Protein–RNA interactions for Protein: Q12346

YPR071W, Uncharacterized membrane protein YPR071W, yeastyeast

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPR071WQ12346 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.76■□□□□ 0.27
YPR071WQ12346 NSR1YGR159C 1245 nt16.73■□□□□ 0.27
YPR071WQ12346 NOP1YDL014W 984 nt16.33■□□□□ 0.2
YPR071WQ12346 YKL036CYKL036C 393 nt15.01□□□□□ -0.01
YPR071WQ12346 MDJ1YFL016C 1536 nt14.82□□□□□ -0.04
YPR071WQ12346 Q0297Q0297 156 nt14.26□□□□□ -0.13
YPR071WQ12346 SRX1YKL086W 384 nt14.24□□□□□ -0.13
YPR071WQ12346 YJL027CYJL027C 417 nt13.99□□□□□ -0.17
YPR071WQ12346 Q0182Q0182 405 nt13.71□□□□□ -0.21
YPR071WQ12346 SCS3YGL126W 1143 nt13.61□□□□□ -0.23
YPR071WQ12346 YCR051WYCR051W 669 nt13.51□□□□□ -0.25
YPR071WQ12346 MOT3YMR070W 1473 nt13.37□□□□□ -0.27
YPR071WQ12346 DBP2YNL112W 1641 nt13.11□□□□□ -0.31
YPR071WQ12346 YOL085CYOL085C 342 nt12.99□□□□□ -0.33
YPR071WQ12346 TRN1tP(UGG)A 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 SUF9tP(UGG)F 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 SUF8tP(UGG)H 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 SUF7tP(UGG)M 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 SUF11tP(UGG)O2 72 nt12.88□□□□□ -0.35
YPR071WQ12346 RPP1BYDL130W 321 nt12.8□□□□□ -0.36
YPR071WQ12346 PKP1YIL042C 1185 nt12.77□□□□□ -0.37
YPR071WQ12346 CCC1YLR220W 969 nt12.75□□□□□ -0.37
YPR071WQ12346 YBR190WYBR190W 312 nt12.7□□□□□ -0.38
YPR071WQ12346 SSA3YBL075C 1950 nt12.54□□□□□ -0.4
YPR071WQ12346 SCJ1YMR214W 1134 nt12.51□□□□□ -0.41
YPR071WQ12346 RTC3YHR087W 336 nt12.4□□□□□ -0.42
YPR071WQ12346 RVS167YDR388W 1449 nt12.37□□□□□ -0.43
YPR071WQ12346 PET122YER153C 765 nt12.2□□□□□ -0.46
YPR071WQ12346 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.19□□□□□ -0.46
YPR071WQ12346 ATS1YAL020C 1002 nt12.18□□□□□ -0.46
YPR071WQ12346 SCR1SCR1 522 nt12.11□□□□□ -0.47
YPR071WQ12346 SHR5YOL110W 714 nt11.91□□□□□ -0.5
YPR071WQ12346 RRN5YLR141W 1092 nt11.86□□□□□ -0.51
YPR071WQ12346 PUT4YOR348C 1884 nt11.82□□□□□ -0.52
YPR071WQ12346 YDJ1YNL064C 1230 nt11.8□□□□□ -0.52
YPR071WQ12346 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.63□□□□□ -0.55
YPR071WQ12346 RSB1YOR049C 1065 nt11.61□□□□□ -0.55
YPR071WQ12346 URN1YPR152C 1398 nt11.59□□□□□ -0.55
YPR071WQ12346 DEP1YAL013W 1218 nt11.56□□□□□ -0.56
YPR071WQ12346 GAR1YHR089C 618 nt11.52□□□□□ -0.57
YPR071WQ12346 RPN10YHR200W 807 nt11.45□□□□□ -0.58
YPR071WQ12346 OPI9YLR338W 858 nt11.44□□□□□ -0.58
YPR071WQ12346 ARE1YCR048W 1833 nt11.42□□□□□ -0.58
YPR071WQ12346 YNL208WYNL208W 600 nt11.41□□□□□ -0.58
YPR071WQ12346 POA1YBR022W 534 nt11.4□□□□□ -0.58
YPR071WQ12346 SAH1YER043C 1350 nt11.35□□□□□ -0.59
YPR071WQ12346 PST2YDR032C 597 nt11.29□□□□□ -0.6
YPR071WQ12346 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.29□□□□□ -0.6
YPR071WQ12346 BSC6YOL137W 1494 nt11.28□□□□□ -0.6
YPR071WQ12346 SPT5YML010W 3192 nt11.17□□□□□ -0.62
YPR071WQ12346 TIR1YER011W 765 nt11.14□□□□□ -0.63
YPR071WQ12346 PUN1YLR414C 792 nt11.11□□□□□ -0.63
YPR071WQ12346 SSA4YER103W 1929 nt11.11□□□□□ -0.63
YPR071WQ12346 YJR018WYJR018W 363 nt11.07□□□□□ -0.64
YPR071WQ12346 NME1NME1 340 nt11.05□□□□□ -0.64
YPR071WQ12346 SSA1YAL005C 1929 nt10.99□□□□□ -0.65
YPR071WQ12346 BUD23YCR047C 828 nt10.99□□□□□ -0.65
YPR071WQ12346 PTC2YER089C 1395 nt10.96□□□□□ -0.65
YPR071WQ12346 YKL097CYKL097C 411 nt10.96□□□□□ -0.65
YPR071WQ12346 RPP2BYDR382W 333 nt10.86□□□□□ -0.67
YPR071WQ12346 NAB2YGL122C 1578 nt10.85□□□□□ -0.67
YPR071WQ12346 YJR120WYJR120W 351 nt10.84□□□□□ -0.67
YPR071WQ12346 SHU1YHL006C 453 nt10.82□□□□□ -0.68
YPR071WQ12346 SRB2YHR041C 633 nt10.76□□□□□ -0.69
YPR071WQ12346 BDF1YLR399C 2061 nt10.73□□□□□ -0.69
YPR071WQ12346 INM2YDR287W 879 nt10.7□□□□□ -0.7
YPR071WQ12346 DAL1YIR027C 1383 nt10.68□□□□□ -0.7
YPR071WQ12346 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.67□□□□□ -0.7
YPR071WQ12346 MEP2YNL142W 1500 nt10.65□□□□□ -0.7
YPR071WQ12346 FPR4YLR449W 1179 nt10.65□□□□□ -0.7
YPR071WQ12346 FIS1YIL065C 468 nt10.64□□□□□ -0.71
YPR071WQ12346 WWM1YFL010C 636 nt10.63□□□□□ -0.71
YPR071WQ12346 BDH2YAL061W 1254 nt10.62□□□□□ -0.71
YPR071WQ12346 YGR021WYGR021W 873 nt10.6□□□□□ -0.71
YPR071WQ12346 TAT1YBR069C 1860 nt10.58□□□□□ -0.72
YPR071WQ12346 PHO4YFR034C 939 nt10.58□□□□□ -0.72
YPR071WQ12346 YBL100CYBL100C 315 nt10.57□□□□□ -0.72
YPR071WQ12346 HOM6YJR139C 1080 nt10.53□□□□□ -0.72
YPR071WQ12346 LSM3YLR438C-A 270 nt10.5□□□□□ -0.73
YPR071WQ12346 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.49□□□□□ -0.73
YPR071WQ12346 DCW1YKL046C 1350 nt10.46□□□□□ -0.74
YPR071WQ12346 MNP1YGL068W 585 nt10.44□□□□□ -0.74
YPR071WQ12346 TRM9YML014W 840 nt10.44□□□□□ -0.74
YPR071WQ12346 FUN26YAL022C 1554 nt10.43□□□□□ -0.74
YPR071WQ12346 YPS1YLR120C 1710 nt10.41□□□□□ -0.74
YPR071WQ12346 PAC11YDR488C 1602 nt10.4□□□□□ -0.75
YPR071WQ12346 RKM5YLR137W 1104 nt10.38□□□□□ -0.75
YPR071WQ12346 YOR139CYOR139C 393 nt10.37□□□□□ -0.75
YPR071WQ12346 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.36□□□□□ -0.75
YPR071WQ12346 NPL3YDR432W 1245 nt10.33□□□□□ -0.76
YPR071WQ12346 YBR220CYBR220C 1683 nt10.33□□□□□ -0.76
YPR071WQ12346 YMR090WYMR090W 684 nt10.32□□□□□ -0.76
YPR071WQ12346 CCT6YDR188W 1641 nt10.32□□□□□ -0.76
YPR071WQ12346 EMI2YDR516C 1503 nt10.32□□□□□ -0.76
YPR071WQ12346 YDR095CYDR095C 411 nt10.31□□□□□ -0.76
YPR071WQ12346 ALF1YNL148C 765 nt10.31□□□□□ -0.76
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