RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ifi27l2bQ8VC49 283 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ly6hQ9WUC3 139 aa15.58■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Esp34G3UXG0 151 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Defa4P28311 92 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Defa20Q45VN2 95 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 4930544G11RikQ9CR99 193 aa15.57■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rpl18aP62717 176 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Erg28Q9ERY9 140 aa15.56■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm9789Q8BIG3 52 aa15.55■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mzt1Q8BUR9 78 aa15.55■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Prol1E9PYQ4 312 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm9903Q8C9Y8 129 aa15.54■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hist1h2bmP10854 126 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10642Q3TWM1 71 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10549Q3URY4 149 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hist1h2bhQ64478 126 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hist2h2bbQ64525 126 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Chac1Q8R3J5 223 aa15.53■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10570F6VB42 170 aa15.52■□□□□ 0.08
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ubr4A2AN08 5180 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm6812B1AXU1 112 aa15.51■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tomm6Q9CQN3 74 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Reg3dQ9QUS9 175 aa15.5■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mrps10Q80ZK0 160 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tcl1b5P56845 121 aa15.47■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Isg15Q64339 161 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hmcn2A2AJ76 5100 aa15.46■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10842Q3U587 122 aa15.46■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Josd1Q9DBJ6 202 aa15.46■□□□□ 0.07
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Foxi2Q3I5G5 311 aa15.45■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gatd1Q8BFQ8 220 aa15.45■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Psmb2Q9R1P3 201 aa15.45■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1500009C09RikD3YYW9 81 aa15.44■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam213bQ9DB60 201 aa15.44■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 P84750 121 aa15.43■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ube2d4D3YUH6 135 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Prelid3aQ8VE85 172 aa15.41■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rmi2Q3UPE3 149 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam19a3Q7TPG6 132 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Wfdc10Q3V2J9 124 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm28269A0A087WSG3 125 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Hsbp1l1B2RXB2 72 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smim29Q8R043 75 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Morn5Q9DAI9 170 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam240aJ3QNP9 97 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pfn2Q9JJV2 140 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa15.35■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 A930033H14RikG5E8X6 103 aa15.35■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Stard4Q99JV5 224 aa15.35■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mustn1Q99JI1 82 aa15.34■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa15.34■□□□□ 0.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm26727M0QWT1 121 aa15.32■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Trav12-3A0A075B648 115 aa15.29■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm9047B9EJX3 177 aa15.29■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gpx1P11352 201 aa15.29■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Tex54G3UW99 86 aa15.28■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 P01837 106 aa15.28■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cks1brtQ3UNC9 96 aa15.28■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm42674D3YUT9 64 aa15.27■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm20726G3UX18 150 aa15.27■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ube2aQ9Z255 152 aa15.27■□□□□ 0.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Scgb1b15A0A087WP50 93 aa15.26■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm28305F6U473 122 aa15.26■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Phpt1Q9DAK9 124 aa15.26■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1700011M02RikB1AX35 88 aa15.25■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc179J3QM76 67 aa15.25■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 HrnrQ8VHD8 2496 aa15.24■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lect2O88803 151 aa15.24■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dmac1Q9CQ00 111 aa15.24■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ssbp1Q9CYR0 152 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa15.21■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Scgb1b3J3QJY4 93 aa15.21■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Defb39Q70KL3 74 aa15.21■□□□□ 0.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm11011D3Z3L9 86 aa15.2■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm17521F6QAC8 156 aa15.19■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lgals4Q8K419 326 aa15.19■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Vamp3P63024 103 aa15.18■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm27235Q3UW50 83 aa15.18■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ndufc2Q9CQ54 120 aa15.18■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pmp2P24526 132 aa15.17■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cox8bP48772 70 aa15.17■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Defa22Q8C1N8 93 aa15.17■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Q8K1L6 76 aa15.17■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PpdpfQ9CR37 115 aa15.17■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm9376G3UW68 176 aa15.16■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 SrarpQ3ULG3 163 aa15.16■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Bean1Q9EQG5 255 aa15.16■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa15.15■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm11020F6ZGD5 61 aa15.15■□□□□ 0.02
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm10845Q3UNY9 185 aa15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 81.6 ms