Protein–RNA interactions for Protein: Q64525

Hist2h2bb, Histone H2B type 2-B, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2bbQ64525 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hist2h2bbQ64525 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hist2h2bbQ64525 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hist2h2bbQ64525 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hist2h2bbQ64525 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hist2h2bbQ64525 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hist2h2bbQ64525 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hist2h2bbQ64525 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hist2h2bbQ64525 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hist2h2bbQ64525 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hist2h2bbQ64525 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hist2h2bbQ64525 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hist2h2bbQ64525 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hist2h2bbQ64525 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hist2h2bbQ64525 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hist2h2bbQ64525 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hist2h2bbQ64525 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hist2h2bbQ64525 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hist2h2bbQ64525 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hist2h2bbQ64525 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hist2h2bbQ64525 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hist2h2bbQ64525 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hist2h2bbQ64525 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hist2h2bbQ64525 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hist2h2bbQ64525 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hist2h2bbQ64525 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2bbQ64525 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2bbQ64525 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2bbQ64525 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2bbQ64525 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2bbQ64525 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2bbQ64525 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hist2h2bbQ64525 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hist2h2bbQ64525 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hist2h2bbQ64525 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hist2h2bbQ64525 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hist2h2bbQ64525 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hist2h2bbQ64525 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hist2h2bbQ64525 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hist2h2bbQ64525 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist2h2bbQ64525 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hist2h2bbQ64525 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hist2h2bbQ64525 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hist2h2bbQ64525 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hist2h2bbQ64525 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hist2h2bbQ64525 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist2h2bbQ64525 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hist2h2bbQ64525 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hist2h2bbQ64525 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hist2h2bbQ64525 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hist2h2bbQ64525 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist2h2bbQ64525 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hist2h2bbQ64525 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hist2h2bbQ64525 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hist2h2bbQ64525 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hist2h2bbQ64525 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hist2h2bbQ64525 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hist2h2bbQ64525 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hist2h2bbQ64525 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hist2h2bbQ64525 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hist2h2bbQ64525 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hist2h2bbQ64525 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2bbQ64525 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hist2h2bbQ64525 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hist2h2bbQ64525 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hist2h2bbQ64525 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hist2h2bbQ64525 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hist2h2bbQ64525 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hist2h2bbQ64525 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hist2h2bbQ64525 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hist2h2bbQ64525 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hist2h2bbQ64525 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hist2h2bbQ64525 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hist2h2bbQ64525 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hist2h2bbQ64525 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hist2h2bbQ64525 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2bbQ64525 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hist2h2bbQ64525 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hist2h2bbQ64525 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hist2h2bbQ64525 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hist2h2bbQ64525 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hist2h2bbQ64525 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hist2h2bbQ64525 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hist2h2bbQ64525 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hist2h2bbQ64525 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hist2h2bbQ64525 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hist2h2bbQ64525 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hist2h2bbQ64525 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hist2h2bbQ64525 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hist2h2bbQ64525 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hist2h2bbQ64525 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hist2h2bbQ64525 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms