RNA–Protein interactions for RNA: YHR107C

CDC12, Transcript of Component of the septin ring that is required for cytokinesis, yeast

Gene CDC12, Length 1,224 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDC12	YHR107C	MDM38	Q08179	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	PPM2	Q08282	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	ADR1	P07248	1323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	CAN1	P04817	590 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RAD53	P22216	821 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	APL1	P27351	700 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	FUN30	P31380	1131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	HSP78	P33416	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	MCD4	P36051	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	NUP82	P40368	713 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	BUD6	P41697	788 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YFL054C	P43549	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YFH7	P43591	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RNH70	P53331	553 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	SRT1	Q03175	343 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	HRQ1	Q05549	1077 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RTT109	Q07794	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	YPR117W	Q06116	2489 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	CIT2	P08679	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	PHO8	P11491	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	OCT1	P35999	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CDC12	YHR107C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
CDC12	YHR107C	YPR196W	Q06595	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	TAO3	P40468	2376 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CDC12	YHR107C	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	REC104	P33323	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	PET10	P36139	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YBR284W	P38150	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	VAB2	P40003	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YER158C	P40095	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	LYS14	P40971	790 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	SNO2	P53823	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	TIM23	P32897	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	UBP12	P39538	1254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ACA1	P39970	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YFL040W	P43562	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	NIT3	P49954	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	VPS30	Q02948	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	SWC3	P31376	625 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	THI4	P32318	326 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YKL151C	P36059	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YBL028C	P38202	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ECL1	P48235	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	INP52	P50942	1183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	UIP5	P36137	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	GIC1	P38785	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YAP1801	P38856	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	HFM1	P51979	1187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ALG12	P53730	551 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ECM30	Q06673	1274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	RFA1	P22336	621 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	BRN1	P38170	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	TOK1	P40310	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YIR042C	P40586	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	MSC2	Q03455	724 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	SIZ1	Q04195	904 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ICL2	Q12031	575 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	RRI2	Q12348	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	DFG16	Q99234	619 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	FLO1	P32768	1537 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ENA1	P13587	1091 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	GSY1	P23337	708 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	BET3	P36149	193 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	ALG2	P43636	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CDC12	YHR107C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected

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