Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHD8

Hrnr, Hornerin, mousemouse

Predictions only

Length 2,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrnrQ8VHD8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
HrnrQ8VHD8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
HrnrQ8VHD8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
HrnrQ8VHD8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
HrnrQ8VHD8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,17■□□□□ 0,82
HrnrQ8VHD8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,98■□□□□ 0,79
HrnrQ8VHD8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19,76■□□□□ 0,75
HrnrQ8VHD8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19,51■□□□□ 0,71
HrnrQ8VHD8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19,5■□□□□ 0,71
HrnrQ8VHD8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,41■□□□□ 0,7
HrnrQ8VHD8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19,33■□□□□ 0,68
HrnrQ8VHD8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
HrnrQ8VHD8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,09■□□□□ 0,65
HrnrQ8VHD8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19,06■□□□□ 0,64
HrnrQ8VHD8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,03■□□□□ 0,64
HrnrQ8VHD8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
HrnrQ8VHD8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
HrnrQ8VHD8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
HrnrQ8VHD8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
HrnrQ8VHD8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,78■□□□□ 0,6
HrnrQ8VHD8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
HrnrQ8VHD8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18,71■□□□□ 0,58
HrnrQ8VHD8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
HrnrQ8VHD8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
HrnrQ8VHD8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
HrnrQ8VHD8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18,6■□□□□ 0,57
HrnrQ8VHD8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
HrnrQ8VHD8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,56
HrnrQ8VHD8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
HrnrQ8VHD8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
HrnrQ8VHD8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,43■□□□□ 0,54
HrnrQ8VHD8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
HrnrQ8VHD8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
HrnrQ8VHD8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18,32■□□□□ 0,52
HrnrQ8VHD8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
HrnrQ8VHD8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
HrnrQ8VHD8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
HrnrQ8VHD8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18,19■□□□□ 0,5
HrnrQ8VHD8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18,16■□□□□ 0,5
HrnrQ8VHD8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
HrnrQ8VHD8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18,1■□□□□ 0,49
HrnrQ8VHD8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
HrnrQ8VHD8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
HrnrQ8VHD8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
HrnrQ8VHD8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
HrnrQ8VHD8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC17,86■□□□□ 0,45
HrnrQ8VHD8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
HrnrQ8VHD8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,79■□□□□ 0,44
HrnrQ8VHD8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17,77■□□□□ 0,44
HrnrQ8VHD8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC17,77■□□□□ 0,43
HrnrQ8VHD8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,76■□□□□ 0,43
HrnrQ8VHD8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
HrnrQ8VHD8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,74■□□□□ 0,43
HrnrQ8VHD8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,73■□□□□ 0,43
HrnrQ8VHD8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
HrnrQ8VHD8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,42
HrnrQ8VHD8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17,69■□□□□ 0,42
HrnrQ8VHD8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,66■□□□□ 0,42
HrnrQ8VHD8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
HrnrQ8VHD8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17,61■□□□□ 0,41
HrnrQ8VHD8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17,53■□□□□ 0,4
HrnrQ8VHD8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
HrnrQ8VHD8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17,51■□□□□ 0,39
HrnrQ8VHD8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17,5■□□□□ 0,39
HrnrQ8VHD8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17,49■□□□□ 0,39
HrnrQ8VHD8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
HrnrQ8VHD8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
HrnrQ8VHD8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
HrnrQ8VHD8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
HrnrQ8VHD8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17,42■□□□□ 0,38
HrnrQ8VHD8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
HrnrQ8VHD8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
HrnrQ8VHD8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17,4■□□□□ 0,38
HrnrQ8VHD8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,36■□□□□ 0,37
HrnrQ8VHD8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,34■□□□□ 0,37
HrnrQ8VHD8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17,33■□□□□ 0,37
HrnrQ8VHD8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17,3■□□□□ 0,36
HrnrQ8VHD8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,29■□□□□ 0,36
HrnrQ8VHD8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,26■□□□□ 0,35
HrnrQ8VHD8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,25■□□□□ 0,35
HrnrQ8VHD8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,23■□□□□ 0,35
HrnrQ8VHD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,22■□□□□ 0,35
HrnrQ8VHD8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17,21■□□□□ 0,35
HrnrQ8VHD8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17,19■□□□□ 0,34
HrnrQ8VHD8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
HrnrQ8VHD8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,18■□□□□ 0,34
HrnrQ8VHD8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17,18■□□□□ 0,34
HrnrQ8VHD8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,17■□□□□ 0,34
HrnrQ8VHD8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
HrnrQ8VHD8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,14■□□□□ 0,33
HrnrQ8VHD8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,06■□□□□ 0,32
HrnrQ8VHD8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,05■□□□□ 0,32
HrnrQ8VHD8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
HrnrQ8VHD8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
HrnrQ8VHD8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
HrnrQ8VHD8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC16,99■□□□□ 0,31
HrnrQ8VHD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16,98■□□□□ 0,31
HrnrQ8VHD8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
HrnrQ8VHD8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,98■□□□□ 0,31
HrnrQ8VHD8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,7 ms