Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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