Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Psmb2Q9R1P3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Psmb2Q9R1P3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Psmb2Q9R1P3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Psmb2Q9R1P3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Psmb2Q9R1P3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Psmb2Q9R1P3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Psmb2Q9R1P3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Psmb2Q9R1P3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Psmb2Q9R1P3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Psmb2Q9R1P3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Psmb2Q9R1P3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Psmb2Q9R1P3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Psmb2Q9R1P3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Psmb2Q9R1P3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Psmb2Q9R1P3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Psmb2Q9R1P3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Psmb2Q9R1P3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Psmb2Q9R1P3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Psmb2Q9R1P3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Psmb2Q9R1P3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Psmb2Q9R1P3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Psmb2Q9R1P3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Psmb2Q9R1P3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Psmb2Q9R1P3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22,02■■□□□ 1,12
Psmb2Q9R1P3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,96■■□□□ 1,11
Psmb2Q9R1P3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Psmb2Q9R1P3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
Psmb2Q9R1P3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Psmb2Q9R1P3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Psmb2Q9R1P3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Psmb2Q9R1P3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Psmb2Q9R1P3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Psmb2Q9R1P3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Psmb2Q9R1P3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Psmb2Q9R1P3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21,58■■□□□ 1,05
Psmb2Q9R1P3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Psmb2Q9R1P3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
Psmb2Q9R1P3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Psmb2Q9R1P3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Psmb2Q9R1P3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,29■■□□□ 1
Psmb2Q9R1P3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21,24■□□□□ 0,99
Psmb2Q9R1P3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Psmb2Q9R1P3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Psmb2Q9R1P3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Psmb2Q9R1P3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,09■□□□□ 0,97
Psmb2Q9R1P3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Psmb2Q9R1P3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Psmb2Q9R1P3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,99■□□□□ 0,95
Psmb2Q9R1P3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Psmb2Q9R1P3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Psmb2Q9R1P3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Psmb2Q9R1P3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Psmb2Q9R1P3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20,9■□□□□ 0,94
Psmb2Q9R1P3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Psmb2Q9R1P3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,83■□□□□ 0,93
Psmb2Q9R1P3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Psmb2Q9R1P3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Psmb2Q9R1P3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,77■□□□□ 0,92
Psmb2Q9R1P3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,72■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20,7■□□□□ 0,91
Psmb2Q9R1P3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,7■□□□□ 0,9
Psmb2Q9R1P3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Psmb2Q9R1P3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
Psmb2Q9R1P3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Psmb2Q9R1P3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Psmb2Q9R1P3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Psmb2Q9R1P3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Psmb2Q9R1P3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Psmb2Q9R1P3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Psmb2Q9R1P3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Psmb2Q9R1P3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Psmb2Q9R1P3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Psmb2Q9R1P3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Psmb2Q9R1P3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Psmb2Q9R1P3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Psmb2Q9R1P3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Psmb2Q9R1P3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Psmb2Q9R1P3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Psmb2Q9R1P3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Psmb2Q9R1P3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Psmb2Q9R1P3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Psmb2Q9R1P3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Psmb2Q9R1P3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Psmb2Q9R1P3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20,42■□□□□ 0,86
Psmb2Q9R1P3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Psmb2Q9R1P3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,36■□□□□ 0,85
Psmb2Q9R1P3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Psmb2Q9R1P3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Psmb2Q9R1P3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Psmb2Q9R1P3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20,31■□□□□ 0,84
Psmb2Q9R1P3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms