Protein–RNA interactions for Protein: P25582

SPB1, 27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPB1P25582 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.33■□□□□ 0.68
SPB1P25582 NSR1YGR159C 1245 nt19.22■□□□□ 0.67
SPB1P25582 NOP1YDL014W 984 nt18.76■□□□□ 0.59
SPB1P25582 MDJ1YFL016C 1536 nt17.57■□□□□ 0.4
SPB1P25582 YKL036CYKL036C 393 nt17.3■□□□□ 0.36
SPB1P25582 Q0297Q0297 156 nt16.39■□□□□ 0.21
SPB1P25582 SRX1YKL086W 384 nt16.37■□□□□ 0.21
SPB1P25582 YJL027CYJL027C 417 nt16.17■□□□□ 0.18
SPB1P25582 SCS3YGL126W 1143 nt15.74■□□□□ 0.11
SPB1P25582 YCR051WYCR051W 669 nt15.59■□□□□ 0.09
SPB1P25582 DBP2YNL112W 1641 nt15.35■□□□□ 0.05
SPB1P25582 YBR190WYBR190W 312 nt15.08■□□□□ 0
SPB1P25582 YOL085CYOL085C 342 nt14.98□□□□□ -0.01
SPB1P25582 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.81□□□□□ -0.04
SPB1P25582 PKP1YIL042C 1185 nt14.8□□□□□ -0.04
SPB1P25582 RPP1BYDL130W 321 nt14.73□□□□□ -0.05
SPB1P25582 RTC3YHR087W 336 nt14.72□□□□□ -0.05
SPB1P25582 CCC1YLR220W 969 nt14.72□□□□□ -0.05
SPB1P25582 SSA3YBL075C 1950 nt14.37□□□□□ -0.11
SPB1P25582 RVS167YDR388W 1449 nt14.3□□□□□ -0.12
SPB1P25582 SCJ1YMR214W 1134 nt14.16□□□□□ -0.14
SPB1P25582 PUT4YOR348C 1884 nt14.1□□□□□ -0.15
SPB1P25582 PET122YER153C 765 nt14.09□□□□□ -0.15
SPB1P25582 ATS1YAL020C 1002 nt14.07□□□□□ -0.16
SPB1P25582 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.02□□□□□ -0.17
SPB1P25582 SCR1SCR1 522 nt13.94□□□□□ -0.18
SPB1P25582 ARE1YCR048W 1833 nt13.7□□□□□ -0.22
SPB1P25582 SHR5YOL110W 714 nt13.69□□□□□ -0.22
SPB1P25582 RRN5YLR141W 1092 nt13.68□□□□□ -0.22
SPB1P25582 URN1YPR152C 1398 nt13.61□□□□□ -0.23
SPB1P25582 POA1YBR022W 534 nt13.61□□□□□ -0.23
SPB1P25582 SAH1YER043C 1350 nt13.57□□□□□ -0.24
SPB1P25582 YDJ1YNL064C 1230 nt13.54□□□□□ -0.24
SPB1P25582 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.53□□□□□ -0.24
SPB1P25582 OPI9YLR338W 858 nt13.51□□□□□ -0.25
SPB1P25582 DEP1YAL013W 1218 nt13.47□□□□□ -0.25
SPB1P25582 BSC6YOL137W 1494 nt13.42□□□□□ -0.26
SPB1P25582 RSB1YOR049C 1065 nt13.42□□□□□ -0.26
SPB1P25582 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.4□□□□□ -0.26
SPB1P25582 GAR1YHR089C 618 nt13.29□□□□□ -0.28
SPB1P25582 RPN10YHR200W 807 nt13.27□□□□□ -0.29
SPB1P25582 YNL208WYNL208W 600 nt13.19□□□□□ -0.3
SPB1P25582 SPT5YML010W 3192 nt13.18□□□□□ -0.3
SPB1P25582 BUD23YCR047C 828 nt13.16□□□□□ -0.3
SPB1P25582 PUN1YLR414C 792 nt13.11□□□□□ -0.31
SPB1P25582 PTC2YER089C 1395 nt13.05□□□□□ -0.32
SPB1P25582 PST2YDR032C 597 nt13.02□□□□□ -0.33
SPB1P25582 SSA4YER103W 1929 nt12.94□□□□□ -0.34
SPB1P25582 YJR018WYJR018W 363 nt12.94□□□□□ -0.34
SPB1P25582 NAB2YGL122C 1578 nt12.94□□□□□ -0.34
SPB1P25582 TIR1YER011W 765 nt12.83□□□□□ -0.36
SPB1P25582 FIS1YIL065C 468 nt12.75□□□□□ -0.37
SPB1P25582 YJR120WYJR120W 351 nt12.68□□□□□ -0.38
SPB1P25582 DAL1YIR027C 1383 nt12.68□□□□□ -0.38
SPB1P25582 SSA1YAL005C 1929 nt12.67□□□□□ -0.38
SPB1P25582 MEP2YNL142W 1500 nt12.64□□□□□ -0.39
SPB1P25582 FPR4YLR449W 1179 nt12.64□□□□□ -0.39
SPB1P25582 PHO4YFR034C 939 nt12.58□□□□□ -0.4
SPB1P25582 Q0182Q0182 405 nt12.58□□□□□ -0.4
SPB1P25582 RPP2BYDR382W 333 nt12.55□□□□□ -0.4
SPB1P25582 INM2YDR287W 879 nt12.53□□□□□ -0.4
SPB1P25582 YKL097CYKL097C 411 nt12.53□□□□□ -0.4
SPB1P25582 SHU1YHL006C 453 nt12.51□□□□□ -0.41
SPB1P25582 YPS1YLR120C 1710 nt12.5□□□□□ -0.41
SPB1P25582 BDF1YLR399C 2061 nt12.49□□□□□ -0.41
SPB1P25582 SRB2YHR041C 633 nt12.46□□□□□ -0.41
SPB1P25582 DCW1YKL046C 1350 nt12.44□□□□□ -0.42
SPB1P25582 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.39□□□□□ -0.43
SPB1P25582 YBL100CYBL100C 315 nt12.37□□□□□ -0.43
SPB1P25582 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.35□□□□□ -0.43
SPB1P25582 YDR095CYDR095C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
SPB1P25582 TAT1YBR069C 1860 nt12.32□□□□□ -0.44
SPB1P25582 WWM1YFL010C 636 nt12.27□□□□□ -0.45
SPB1P25582 EMI2YDR516C 1503 nt12.26□□□□□ -0.45
SPB1P25582 BDH2YAL061W 1254 nt12.22□□□□□ -0.45
SPB1P25582 YBR220CYBR220C 1683 nt12.2□□□□□ -0.46
SPB1P25582 FUN26YAL022C 1554 nt12.2□□□□□ -0.46
SPB1P25582 PAC11YDR488C 1602 nt12.19□□□□□ -0.46
SPB1P25582 YMR090WYMR090W 684 nt12.19□□□□□ -0.46
SPB1P25582 YGR021WYGR021W 873 nt12.18□□□□□ -0.46
SPB1P25582 YDL221WYDL221W 552 nt12.13□□□□□ -0.47
SPB1P25582 HOM6YJR139C 1080 nt12.13□□□□□ -0.47
SPB1P25582 PTP1YDL230W 1008 nt12.12□□□□□ -0.47
SPB1P25582 MNP1YGL068W 585 nt12.11□□□□□ -0.47
SPB1P25582 ALF1YNL148C 765 nt12.11□□□□□ -0.47
SPB1P25582 CAC2YML102W 1407 nt12.11□□□□□ -0.47
SPB1P25582 RPP2AYOL039W 321 nt12.1□□□□□ -0.47
SPB1P25582 SDH1YKL148C 1923 nt12.08□□□□□ -0.48
SPB1P25582 TRM9YML014W 840 nt12.06□□□□□ -0.48
SPB1P25582 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.05□□□□□ -0.48
SPB1P25582 YOR139CYOR139C 393 nt12.01□□□□□ -0.49
SPB1P25582 NVJ2YPR091C 2313 nt12.01□□□□□ -0.49
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