Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vamp3P63024 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vamp3P63024 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp3P63024 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vamp3P63024 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Vamp3P63024 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vamp3P63024 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vamp3P63024 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vamp3P63024 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vamp3P63024 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp3P63024 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vamp3P63024 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp3P63024 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vamp3P63024 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vamp3P63024 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vamp3P63024 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vamp3P63024 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vamp3P63024 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vamp3P63024 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp3P63024 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vamp3P63024 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp3P63024 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp3P63024 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vamp3P63024 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp3P63024 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vamp3P63024 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vamp3P63024 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vamp3P63024 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vamp3P63024 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vamp3P63024 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp3P63024 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vamp3P63024 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vamp3P63024 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vamp3P63024 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vamp3P63024 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vamp3P63024 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vamp3P63024 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp3P63024 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp3P63024 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp3P63024 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp3P63024 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vamp3P63024 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vamp3P63024 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vamp3P63024 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vamp3P63024 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp3P63024 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp3P63024 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vamp3P63024 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vamp3P63024 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp3P63024 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp3P63024 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp3P63024 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp3P63024 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp3P63024 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp3P63024 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp3P63024 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp3P63024 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp3P63024 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vamp3P63024 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vamp3P63024 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vamp3P63024 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp3P63024 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vamp3P63024 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vamp3P63024 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vamp3P63024 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp3P63024 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vamp3P63024 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp3P63024 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vamp3P63024 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vamp3P63024 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vamp3P63024 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vamp3P63024 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vamp3P63024 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vamp3P63024 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vamp3P63024 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp3P63024 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vamp3P63024 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vamp3P63024 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Vamp3P63024 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Vamp3P63024 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vamp3P63024 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vamp3P63024 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vamp3P63024 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp3P63024 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vamp3P63024 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp3P63024 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp3P63024 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp3P63024 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp3P63024 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp3P63024 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp3P63024 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp3P63024 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Vamp3P63024 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vamp3P63024 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Vamp3P63024 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Vamp3P63024 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp3P63024 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Vamp3P63024 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp3P63024 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp3P63024 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms