Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1N8

Defa22, Alpha-defensin 22, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa22Q8C1N8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Defa22Q8C1N8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Defa22Q8C1N8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Defa22Q8C1N8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Defa22Q8C1N8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC23,2■■□□□ 1,3
Defa22Q8C1N8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Defa22Q8C1N8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Defa22Q8C1N8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Defa22Q8C1N8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Defa22Q8C1N8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Defa22Q8C1N8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Defa22Q8C1N8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Defa22Q8C1N8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Defa22Q8C1N8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Defa22Q8C1N8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Defa22Q8C1N8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21,92■■□□□ 1,1
Defa22Q8C1N8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Defa22Q8C1N8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Defa22Q8C1N8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
Defa22Q8C1N8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Defa22Q8C1N8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Defa22Q8C1N8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Defa22Q8C1N8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Defa22Q8C1N8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Defa22Q8C1N8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21,53■■□□□ 1,04
Defa22Q8C1N8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Defa22Q8C1N8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Defa22Q8C1N8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Defa22Q8C1N8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC21,28■■□□□ 1
Defa22Q8C1N8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Defa22Q8C1N8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Defa22Q8C1N8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
Defa22Q8C1N8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Defa22Q8C1N8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Defa22Q8C1N8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
Defa22Q8C1N8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Defa22Q8C1N8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Defa22Q8C1N8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,76■□□□□ 0,91
Defa22Q8C1N8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20,75■□□□□ 0,91
Defa22Q8C1N8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Defa22Q8C1N8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Defa22Q8C1N8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Defa22Q8C1N8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Defa22Q8C1N8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,9
Defa22Q8C1N8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Defa22Q8C1N8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Defa22Q8C1N8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,61■□□□□ 0,89
Defa22Q8C1N8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Defa22Q8C1N8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,59■□□□□ 0,89
Defa22Q8C1N8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,88
Defa22Q8C1N8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Defa22Q8C1N8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Defa22Q8C1N8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Defa22Q8C1N8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Defa22Q8C1N8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Defa22Q8C1N8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,4■□□□□ 0,86
Defa22Q8C1N8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Defa22Q8C1N8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,27■□□□□ 0,84
Defa22Q8C1N8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Defa22Q8C1N8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,25■□□□□ 0,83
Defa22Q8C1N8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20,21■□□□□ 0,83
Defa22Q8C1N8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Defa22Q8C1N8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Defa22Q8C1N8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20,18■□□□□ 0,82
Defa22Q8C1N8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20,17■□□□□ 0,82
Defa22Q8C1N8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,16■□□□□ 0,82
Defa22Q8C1N8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20,15■□□□□ 0,82
Defa22Q8C1N8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
Defa22Q8C1N8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
Defa22Q8C1N8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,8
Defa22Q8C1N8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,04■□□□□ 0,8
Defa22Q8C1N8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,03■□□□□ 0,8
Defa22Q8C1N8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,97■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
Defa22Q8C1N8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,93■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19,9■□□□□ 0,78
Defa22Q8C1N8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
Defa22Q8C1N8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,88■□□□□ 0,77
Defa22Q8C1N8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,86■□□□□ 0,77
Defa22Q8C1N8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Defa22Q8C1N8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Defa22Q8C1N8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Defa22Q8C1N8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Defa22Q8C1N8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Defa22Q8C1N8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Defa22Q8C1N8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Defa22Q8C1N8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19,77■□□□□ 0,76
Defa22Q8C1N8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19,77■□□□□ 0,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,5 ms