Protein–RNA interactions for Protein: Q05568

PEX10, Peroxisome biogenesis factor 10, yeastyeast

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX10Q05568 NSR1YGR159C 1245 nt17.77■□□□□ 0.44
PEX10Q05568 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.22■□□□□ 0.35
PEX10Q05568 MDJ1YFL016C 1536 nt16.49■□□□□ 0.23
PEX10Q05568 NOP1YDL014W 984 nt16.44■□□□□ 0.22
PEX10Q05568 YJL027CYJL027C 417 nt15.14■□□□□ 0.01
PEX10Q05568 SSA3YBL075C 1950 nt14.54□□□□□ -0.08
PEX10Q05568 YKL036CYKL036C 393 nt14.45□□□□□ -0.1
PEX10Q05568 SRX1YKL086W 384 nt14.35□□□□□ -0.11
PEX10Q05568 DBP2YNL112W 1641 nt14.28□□□□□ -0.12
PEX10Q05568 YBR190WYBR190W 312 nt14.26□□□□□ -0.13
PEX10Q05568 Q0297Q0297 156 nt14.13□□□□□ -0.15
PEX10Q05568 RTC3YHR087W 336 nt13.91□□□□□ -0.18
PEX10Q05568 YCR051WYCR051W 669 nt13.56□□□□□ -0.24
PEX10Q05568 PUT4YOR348C 1884 nt13.54□□□□□ -0.24
PEX10Q05568 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.43□□□□□ -0.26
PEX10Q05568 CCC1YLR220W 969 nt13.28□□□□□ -0.28
PEX10Q05568 RVS167YDR388W 1449 nt13.26□□□□□ -0.29
PEX10Q05568 ARE1YCR048W 1833 nt13.06□□□□□ -0.32
PEX10Q05568 POA1YBR022W 534 nt13.05□□□□□ -0.32
PEX10Q05568 SCJ1YMR214W 1134 nt13.03□□□□□ -0.32
PEX10Q05568 SCS3YGL126W 1143 nt12.91□□□□□ -0.34
PEX10Q05568 SPT5YML010W 3192 nt12.91□□□□□ -0.34
PEX10Q05568 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
PEX10Q05568 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.9□□□□□ -0.34
PEX10Q05568 SAH1YER043C 1350 nt12.82□□□□□ -0.36
PEX10Q05568 SSA4YER103W 1929 nt12.82□□□□□ -0.36
PEX10Q05568 URN1YPR152C 1398 nt12.74□□□□□ -0.37
PEX10Q05568 OPI9YLR338W 858 nt12.71□□□□□ -0.37
PEX10Q05568 RPP1BYDL130W 321 nt12.68□□□□□ -0.38
PEX10Q05568 SHR5YOL110W 714 nt12.62□□□□□ -0.39
PEX10Q05568 BUD23YCR047C 828 nt12.54□□□□□ -0.4
PEX10Q05568 YOL085CYOL085C 342 nt12.54□□□□□ -0.4
PEX10Q05568 DEP1YAL013W 1218 nt12.51□□□□□ -0.41
PEX10Q05568 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.45□□□□□ -0.42
PEX10Q05568 PKP1YIL042C 1185 nt12.44□□□□□ -0.42
PEX10Q05568 BDF1YLR399C 2061 nt12.41□□□□□ -0.42
PEX10Q05568 RPN10YHR200W 807 nt12.38□□□□□ -0.43
PEX10Q05568 PUN1YLR414C 792 nt12.34□□□□□ -0.43
PEX10Q05568 PTC2YER089C 1395 nt12.31□□□□□ -0.44
PEX10Q05568 NAB2YGL122C 1578 nt12.26□□□□□ -0.45
PEX10Q05568 YNL208WYNL208W 600 nt12.24□□□□□ -0.45
PEX10Q05568 TAT1YBR069C 1860 nt12.23□□□□□ -0.45
PEX10Q05568 MEP2YNL142W 1500 nt12.21□□□□□ -0.46
PEX10Q05568 PET122YER153C 765 nt12.2□□□□□ -0.46
PEX10Q05568 YJR018WYJR018W 363 nt12.1□□□□□ -0.47
PEX10Q05568 PAC11YDR488C 1602 nt12.07□□□□□ -0.48
PEX10Q05568 YDJ1YNL064C 1230 nt12.05□□□□□ -0.48
PEX10Q05568 FIS1YIL065C 468 nt12.01□□□□□ -0.49
PEX10Q05568 DCW1YKL046C 1350 nt11.99□□□□□ -0.49
PEX10Q05568 DAL1YIR027C 1383 nt11.95□□□□□ -0.5
PEX10Q05568 GAR1YHR089C 618 nt11.9□□□□□ -0.5
PEX10Q05568 FPR4YLR449W 1179 nt11.9□□□□□ -0.5
PEX10Q05568 YPS1YLR120C 1710 nt11.89□□□□□ -0.51
PEX10Q05568 SCR1SCR1 522 nt11.87□□□□□ -0.51
PEX10Q05568 YBR220CYBR220C 1683 nt11.86□□□□□ -0.51
PEX10Q05568 PHO4YFR034C 939 nt11.84□□□□□ -0.51
PEX10Q05568 EMI2YDR516C 1503 nt11.81□□□□□ -0.52
PEX10Q05568 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.8□□□□□ -0.52
PEX10Q05568 YMR090WYMR090W 684 nt11.8□□□□□ -0.52
PEX10Q05568 INM2YDR287W 879 nt11.77□□□□□ -0.53
PEX10Q05568 RRN5YLR141W 1092 nt11.77□□□□□ -0.53
PEX10Q05568 YJR120WYJR120W 351 nt11.75□□□□□ -0.53
PEX10Q05568 NVJ2YPR091C 2313 nt11.71□□□□□ -0.53
PEX10Q05568 YDR095CYDR095C 411 nt11.68□□□□□ -0.54
PEX10Q05568 SDH1YKL148C 1923 nt11.68□□□□□ -0.54
PEX10Q05568 YDL221WYDL221W 552 nt11.66□□□□□ -0.54
PEX10Q05568 RPP2BYDR382W 333 nt11.65□□□□□ -0.54
PEX10Q05568 PCH2YBR186W 1695 nt11.62□□□□□ -0.55
PEX10Q05568 GUT2YIL155C 1950 nt11.58□□□□□ -0.56
PEX10Q05568 SSA1YAL005C 1929 nt11.56□□□□□ -0.56
PEX10Q05568 CAC2YML102W 1407 nt11.55□□□□□ -0.56
PEX10Q05568 SEC11YIR022W 504 nt11.55□□□□□ -0.56
PEX10Q05568 TIR1YER011W 765 nt11.54□□□□□ -0.56
PEX10Q05568 YBL100CYBL100C 315 nt11.54□□□□□ -0.56
PEX10Q05568 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.53□□□□□ -0.56
PEX10Q05568 ATS1YAL020C 1002 nt11.52□□□□□ -0.57
PEX10Q05568 PTP1YDL230W 1008 nt11.5□□□□□ -0.57
PEX10Q05568 SCC4YER147C 1875 nt11.49□□□□□ -0.57
PEX10Q05568 RPP2AYOL039W 321 nt11.47□□□□□ -0.57
PEX10Q05568 PIB2YGL023C 1908 nt11.38□□□□□ -0.59
PEX10Q05568 IRC15YPL017C 1500 nt11.38□□□□□ -0.59
PEX10Q05568 FUN26YAL022C 1554 nt11.37□□□□□ -0.59
PEX10Q05568 ALF1YNL148C 765 nt11.37□□□□□ -0.59
PEX10Q05568 GIS3YLR094C 1509 nt11.33□□□□□ -0.6
PEX10Q05568 YSC84YHR016C 1407 nt11.31□□□□□ -0.6
PEX10Q05568 BDH2YAL061W 1254 nt11.3□□□□□ -0.6
PEX10Q05568 RSB1YOR049C 1065 nt11.3□□□□□ -0.6
PEX10Q05568 RTF1YGL244W 1677 nt11.26□□□□□ -0.61
PEX10Q05568 YHL050CYHL050C 2094 nt11.23□□□□□ -0.61
PEX10Q05568 SRB2YHR041C 633 nt11.21□□□□□ -0.61
PEX10Q05568 TRM9YML014W 840 nt11.21□□□□□ -0.61
PEX10Q05568 SIS1YNL007C 1059 nt11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms