Protein–RNA interactions for Protein: Q04347

BUD22, Bud site selection protein 22, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD22Q04347 NSR1YGR159C 1245 nt20.53■□□□□ 0.88
BUD22Q04347 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.41■□□□□ 0.86
BUD22Q04347 NOP1YDL014W 984 nt19.66■□□□□ 0.74
BUD22Q04347 MDJ1YFL016C 1536 nt18.57■□□□□ 0.56
BUD22Q04347 YKL036CYKL036C 393 nt17.92■□□□□ 0.46
BUD22Q04347 SRX1YKL086W 384 nt17.23■□□□□ 0.35
BUD22Q04347 Q0297Q0297 156 nt17.18■□□□□ 0.34
BUD22Q04347 YJL027CYJL027C 417 nt17.04■□□□□ 0.32
BUD22Q04347 DBP2YNL112W 1641 nt16.36■□□□□ 0.21
BUD22Q04347 YCR051WYCR051W 669 nt16.32■□□□□ 0.2
BUD22Q04347 SCS3YGL126W 1143 nt16.2■□□□□ 0.18
BUD22Q04347 YBR190WYBR190W 312 nt15.85■□□□□ 0.13
BUD22Q04347 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.77■□□□□ 0.12
BUD22Q04347 CCC1YLR220W 969 nt15.63■□□□□ 0.09
BUD22Q04347 YOL085CYOL085C 342 nt15.58■□□□□ 0.08
BUD22Q04347 RTC3YHR087W 336 nt15.48■□□□□ 0.07
BUD22Q04347 RPP1BYDL130W 321 nt15.41■□□□□ 0.06
BUD22Q04347 PKP1YIL042C 1185 nt15.4■□□□□ 0.06
BUD22Q04347 SCJ1YMR214W 1134 nt15.16■□□□□ 0.02
BUD22Q04347 RVS167YDR388W 1449 nt15.15■□□□□ 0.02
BUD22Q04347 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.83□□□□□ -0.04
BUD22Q04347 PET122YER153C 765 nt14.8□□□□□ -0.04
BUD22Q04347 SSA3YBL075C 1950 nt14.7□□□□□ -0.06
BUD22Q04347 PUT4YOR348C 1884 nt14.69□□□□□ -0.06
BUD22Q04347 SHR5YOL110W 714 nt14.61□□□□□ -0.07
BUD22Q04347 SCR1SCR1 522 nt14.46□□□□□ -0.09
BUD22Q04347 ATS1YAL020C 1002 nt14.41□□□□□ -0.1
BUD22Q04347 URN1YPR152C 1398 nt14.41□□□□□ -0.1
BUD22Q04347 DEP1YAL013W 1218 nt14.36□□□□□ -0.11
BUD22Q04347 ARE1YCR048W 1833 nt14.35□□□□□ -0.11
BUD22Q04347 RRN5YLR141W 1092 nt14.34□□□□□ -0.11
BUD22Q04347 YDJ1YNL064C 1230 nt14.31□□□□□ -0.12
BUD22Q04347 SAH1YER043C 1350 nt14.28□□□□□ -0.12
BUD22Q04347 OPI9YLR338W 858 nt14.25□□□□□ -0.13
BUD22Q04347 POA1YBR022W 534 nt14.2□□□□□ -0.14
BUD22Q04347 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.11□□□□□ -0.15
BUD22Q04347 GAR1YHR089C 618 nt14.08□□□□□ -0.16
BUD22Q04347 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.06□□□□□ -0.16
BUD22Q04347 YNL208WYNL208W 600 nt14.03□□□□□ -0.16
BUD22Q04347 RPN10YHR200W 807 nt14.02□□□□□ -0.17
BUD22Q04347 BSC6YOL137W 1494 nt13.93□□□□□ -0.18
BUD22Q04347 RSB1YOR049C 1065 nt13.91□□□□□ -0.18
BUD22Q04347 PUN1YLR414C 792 nt13.78□□□□□ -0.2
BUD22Q04347 BUD23YCR047C 828 nt13.75□□□□□ -0.21
BUD22Q04347 PTC2YER089C 1395 nt13.73□□□□□ -0.21
BUD22Q04347 YJR018WYJR018W 363 nt13.71□□□□□ -0.21
BUD22Q04347 TIR1YER011W 765 nt13.61□□□□□ -0.23
BUD22Q04347 SPT5YML010W 3192 nt13.61□□□□□ -0.23
BUD22Q04347 SSA1YAL005C 1929 nt13.56□□□□□ -0.24
BUD22Q04347 NAB2YGL122C 1578 nt13.56□□□□□ -0.24
BUD22Q04347 YJR120WYJR120W 351 nt13.55□□□□□ -0.24
BUD22Q04347 PST2YDR032C 597 nt13.42□□□□□ -0.26
BUD22Q04347 FIS1YIL065C 468 nt13.39□□□□□ -0.27
BUD22Q04347 SRB2YHR041C 633 nt13.38□□□□□ -0.27
BUD22Q04347 DAL1YIR027C 1383 nt13.33□□□□□ -0.27
BUD22Q04347 FPR4YLR449W 1179 nt13.3□□□□□ -0.28
BUD22Q04347 RPP2BYDR382W 333 nt13.28□□□□□ -0.28
BUD22Q04347 INM2YDR287W 879 nt13.23□□□□□ -0.29
BUD22Q04347 PHO4YFR034C 939 nt13.22□□□□□ -0.29
BUD22Q04347 SSA4YER103W 1929 nt13.17□□□□□ -0.3
BUD22Q04347 MEP2YNL142W 1500 nt13.1□□□□□ -0.31
BUD22Q04347 YPS1YLR120C 1710 nt13.09□□□□□ -0.31
BUD22Q04347 YBL100CYBL100C 315 nt13.08□□□□□ -0.32
BUD22Q04347 BDH2YAL061W 1254 nt13.03□□□□□ -0.32
BUD22Q04347 WWM1YFL010C 636 nt13.01□□□□□ -0.33
BUD22Q04347 SHU1YHL006C 453 nt12.95□□□□□ -0.34
BUD22Q04347 DCW1YKL046C 1350 nt12.94□□□□□ -0.34
BUD22Q04347 YDR095CYDR095C 411 nt12.94□□□□□ -0.34
BUD22Q04347 FUN26YAL022C 1554 nt12.94□□□□□ -0.34
BUD22Q04347 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.92□□□□□ -0.34
BUD22Q04347 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.88□□□□□ -0.35
BUD22Q04347 TRM9YML014W 840 nt12.82□□□□□ -0.36
BUD22Q04347 LSM3YLR438C-A 270 nt12.8□□□□□ -0.36
BUD22Q04347 PTP1YDL230W 1008 nt12.76□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 HOM6YJR139C 1080 nt12.76□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 ALF1YNL148C 765 nt12.74□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 CCT6YDR188W 1641 nt12.73□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 BDF1YLR399C 2061 nt12.73□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.73□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 YGR021WYGR021W 873 nt12.73□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 EMI2YDR516C 1503 nt12.72□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 CAC2YML102W 1407 nt12.71□□□□□ -0.37
BUD22Q04347 RPP2AYOL039W 321 nt12.69□□□□□ -0.38
BUD22Q04347 MNP1YGL068W 585 nt12.68□□□□□ -0.38
BUD22Q04347 YKL097CYKL097C 411 nt12.66□□□□□ -0.38
BUD22Q04347 SIS1YNL007C 1059 nt12.63□□□□□ -0.39
BUD22Q04347 YBR220CYBR220C 1683 nt12.61□□□□□ -0.39
BUD22Q04347 YDL221WYDL221W 552 nt12.6□□□□□ -0.39
BUD22Q04347 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.57□□□□□ -0.4
BUD22Q04347 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.57□□□□□ -0.4
BUD22Q04347 RKM5YLR137W 1104 nt12.56□□□□□ -0.4
BUD22Q04347 YMR090WYMR090W 684 nt12.55□□□□□ -0.4
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