Protein–RNA interactions for Protein: Q12138

YLR125W, Putative uncharacterized protein YLR125W, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR125WQ12138 NSR1YGR159C 1245 nt17.37■□□□□ 0.37
YLR125WQ12138 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.56■□□□□ 0.24
YLR125WQ12138 MDJ1YFL016C 1536 nt16.2■□□□□ 0.18
YLR125WQ12138 NOP1YDL014W 984 nt15.79■□□□□ 0.12
YLR125WQ12138 SSA3YBL075C 1950 nt14.99□□□□□ -0.01
YLR125WQ12138 Q0182Q0182 405 nt14.91□□□□□ -0.02
YLR125WQ12138 YJL027CYJL027C 417 nt14.89□□□□□ -0.03
YLR125WQ12138 MOT3YMR070W 1473 nt14.34□□□□□ -0.11
YLR125WQ12138 YBR190WYBR190W 312 nt14.13□□□□□ -0.15
YLR125WQ12138 DBP2YNL112W 1641 nt14.02□□□□□ -0.16
YLR125WQ12138 SRX1YKL086W 384 nt13.8□□□□□ -0.2
YLR125WQ12138 RTC3YHR087W 336 nt13.69□□□□□ -0.22
YLR125WQ12138 YKL036CYKL036C 393 nt13.69□□□□□ -0.22
YLR125WQ12138 PUT4YOR348C 1884 nt13.55□□□□□ -0.24
YLR125WQ12138 Q0297Q0297 156 nt13.54□□□□□ -0.24
YLR125WQ12138 SPT5YML010W 3192 nt13.12□□□□□ -0.31
YLR125WQ12138 SSA4YER103W 1929 nt13.06□□□□□ -0.32
YLR125WQ12138 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.02□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 POA1YBR022W 534 nt13.01□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 ARE1YCR048W 1833 nt13□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 YCR051WYCR051W 669 nt12.96□□□□□ -0.33
YLR125WQ12138 RVS167YDR388W 1449 nt12.95□□□□□ -0.34
YLR125WQ12138 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
YLR125WQ12138 CCC1YLR220W 969 nt12.81□□□□□ -0.36
YLR125WQ12138 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.8□□□□□ -0.36
YLR125WQ12138 BDF1YLR399C 2061 nt12.7□□□□□ -0.38
YLR125WQ12138 SAH1YER043C 1350 nt12.67□□□□□ -0.38
YLR125WQ12138 SCJ1YMR214W 1134 nt12.66□□□□□ -0.38
YLR125WQ12138 OPI9YLR338W 858 nt12.55□□□□□ -0.4
YLR125WQ12138 URN1YPR152C 1398 nt12.53□□□□□ -0.4
YLR125WQ12138 PAC11YDR488C 1602 nt12.51□□□□□ -0.41
YLR125WQ12138 TAT1YBR069C 1860 nt12.5□□□□□ -0.41
YLR125WQ12138 BUD23YCR047C 828 nt12.4□□□□□ -0.42
YLR125WQ12138 SHR5YOL110W 714 nt12.29□□□□□ -0.44
YLR125WQ12138 NVJ2YPR091C 2313 nt12.26□□□□□ -0.45
YLR125WQ12138 MEP2YNL142W 1500 nt12.25□□□□□ -0.45
YLR125WQ12138 DEP1YAL013W 1218 nt12.19□□□□□ -0.46
YLR125WQ12138 PUN1YLR414C 792 nt12.17□□□□□ -0.46
YLR125WQ12138 PTC2YER089C 1395 nt12.16□□□□□ -0.46
YLR125WQ12138 NAB2YGL122C 1578 nt12.15□□□□□ -0.46
YLR125WQ12138 RPP1BYDL130W 321 nt12.13□□□□□ -0.47
YLR125WQ12138 RPN10YHR200W 807 nt12.11□□□□□ -0.47
YLR125WQ12138 SSA1YAL005C 1929 nt12.03□□□□□ -0.48
YLR125WQ12138 YOL085CYOL085C 342 nt12.03□□□□□ -0.48
YLR125WQ12138 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12□□□□□ -0.49
YLR125WQ12138 DCW1YKL046C 1350 nt12□□□□□ -0.49
YLR125WQ12138 SCS3YGL126W 1143 nt11.98□□□□□ -0.49
YLR125WQ12138 YNL208WYNL208W 600 nt11.96□□□□□ -0.49
YLR125WQ12138 YBR220CYBR220C 1683 nt11.96□□□□□ -0.5
YLR125WQ12138 YJR018WYJR018W 363 nt11.88□□□□□ -0.51
YLR125WQ12138 FIS1YIL065C 468 nt11.86□□□□□ -0.51
YLR125WQ12138 YMR090WYMR090W 684 nt11.84□□□□□ -0.51
YLR125WQ12138 EMI2YDR516C 1503 nt11.83□□□□□ -0.52
YLR125WQ12138 YPS1YLR120C 1710 nt11.81□□□□□ -0.52
YLR125WQ12138 DAL1YIR027C 1383 nt11.8□□□□□ -0.52
YLR125WQ12138 PCH2YBR186W 1695 nt11.77□□□□□ -0.53
YLR125WQ12138 PKP1YIL042C 1185 nt11.76□□□□□ -0.53
YLR125WQ12138 GUT2YIL155C 1950 nt11.75□□□□□ -0.53
YLR125WQ12138 SDH1YKL148C 1923 nt11.72□□□□□ -0.53
YLR125WQ12138 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 YJL225CYJL225C 5277 nt11.69□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 PHO4YFR034C 939 nt11.68□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 SEC11YIR022W 504 nt11.68□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 FPR4YLR449W 1179 nt11.68□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 PET122YER153C 765 nt11.67□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 YDL221WYDL221W 552 nt11.66□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 YDJ1YNL064C 1230 nt11.66□□□□□ -0.54
YLR125WQ12138 FPS1YLL043W 2010 nt11.62□□□□□ -0.55
YLR125WQ12138 INM2YDR287W 879 nt11.61□□□□□ -0.55
YLR125WQ12138 YDR095CYDR095C 411 nt11.59□□□□□ -0.55
YLR125WQ12138 PIB2YGL023C 1908 nt11.56□□□□□ -0.56
YLR125WQ12138 YJR120WYJR120W 351 nt11.51□□□□□ -0.57
YLR125WQ12138 CAC2YML102W 1407 nt11.5□□□□□ -0.57
YLR125WQ12138 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
YLR125WQ12138 GAR1YHR089C 618 nt11.47□□□□□ -0.57
YLR125WQ12138 PTP1YDL230W 1008 nt11.44□□□□□ -0.58
YLR125WQ12138 UME6YDR207C 2511 nt11.39□□□□□ -0.59
YLR125WQ12138 RPP2BYDR382W 333 nt11.38□□□□□ -0.59
YLR125WQ12138 RTF1YGL244W 1677 nt11.37□□□□□ -0.59
YLR125WQ12138 RPP2AYOL039W 321 nt11.36□□□□□ -0.59
YLR125WQ12138 IRC15YPL017C 1500 nt11.34□□□□□ -0.59
YLR125WQ12138 YSC84YHR016C 1407 nt11.32□□□□□ -0.6
YLR125WQ12138 NME1NME1 340 nt11.31□□□□□ -0.6
YLR125WQ12138 YBL100CYBL100C 315 nt11.3□□□□□ -0.6
YLR125WQ12138 SCR1SCR1 522 nt11.29□□□□□ -0.6
YLR125WQ12138 GIS3YLR094C 1509 nt11.28□□□□□ -0.6
YLR125WQ12138 YHL050CYHL050C 2094 nt11.26□□□□□ -0.61
YLR125WQ12138 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.26□□□□□ -0.61
YLR125WQ12138 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.26□□□□□ -0.61
YLR125WQ12138 RRN5YLR141W 1092 nt11.25□□□□□ -0.61
YLR125WQ12138 BOR1YNL275W 1731 nt11.24□□□□□ -0.61
YLR125WQ12138 PTK1YKL198C 1989 nt11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms