Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam240aJ3QNP9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam240aJ3QNP9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam240aJ3QNP9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam240aJ3QNP9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam240aJ3QNP9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam240aJ3QNP9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam240aJ3QNP9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam240aJ3QNP9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam240aJ3QNP9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam240aJ3QNP9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam240aJ3QNP9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam240aJ3QNP9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam240aJ3QNP9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam240aJ3QNP9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam240aJ3QNP9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam240aJ3QNP9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam240aJ3QNP9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam240aJ3QNP9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam240aJ3QNP9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam240aJ3QNP9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam240aJ3QNP9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam240aJ3QNP9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam240aJ3QNP9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam240aJ3QNP9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam240aJ3QNP9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam240aJ3QNP9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam240aJ3QNP9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam240aJ3QNP9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam240aJ3QNP9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam240aJ3QNP9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam240aJ3QNP9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam240aJ3QNP9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Fam240aJ3QNP9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Fam240aJ3QNP9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Fam240aJ3QNP9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Fam240aJ3QNP9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam240aJ3QNP9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam240aJ3QNP9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam240aJ3QNP9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam240aJ3QNP9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam240aJ3QNP9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fam240aJ3QNP9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam240aJ3QNP9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam240aJ3QNP9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam240aJ3QNP9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam240aJ3QNP9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam240aJ3QNP9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam240aJ3QNP9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam240aJ3QNP9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam240aJ3QNP9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam240aJ3QNP9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fam240aJ3QNP9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fam240aJ3QNP9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fam240aJ3QNP9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fam240aJ3QNP9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam240aJ3QNP9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam240aJ3QNP9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam240aJ3QNP9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam240aJ3QNP9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam240aJ3QNP9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam240aJ3QNP9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam240aJ3QNP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam240aJ3QNP9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam240aJ3QNP9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam240aJ3QNP9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam240aJ3QNP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam240aJ3QNP9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam240aJ3QNP9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam240aJ3QNP9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam240aJ3QNP9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam240aJ3QNP9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam240aJ3QNP9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam240aJ3QNP9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam240aJ3QNP9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam240aJ3QNP9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam240aJ3QNP9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam240aJ3QNP9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam240aJ3QNP9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam240aJ3QNP9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam240aJ3QNP9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam240aJ3QNP9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam240aJ3QNP9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Fam240aJ3QNP9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Fam240aJ3QNP9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Fam240aJ3QNP9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Fam240aJ3QNP9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Fam240aJ3QNP9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam240aJ3QNP9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Fam240aJ3QNP9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms