Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmb2Q9R1P3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Psmb2Q9R1P3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Psmb2Q9R1P3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psmb2Q9R1P3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Psmb2Q9R1P3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Psmb2Q9R1P3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmb2Q9R1P3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmb2Q9R1P3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmb2Q9R1P3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmb2Q9R1P3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmb2Q9R1P3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmb2Q9R1P3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmb2Q9R1P3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmb2Q9R1P3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmb2Q9R1P3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmb2Q9R1P3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmb2Q9R1P3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb2Q9R1P3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb2Q9R1P3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb2Q9R1P3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb2Q9R1P3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psmb2Q9R1P3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psmb2Q9R1P3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psmb2Q9R1P3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Psmb2Q9R1P3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Psmb2Q9R1P3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psmb2Q9R1P3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Psmb2Q9R1P3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psmb2Q9R1P3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psmb2Q9R1P3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb2Q9R1P3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psmb2Q9R1P3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psmb2Q9R1P3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psmb2Q9R1P3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psmb2Q9R1P3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Psmb2Q9R1P3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb2Q9R1P3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb2Q9R1P3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb2Q9R1P3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb2Q9R1P3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb2Q9R1P3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb2Q9R1P3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb2Q9R1P3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb2Q9R1P3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Psmb2Q9R1P3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Psmb2Q9R1P3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Psmb2Q9R1P3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Psmb2Q9R1P3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Psmb2Q9R1P3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Psmb2Q9R1P3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Psmb2Q9R1P3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Psmb2Q9R1P3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb2Q9R1P3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Psmb2Q9R1P3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb2Q9R1P3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Psmb2Q9R1P3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Psmb2Q9R1P3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psmb2Q9R1P3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psmb2Q9R1P3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
Psmb2Q9R1P3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psmb2Q9R1P3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psmb2Q9R1P3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psmb2Q9R1P3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb2Q9R1P3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb2Q9R1P3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psmb2Q9R1P3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb2Q9R1P3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb2Q9R1P3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb2Q9R1P3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb2Q9R1P3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb2Q9R1P3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb2Q9R1P3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb2Q9R1P3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb2Q9R1P3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb2Q9R1P3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb2Q9R1P3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb2Q9R1P3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb2Q9R1P3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Psmb2Q9R1P3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb2Q9R1P3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Psmb2Q9R1P3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb2Q9R1P3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Psmb2Q9R1P3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Psmb2Q9R1P3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Psmb2Q9R1P3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Psmb2Q9R1P3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Psmb2Q9R1P3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb2Q9R1P3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Psmb2Q9R1P3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Psmb2Q9R1P3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms