Protein–RNA interactions for Protein: P43535

GCN20, Protein GCN20, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN20P43535 NSR1YGR159C 1245 nt18.68■□□□□ 0.58
GCN20P43535 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.58■□□□□ 0.56
GCN20P43535 NOP1YDL014W 984 nt18.02■□□□□ 0.48
GCN20P43535 MDJ1YFL016C 1536 nt17.03■□□□□ 0.32
GCN20P43535 YKL036CYKL036C 393 nt16.43■□□□□ 0.22
GCN20P43535 SRX1YKL086W 384 nt15.74■□□□□ 0.11
GCN20P43535 Q0297Q0297 156 nt15.71■□□□□ 0.11
GCN20P43535 YJL027CYJL027C 417 nt15.62■□□□□ 0.09
GCN20P43535 SSA3YBL075C 1950 nt15.57■□□□□ 0.08
GCN20P43535 YCR051WYCR051W 669 nt14.88□□□□□ -0.03
GCN20P43535 SCS3YGL126W 1143 nt14.83□□□□□ -0.04
GCN20P43535 YBR190WYBR190W 312 nt14.76□□□□□ -0.05
GCN20P43535 DBP2YNL112W 1641 nt14.73□□□□□ -0.05
GCN20P43535 RTC3YHR087W 336 nt14.39□□□□□ -0.11
GCN20P43535 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.36□□□□□ -0.11
GCN20P43535 YOL085CYOL085C 342 nt14.22□□□□□ -0.13
GCN20P43535 CCC1YLR220W 969 nt14.15□□□□□ -0.14
GCN20P43535 PUT4YOR348C 1884 nt14.13□□□□□ -0.15
GCN20P43535 RPP1BYDL130W 321 nt14.08□□□□□ -0.16
GCN20P43535 PKP1YIL042C 1185 nt13.99□□□□□ -0.17
GCN20P43535 RVS167YDR388W 1449 nt13.84□□□□□ -0.19
GCN20P43535 SCJ1YMR214W 1134 nt13.7□□□□□ -0.22
GCN20P43535 POA1YBR022W 534 nt13.62□□□□□ -0.23
GCN20P43535 SSA4YER103W 1929 nt13.6□□□□□ -0.23
GCN20P43535 ARE1YCR048W 1833 nt13.58□□□□□ -0.24
GCN20P43535 SPT5YML010W 3192 nt13.57□□□□□ -0.24
GCN20P43535 BSC6YOL137W 1494 nt13.51□□□□□ -0.25
GCN20P43535 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.49□□□□□ -0.25
GCN20P43535 PET122YER153C 765 nt13.46□□□□□ -0.25
GCN20P43535 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.43□□□□□ -0.26
GCN20P43535 SHR5YOL110W 714 nt13.31□□□□□ -0.28
GCN20P43535 SCR1SCR1 522 nt13.29□□□□□ -0.28
GCN20P43535 SAH1YER043C 1350 nt13.28□□□□□ -0.28
GCN20P43535 ATS1YAL020C 1002 nt13.2□□□□□ -0.3
GCN20P43535 BDF1YLR399C 2061 nt13.17□□□□□ -0.3
GCN20P43535 URN1YPR152C 1398 nt13.11□□□□□ -0.31
GCN20P43535 OPI9YLR338W 858 nt13.11□□□□□ -0.31
GCN20P43535 YDJ1YNL064C 1230 nt13.08□□□□□ -0.32
GCN20P43535 BUD23YCR047C 828 nt13.04□□□□□ -0.32
GCN20P43535 RRN5YLR141W 1092 nt13.04□□□□□ -0.32
GCN20P43535 PAC11YDR488C 1602 nt13.02□□□□□ -0.32
GCN20P43535 TAT1YBR069C 1860 nt12.97□□□□□ -0.33
GCN20P43535 DEP1YAL013W 1218 nt12.94□□□□□ -0.34
GCN20P43535 RPN10YHR200W 807 nt12.84□□□□□ -0.35
GCN20P43535 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.79□□□□□ -0.36
GCN20P43535 GAR1YHR089C 618 nt12.78□□□□□ -0.36
GCN20P43535 MEP2YNL142W 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
GCN20P43535 YNL208WYNL208W 600 nt12.77□□□□□ -0.37
GCN20P43535 PTC2YER089C 1395 nt12.74□□□□□ -0.37
GCN20P43535 PUN1YLR414C 792 nt12.73□□□□□ -0.37
GCN20P43535 RSB1YOR049C 1065 nt12.72□□□□□ -0.37
GCN20P43535 NAB2YGL122C 1578 nt12.7□□□□□ -0.38
GCN20P43535 NVJ2YPR091C 2313 nt12.67□□□□□ -0.38
GCN20P43535 DCW1YKL046C 1350 nt12.56□□□□□ -0.4
GCN20P43535 YBR220CYBR220C 1683 nt12.46□□□□□ -0.41
GCN20P43535 FIS1YIL065C 468 nt12.44□□□□□ -0.42
GCN20P43535 YJR018WYJR018W 363 nt12.44□□□□□ -0.42
GCN20P43535 TIR1YER011W 765 nt12.37□□□□□ -0.43
GCN20P43535 EMI2YDR516C 1503 nt12.37□□□□□ -0.43
GCN20P43535 YMR090WYMR090W 684 nt12.36□□□□□ -0.43
GCN20P43535 DAL1YIR027C 1383 nt12.35□□□□□ -0.43
GCN20P43535 YPS1YLR120C 1710 nt12.34□□□□□ -0.43
GCN20P43535 FPR4YLR449W 1179 nt12.31□□□□□ -0.44
GCN20P43535 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.28□□□□□ -0.44
GCN20P43535 PST2YDR032C 597 nt12.26□□□□□ -0.45
GCN20P43535 PCH2YBR186W 1695 nt12.26□□□□□ -0.45
GCN20P43535 SSA1YAL005C 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
GCN20P43535 PHO4YFR034C 939 nt12.25□□□□□ -0.45
GCN20P43535 GUT2YIL155C 1950 nt12.22□□□□□ -0.45
GCN20P43535 SDH1YKL148C 1923 nt12.22□□□□□ -0.45
GCN20P43535 YDL221WYDL221W 552 nt12.19□□□□□ -0.46
GCN20P43535 YJR120WYJR120W 351 nt12.19□□□□□ -0.46
GCN20P43535 RPP2BYDR382W 333 nt12.15□□□□□ -0.46
GCN20P43535 SEC11YIR022W 504 nt12.15□□□□□ -0.46
GCN20P43535 INM2YDR287W 879 nt12.12□□□□□ -0.47
GCN20P43535 YDR095CYDR095C 411 nt12.11□□□□□ -0.47
GCN20P43535 YJL225CYJL225C 5277 nt12.03□□□□□ -0.48
GCN20P43535 FPS1YLL043W 2010 nt12.02□□□□□ -0.49
GCN20P43535 CAC2YML102W 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
GCN20P43535 SCC4YER147C 1875 nt12□□□□□ -0.49
GCN20P43535 PIB2YGL023C 1908 nt11.99□□□□□ -0.49
GCN20P43535 SRB2YHR041C 633 nt11.98□□□□□ -0.49
GCN20P43535 PTP1YDL230W 1008 nt11.93□□□□□ -0.5
GCN20P43535 RPP2AYOL039W 321 nt11.89□□□□□ -0.51
GCN20P43535 YBL100CYBL100C 315 nt11.87□□□□□ -0.51
GCN20P43535 BDH2YAL061W 1254 nt11.86□□□□□ -0.51
GCN20P43535 RTF1YGL244W 1677 nt11.86□□□□□ -0.51
GCN20P43535 IRC15YPL017C 1500 nt11.85□□□□□ -0.51
GCN20P43535 YSC84YHR016C 1407 nt11.85□□□□□ -0.51
GCN20P43535 SHU1YHL006C 453 nt11.8□□□□□ -0.52
GCN20P43535 GIS3YLR094C 1509 nt11.79□□□□□ -0.52
GCN20P43535 WWM1YFL010C 636 nt11.78□□□□□ -0.52
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