RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047993.9

Hoxa13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Hoxa13, Length 1,309 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa58.28■■■■■ 6.92
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NischQ80TM9 1593 aa57.44■■■■■ 6.79
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Abcc8B2RUS7 1588 aa55.56■■■■■ 6.48
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Abcc9P70170 1546 aa55.54■■■■■ 6.48
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 ScribQ80U72 1612 aa54.11■■■■■ 6.25
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NacadQ5SWP3 1504 aa52.12■■■■■ 5.93
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kdm5dQ62240 1548 aa52.07■■■■■ 5.93
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Sycp2Q9CUU3 1500 aa51.16■■■■■ 5.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dcaf1Q80TR8 1506 aa51.01■■■■■ 5.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 BicraF8VPZ9 1578 aa50.68■■■■■ 5.7
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa50.59■■■■■ 5.69
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa50.09■■■■■ 5.61
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rhox8Q6VSS7 320 aa49.63■■■■■ 5.54
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP49.42■■■■■ 5.5
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP49.33■■■■■ 5.49
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Baz1aO88379 1555 aa49.31■■■■■ 5.48
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc180J3QNE4 1664 aa49.21■■■■■ 5.47
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Crybg2B7ZCC2 1516 aa49.03■■■■■ 5.44
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP48.73■■■■■ 5.39
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa48.61■■■■■ 5.37
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ercc6F8VPZ5 1481 aa48.4■■■■■ 5.34
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smarca2Q6DIC0 1577 aa48.12■■■■■ 5.29
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fam135aQ6NS59 1506 aa48.07■■■■■ 5.29
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP48.03■■■■■ 5.28
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa47.94■■■■■ 5.26
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa47.84■■■■■ 5.25
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Wdr62Q3U3T8 1523 aa47.64■■■■■ 5.22
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Frmpd1A2AKB4 1549 aa47.53■■■■■ 5.2
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Baz1bQ9Z277 1479 aa47.28■■■■■ 5.16
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Unc13aQ4KUS2 1712 aa47.06■■■■■ 5.12
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ubl4bQ9CQ84 188 aa47.02■■■■■ 5.12
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rtl1Q7M732 1744 aa46.97■■■■■ 5.11
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Mrc2Q64449 1479 aa46.94■■■■■ 5.1
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 CftrP26361 1476 aa46.67■■■■■ 5.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa46.63■■■■■ 5.06
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Synj1Q8CHC4 1574 aa46.62■■■■■ 5.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dnajc5P60904 198 aa46.59■■■■■ 5.05
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Trim41Q5NCC3 630 aa46.51■■■■■ 5.04
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa46.49■■■■■ 5.03
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa46.11■■■■■ 4.97
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP45.97■■■■■ 4.95
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kif21aQ9QXL2 1672 aa45.75■■■■■ 4.91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cux2P70298 1426 aa45.72■■■■■ 4.91
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Kif15Q6P9L6 1387 aa45.61■■■■■ 4.89
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Lamc3Q9R0B6 1581 aa45.34■■■■■ 4.85
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Shroom2A2ALU4 1481 aa45.23■■■■■ 4.83
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP45.13■■■■■ 4.82
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cep164Q5DU05 1446 aa44.93■■■■■ 4.78
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Golga3P55937 1487 aa44.83■■■■■ 4.77
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cngb1E1AZ71 1325 aa44.81■■■■■ 4.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Col17a1Q07563 1470 aa44.8■■■■■ 4.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 TnnQ80Z71 1560 aa44.78■■■■■ 4.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Top2bQ64511 1612 aa44.78■■■■■ 4.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Il27Q8K3I6 234 aa44.77■■■■■ 4.76
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Plb1Q3TTY0 1478 aa44.73■■■■■ 4.75
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc18Q640L5 1455 aa44.69■■■■■ 4.74
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Crocc2F6XLV1 1638 aa44.57■■■■■ 4.73
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Camsap1A2AHC3 1581 aa44.54■■■■■ 4.72
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rusc2Q80U22 1514 aa44.4■■■■■ 4.7
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fmn1Q05860 1466 aa44.33■■■■■ 4.69
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ift140E9PY46 1464 aa44.24■■■■■ 4.67
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Duox2A2AQ99 1517 aa44.02■■■■■ 4.64
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Grin2bQ01097 1482 aa43.91■■■■■ 4.62
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Disp1Q3TDN0 1521 aa43.78■■■■■ 4.6
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Setd1bQ8CFT2 1985 aa43.77■■■■■ 4.6
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Samd9lQ69Z37 1561 aa43.7■■■■■ 4.59
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa43.64■■■■■ 4.58
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP43.61■■■■■ 4.57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa43.59■■■■■ 4.57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Adgrl3Q80TS3 1537 aa43.58■■■■■ 4.57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Efcab5A0JP43 1406 aa43.57■■■■■ 4.57
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa43.57■■■■■ 4.56
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa43.53■■■■■ 4.56
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Rad54l2Q99NG0 1466 aa43.45■■■■■ 4.55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa43.45■■■■■ 4.55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Cep170Q6A065 1588 aa43.44■■■■■ 4.55
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PtprkP35822 1457 aa43.4■■■■■ 4.54
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 NrkQ9R0G8 1455 aa43.34■■■■■ 4.53
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Chic1Q8CBW7 227 aa43.33■■■■■ 4.53
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa43.33■■■■■ 4.53
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Grin2aP35436 1464 aa43.29■■■■■ 4.52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Magi3Q9EQJ9 1476 aa43.27■■■■■ 4.52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Fgd6Q69ZL1 1399 aa43.27■■■■■ 4.52
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 PtprtQ99M80 1454 aa43.19■■■■■ 4.5
Hoxa13-201ENSMUST00000047993 Shroom4Q1W617 1475 aa43.18■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.2 ms