RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa58,28■■■■■ 6,92
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Abcc9P70170 1546 aa55,54■■■■■ 6,48
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 ScribQ80U72 1612 aa54,11■■■■■ 6,25
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NacadQ5SWP3 1504 aa52,12■■■■■ 5,93
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kdm5dQ62240 1548 aa52,07■■■■■ 5,93
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sycp2Q9CUU3 1500 aa51,16■■■■■ 5,78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dcaf1Q80TR8 1506 aa51,01■■■■■ 5,76
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa50,09■■■■■ 5,61
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Baz1aO88379 1555 aa49,31■■■■■ 5,48
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP48,68■■■■■ 5,38
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam135aQ6NS59 1506 aa48,07■■■■■ 5,29
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP48,03■■■■■ 5,28
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa46,49■■■■■ 5,03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa46,11■■■■■ 4,97
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kif21aQ9QXL2 1672 aa45,75■■■■■ 4,91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP45,73■■■■■ 4,91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cux2P70298 1426 aa45,72■■■■■ 4,91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kif15Q6P9L6 1387 aa45,61■■■■■ 4,89
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP45,41■■■■■ 4,86
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lamc3Q9R0B6 1581 aa45,34■■■■■ 4,85
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Shroom2A2ALU4 1481 aa45,23■■■■■ 4,83
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP44,87■■■■■ 4,77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Golga3P55937 1487 aa44,83■■■■■ 4,77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cngb1E1AZ71 1325 aa44,81■■■■■ 4,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Col17a1Q07563 1470 aa44,8■■■■■ 4,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 TnnQ80Z71 1560 aa44,78■■■■■ 4,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Top2bQ64511 1612 aa44,78■■■■■ 4,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Il27Q8K3I6 234 aa44,77■■■■■ 4,76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Plb1Q3TTY0 1478 aa44,73■■■■■ 4,75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc18Q640L5 1455 aa44,69■■■■■ 4,74
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP44,68■■■■■ 4,74
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Crocc2F6XLV1 1638 aa44,57■■■■■ 4,73
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP44,55■■■■■ 4,72
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Camsap1A2AHC3 1581 aa44,54■■■■■ 4,72
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP44,49■■■■■ 4,71
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rusc2Q80U22 1514 aa44,4■■■■■ 4,7
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP44,36■■■■■ 4,69
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fmn1Q05860 1466 aa44,33■■■■■ 4,69
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ift140E9PY46 1464 aa44,24■■■■■ 4,67
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP44,2■■■■■ 4,67
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP44,13■■■■■ 4,66
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Duox2A2AQ99 1517 aa44,02■■■■■ 4,64
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Grin2bQ01097 1482 aa43,91■■■■■ 4,62
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Disp1Q3TDN0 1521 aa43,78■■■■■ 4,6
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Setd1bQ8CFT2 1985 aa43,77■■■■■ 4,6
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Samd9lQ69Z37 1561 aa43,7■■■■■ 4,59
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP43,69■■■■■ 4,58
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa43,64■■■■■ 4,58
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP43,61■■■■■ 4,57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa43,59■■■■■ 4,57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Adgrl3Q80TS3 1537 aa43,58■■■■■ 4,57
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rad54l2Q99NG0 1466 aa43,45■■■■■ 4,55
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa43,45■■■■■ 4,55
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP43,3■■■■■ 4,52
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fgd6Q69ZL1 1399 aa43,27■■■■■ 4,52
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Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Shroom4Q1W617 1475 aa43,18■■■■■ 4,5
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