Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ76

Hmcn2, Hemicentin-2, mousemouse

Predictions only

Length 5,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmcn2A2AJ76 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,63■■□□□ 1,21
Hmcn2A2AJ76 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Hmcn2A2AJ76 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Hmcn2A2AJ76 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,04■□□□□ 0,8
Hmcn2A2AJ76 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,28■□□□□ 0,68
Hmcn2A2AJ76 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Hmcn2A2AJ76 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19,06■□□□□ 0,64
Hmcn2A2AJ76 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Hmcn2A2AJ76 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Hmcn2A2AJ76 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Hmcn2A2AJ76 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18,71■□□□□ 0,59
Hmcn2A2AJ76 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Hmcn2A2AJ76 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18,63■□□□□ 0,57
Hmcn2A2AJ76 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,61■□□□□ 0,57
Hmcn2A2AJ76 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,6■□□□□ 0,57
Hmcn2A2AJ76 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18,59■□□□□ 0,57
Hmcn2A2AJ76 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Hmcn2A2AJ76 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18,07■□□□□ 0,48
Hmcn2A2AJ76 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18,06■□□□□ 0,48
Hmcn2A2AJ76 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Hmcn2A2AJ76 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,87■□□□□ 0,45
Hmcn2A2AJ76 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,7■□□□□ 0,42
Hmcn2A2AJ76 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17,68■□□□□ 0,42
Hmcn2A2AJ76 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17,67■□□□□ 0,42
Hmcn2A2AJ76 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17,63■□□□□ 0,41
Hmcn2A2AJ76 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17,63■□□□□ 0,41
Hmcn2A2AJ76 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17,6■□□□□ 0,41
Hmcn2A2AJ76 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,49■□□□□ 0,39
Hmcn2A2AJ76 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,38■□□□□ 0,37
Hmcn2A2AJ76 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17,37■□□□□ 0,37
Hmcn2A2AJ76 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17,36■□□□□ 0,37
Hmcn2A2AJ76 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17,28■□□□□ 0,36
Hmcn2A2AJ76 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,19■□□□□ 0,34
Hmcn2A2AJ76 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17,16■□□□□ 0,34
Hmcn2A2AJ76 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17,14■□□□□ 0,33
Hmcn2A2AJ76 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17,11■□□□□ 0,33
Hmcn2A2AJ76 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17,1■□□□□ 0,33
Hmcn2A2AJ76 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Hmcn2A2AJ76 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Hmcn2A2AJ76 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16,81■□□□□ 0,28
Hmcn2A2AJ76 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Hmcn2A2AJ76 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Hmcn2A2AJ76 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16,74■□□□□ 0,27
Hmcn2A2AJ76 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Hmcn2A2AJ76 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16,69■□□□□ 0,26
Hmcn2A2AJ76 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16,66■□□□□ 0,26
Hmcn2A2AJ76 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16,65■□□□□ 0,26
Hmcn2A2AJ76 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,64■□□□□ 0,25
Hmcn2A2AJ76 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Hmcn2A2AJ76 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16,63■□□□□ 0,25
Hmcn2A2AJ76 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16,57■□□□□ 0,24
Hmcn2A2AJ76 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC16,55■□□□□ 0,24
Hmcn2A2AJ76 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16,53■□□□□ 0,24
Hmcn2A2AJ76 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,51■□□□□ 0,23
Hmcn2A2AJ76 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,5■□□□□ 0,23
Hmcn2A2AJ76 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Hmcn2A2AJ76 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,49■□□□□ 0,23
Hmcn2A2AJ76 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,47■□□□□ 0,23
Hmcn2A2AJ76 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16,45■□□□□ 0,22
Hmcn2A2AJ76 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16,42■□□□□ 0,22
Hmcn2A2AJ76 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,4■□□□□ 0,22
Hmcn2A2AJ76 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16,37■□□□□ 0,21
Hmcn2A2AJ76 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16,36■□□□□ 0,21
Hmcn2A2AJ76 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16,36■□□□□ 0,21
Hmcn2A2AJ76 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,35■□□□□ 0,21
Hmcn2A2AJ76 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16,34■□□□□ 0,21
Hmcn2A2AJ76 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,33■□□□□ 0,21
Hmcn2A2AJ76 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Hmcn2A2AJ76 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,31■□□□□ 0,2
Hmcn2A2AJ76 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16,26■□□□□ 0,19
Hmcn2A2AJ76 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC16,25■□□□□ 0,19
Hmcn2A2AJ76 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,25■□□□□ 0,19
Hmcn2A2AJ76 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Hmcn2A2AJ76 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,18
Hmcn2A2AJ76 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Hmcn2A2AJ76 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Hmcn2A2AJ76 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Hmcn2A2AJ76 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Hmcn2A2AJ76 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Hmcn2A2AJ76 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Hmcn2A2AJ76 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Hmcn2A2AJ76 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16,08■□□□□ 0,16
Hmcn2A2AJ76 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Hmcn2A2AJ76 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Hmcn2A2AJ76 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Hmcn2A2AJ76 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC16,05■□□□□ 0,16
Hmcn2A2AJ76 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Hmcn2A2AJ76 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Hmcn2A2AJ76 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15,99■□□□□ 0,15
Hmcn2A2AJ76 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Hmcn2A2AJ76 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Hmcn2A2AJ76 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Hmcn2A2AJ76 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15,94■□□□□ 0,14
Hmcn2A2AJ76 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15,92■□□□□ 0,14
Hmcn2A2AJ76 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC15,92■□□□□ 0,14
Hmcn2A2AJ76 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Hmcn2A2AJ76 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Hmcn2A2AJ76 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Hmcn2A2AJ76 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,9■□□□□ 0,14
Hmcn2A2AJ76 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15,89■□□□□ 0,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms