Protein–RNA interactions for Protein: P28320

YJU2, Protein CWC16, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJU2P28320 NSR1YGR159C 1245 nt19.19■□□□□ 0.66
YJU2P28320 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.14■□□□□ 0.65
YJU2P28320 NOP1YDL014W 984 nt18.74■□□□□ 0.59
YJU2P28320 YKL036CYKL036C 393 nt17.38■□□□□ 0.37
YJU2P28320 MDJ1YFL016C 1536 nt16.92■□□□□ 0.3
YJU2P28320 Q0297Q0297 156 nt16.37■□□□□ 0.21
YJU2P28320 SRX1YKL086W 384 nt16.32■□□□□ 0.2
YJU2P28320 YJL027CYJL027C 417 nt16.27■□□□□ 0.2
YJU2P28320 SCS3YGL126W 1143 nt15.84■□□□□ 0.13
YJU2P28320 YCR051WYCR051W 669 nt15.5■□□□□ 0.07
YJU2P28320 YOL085CYOL085C 342 nt15□□□□□ -0.01
YJU2P28320 DBP2YNL112W 1641 nt14.95□□□□□ -0.02
YJU2P28320 SSA3YBL075C 1950 nt14.91□□□□□ -0.02
YJU2P28320 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.76□□□□□ -0.05
YJU2P28320 PKP1YIL042C 1185 nt14.74□□□□□ -0.05
YJU2P28320 RPP1BYDL130W 321 nt14.7□□□□□ -0.06
YJU2P28320 YBR190WYBR190W 312 nt14.59□□□□□ -0.07
YJU2P28320 CCC1YLR220W 969 nt14.5□□□□□ -0.09
YJU2P28320 SCJ1YMR214W 1134 nt14.32□□□□□ -0.12
YJU2P28320 ATS1YAL020C 1002 nt14.23□□□□□ -0.13
YJU2P28320 RVS167YDR388W 1449 nt14.22□□□□□ -0.13
YJU2P28320 RTC3YHR087W 336 nt14.18□□□□□ -0.14
YJU2P28320 SCR1SCR1 522 nt14□□□□□ -0.17
YJU2P28320 PET122YER153C 765 nt13.98□□□□□ -0.17
YJU2P28320 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.93□□□□□ -0.18
YJU2P28320 SHR5YOL110W 714 nt13.68□□□□□ -0.22
YJU2P28320 RRN5YLR141W 1092 nt13.61□□□□□ -0.23
YJU2P28320 YDJ1YNL064C 1230 nt13.55□□□□□ -0.24
YJU2P28320 RSB1YOR049C 1065 nt13.43□□□□□ -0.26
YJU2P28320 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.33□□□□□ -0.28
YJU2P28320 URN1YPR152C 1398 nt13.26□□□□□ -0.29
YJU2P28320 PUT4YOR348C 1884 nt13.19□□□□□ -0.3
YJU2P28320 RPN10YHR200W 807 nt13.19□□□□□ -0.3
YJU2P28320 DEP1YAL013W 1218 nt13.14□□□□□ -0.31
YJU2P28320 GAR1YHR089C 618 nt13.13□□□□□ -0.31
YJU2P28320 OPI9YLR338W 858 nt13.13□□□□□ -0.31
YJU2P28320 PST2YDR032C 597 nt13.12□□□□□ -0.31
YJU2P28320 YNL208WYNL208W 600 nt13.09□□□□□ -0.31
YJU2P28320 SAH1YER043C 1350 nt12.96□□□□□ -0.33
YJU2P28320 ARE1YCR048W 1833 nt12.92□□□□□ -0.34
YJU2P28320 PUN1YLR414C 792 nt12.8□□□□□ -0.36
YJU2P28320 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.78□□□□□ -0.36
YJU2P28320 YKL097CYKL097C 411 nt12.77□□□□□ -0.37
YJU2P28320 SSA4YER103W 1929 nt12.76□□□□□ -0.37
YJU2P28320 POA1YBR022W 534 nt12.75□□□□□ -0.37
YJU2P28320 TIR1YER011W 765 nt12.74□□□□□ -0.37
YJU2P28320 YJR018WYJR018W 363 nt12.67□□□□□ -0.38
YJU2P28320 PAC11YDR488C 1602 nt12.62□□□□□ -0.39
YJU2P28320 SPT5YML010W 3192 nt12.57□□□□□ -0.4
YJU2P28320 SHU1YHL006C 453 nt12.54□□□□□ -0.4
YJU2P28320 PTC2YER089C 1395 nt12.54□□□□□ -0.4
YJU2P28320 SSA1YAL005C 1929 nt12.53□□□□□ -0.4
YJU2P28320 BSC6YOL137W 1494 nt12.51□□□□□ -0.41
YJU2P28320 RPP2BYDR382W 333 nt12.48□□□□□ -0.41
YJU2P28320 BUD23YCR047C 828 nt12.46□□□□□ -0.41
YJU2P28320 NAB2YGL122C 1578 nt12.46□□□□□ -0.42
YJU2P28320 NVJ2YPR091C 2313 nt12.4□□□□□ -0.42
YJU2P28320 BDF1YLR399C 2061 nt12.39□□□□□ -0.43
YJU2P28320 YJR120WYJR120W 351 nt12.37□□□□□ -0.43
YJU2P28320 INM2YDR287W 879 nt12.31□□□□□ -0.44
YJU2P28320 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.29□□□□□ -0.44
YJU2P28320 DAL1YIR027C 1383 nt12.28□□□□□ -0.44
YJU2P28320 FIS1YIL065C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
YJU2P28320 TAT1YBR069C 1860 nt12.22□□□□□ -0.45
YJU2P28320 YGR021WYGR021W 873 nt12.19□□□□□ -0.46
YJU2P28320 SRB2YHR041C 633 nt12.19□□□□□ -0.46
YJU2P28320 BDH2YAL061W 1254 nt12.18□□□□□ -0.46
YJU2P28320 FPR4YLR449W 1179 nt12.15□□□□□ -0.46
YJU2P28320 PHO4YFR034C 939 nt12.12□□□□□ -0.47
YJU2P28320 NPL3YDR432W 1245 nt12.11□□□□□ -0.47
YJU2P28320 YBL100CYBL100C 315 nt12.11□□□□□ -0.47
YJU2P28320 YOR139CYOR139C 393 nt12.11□□□□□ -0.47
YJU2P28320 WWM1YFL010C 636 nt12.1□□□□□ -0.47
YJU2P28320 LSM3YLR438C-A 270 nt12.07□□□□□ -0.48
YJU2P28320 HOM6YJR139C 1080 nt12.06□□□□□ -0.48
YJU2P28320 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.05□□□□□ -0.48
YJU2P28320 MNP1YGL068W 585 nt12.01□□□□□ -0.49
YJU2P28320 FPS1YLL043W 2010 nt11.98□□□□□ -0.49
YJU2P28320 YOL037CYOL037C 354 nt11.97□□□□□ -0.49
YJU2P28320 Q0182Q0182 405 nt11.96□□□□□ -0.49
YJU2P28320 TRM9YML014W 840 nt11.96□□□□□ -0.49
YJU2P28320 FUN26YAL022C 1554 nt11.95□□□□□ -0.5
YJU2P28320 YPS1YLR120C 1710 nt11.91□□□□□ -0.5
YJU2P28320 RKM5YLR137W 1104 nt11.9□□□□□ -0.5
YJU2P28320 YDR095CYDR095C 411 nt11.86□□□□□ -0.51
YJU2P28320 CCT6YDR188W 1641 nt11.85□□□□□ -0.51
YJU2P28320 YJL225CYJL225C 5277 nt11.84□□□□□ -0.51
YJU2P28320 ALF1YNL148C 765 nt11.84□□□□□ -0.51
YJU2P28320 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.82□□□□□ -0.52
YJU2P28320 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.82□□□□□ -0.52
YJU2P28320 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.81□□□□□ -0.52
YJU2P28320 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.9 ms