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	LYS14	P40971	790 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SSU1	P41930	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GSM1	P42950	618 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
KTR2	YKR061W	CTF18	P49956	741 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	VPS4	P52917	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SGF73	P53165	657 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MDR1	P53258	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YGR117C	P53270	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SSL2	Q00578	843 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ROD1	Q02805	837 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	LCD1	Q04377	747 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DCS2	Q12123	353 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HER1	Q12276	1246 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SKM1	Q12469	655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	APM4	Q99186	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	FIG2	P25653	1609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	POM152	P39685	1337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
KTR2	YKR061W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	OCA4	P25366	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MSP1	P28737	362 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	THI80	P35202	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	NNK1	P36003	928 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	LTP1	P40347	161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PKP1	P40530	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	INA22	P40576	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	THI6	P41835	540 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SNF12	P53628	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TOF2	Q02208	771 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ATP25	Q03153	612 aa		4.54	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YAP6	Q03935	383 aa		4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.1 ms