RNA–Protein interactions for RNA: YJL050W

MTR4, Transcript of ATP-dependent 3'-5' RNA helicase of the DExD/H family, yeast

Gene MTR4, Length 3,222 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTR4	YJL050W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YKL023W	P36103	277 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ECM8	P38246	354 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YBR137W	P38276	179 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YBR138C	P38277	524 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	APM2	P38700	605 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	GAA1	P39012	614 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	EXO1	P39875	702 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TMN3	P40071	706 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YTA12	P40341	825 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	UBP7	P40453	1071 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CIT3	P43635	486 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ATH1	P48016	1211 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MSE1	P48525	536 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SNF12	P53628	566 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MRPS16	Q02608	121 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	FIN1	Q03898	291 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	UFO1	Q04511	668 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ARO10	Q06408	635 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	THI21	Q08975	551 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YLR125W	Q12138	136 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HSP42	Q12329	375 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RRD2	Q12461	358 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	FMP16	Q12497	93 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SEM1	O94742	89 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	COB	P00163	385 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BI4	P03879	638 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PMS1	P14242	873 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.53	□□□□□ -1.84	not detected
MTR4	YJL050W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CAD1	P24813	409 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CNB1	P25296	175 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TMT1	P32643	299 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PCA1	P38360	1216 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YEL020C	P39994	560 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	FTR1	P40088	404 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MSS2	P40990	351 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BRE2	P43132	505 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	LIF1	P53150	421 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YGR111W	P53265	400 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DIP5	P53388	608 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NSE5	Q03718	556 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YDR249C	Q03787	373 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	GIS4	Q04233	774 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PEX10	Q05568	337 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BMT6	Q12291	365 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RKM4	Q12504	494 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	AEP2	P22136	580 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SPC42	P36094	363 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TGL4	P36165	910 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SMF2	P38778	549 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YER186C	P40101	306 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	EMP47	P43555	445 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SFB2	P53953	876 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MMT1	Q03218	510 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TCB1	Q12466	1186 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	MED11	Q99278	115 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RPN13	O13563	156 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	HTA2	P04912	132 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ADP1	P25371	1049 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CSM1	P25651	190 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	PRR1	P28708	518 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ZIP1	P31111	875 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RRN6	P32786	894 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	RRN3	P36070	627 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ARN1	P38731	627 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	APS3	P47064	194 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CBK1	P53894	756 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SPC2	Q04969	178 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	SKG3	Q06315	1026 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	DXO1	Q06349	442 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	YPL216W	Q08964	1102 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	TY3A-G	Q12173	290 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MTR4	YJL050W	ATP14	Q12349	124 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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