Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.22■□□□□ 0.99
LPX1Q12405 NSR1YGR159C 1245 nt20.92■□□□□ 0.94
LPX1Q12405 NOP1YDL014W 984 nt20.72■□□□□ 0.91
LPX1Q12405 YKL036CYKL036C 393 nt19.32■□□□□ 0.68
LPX1Q12405 MDJ1YFL016C 1536 nt18.38■□□□□ 0.53
LPX1Q12405 Q0297Q0297 156 nt18.22■□□□□ 0.51
LPX1Q12405 SRX1YKL086W 384 nt18.12■□□□□ 0.49
LPX1Q12405 YJL027CYJL027C 417 nt18.08■□□□□ 0.48
LPX1Q12405 SCS3YGL126W 1143 nt17.69■□□□□ 0.42
LPX1Q12405 YCR051WYCR051W 669 nt17.2■□□□□ 0.34
LPX1Q12405 YOL085CYOL085C 342 nt16.74■□□□□ 0.27
LPX1Q12405 PKP1YIL042C 1185 nt16.47■□□□□ 0.23
LPX1Q12405 DBP2YNL112W 1641 nt16.36■□□□□ 0.21
LPX1Q12405 RPP1BYDL130W 321 nt16.35■□□□□ 0.21
LPX1Q12405 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.25■□□□□ 0.19
LPX1Q12405 CCC1YLR220W 969 nt16.1■□□□□ 0.17
LPX1Q12405 SCJ1YMR214W 1134 nt15.94■□□□□ 0.14
LPX1Q12405 ATS1YAL020C 1002 nt15.9■□□□□ 0.14
LPX1Q12405 PET122YER153C 765 nt15.6■□□□□ 0.09
LPX1Q12405 YBR190WYBR190W 312 nt15.6■□□□□ 0.09
LPX1Q12405 SCR1SCR1 522 nt15.47■□□□□ 0.07
LPX1Q12405 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.45■□□□□ 0.06
LPX1Q12405 RVS167YDR388W 1449 nt15.39■□□□□ 0.05
LPX1Q12405 RTC3YHR087W 336 nt15.27■□□□□ 0.04
LPX1Q12405 RRN5YLR141W 1092 nt15.18■□□□□ 0.02
LPX1Q12405 YDJ1YNL064C 1230 nt14.94□□□□□ -0.02
LPX1Q12405 SHR5YOL110W 714 nt14.92□□□□□ -0.02
LPX1Q12405 RSB1YOR049C 1065 nt14.91□□□□□ -0.02
LPX1Q12405 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.88□□□□□ -0.03
LPX1Q12405 PST2YDR032C 597 nt14.69□□□□□ -0.06
LPX1Q12405 GAR1YHR089C 618 nt14.57□□□□□ -0.08
LPX1Q12405 DEP1YAL013W 1218 nt14.45□□□□□ -0.1
LPX1Q12405 URN1YPR152C 1398 nt14.38□□□□□ -0.11
LPX1Q12405 YNL208WYNL208W 600 nt14.24□□□□□ -0.13
LPX1Q12405 YKL097CYKL097C 411 nt14.2□□□□□ -0.14
LPX1Q12405 RPN10YHR200W 807 nt14.19□□□□□ -0.14
LPX1Q12405 OPI9YLR338W 858 nt14.12□□□□□ -0.15
LPX1Q12405 TIR1YER011W 765 nt14.08□□□□□ -0.16
LPX1Q12405 SHU1YHL006C 453 nt14.04□□□□□ -0.16
LPX1Q12405 PUT4YOR348C 1884 nt14.01□□□□□ -0.17
LPX1Q12405 SAH1YER043C 1350 nt13.99□□□□□ -0.17
LPX1Q12405 SSA1YAL005C 1929 nt13.88□□□□□ -0.19
LPX1Q12405 ARE1YCR048W 1833 nt13.83□□□□□ -0.2
LPX1Q12405 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.77□□□□□ -0.21
LPX1Q12405 YJR018WYJR018W 363 nt13.73□□□□□ -0.21
LPX1Q12405 SRB2YHR041C 633 nt13.7□□□□□ -0.22
LPX1Q12405 PUN1YLR414C 792 nt13.7□□□□□ -0.22
LPX1Q12405 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.64□□□□□ -0.23
LPX1Q12405 YOR139CYOR139C 393 nt13.62□□□□□ -0.23
LPX1Q12405 POA1YBR022W 534 nt13.61□□□□□ -0.23
LPX1Q12405 YJR120WYJR120W 351 nt13.58□□□□□ -0.24
LPX1Q12405 PTC2YER089C 1395 nt13.52□□□□□ -0.25
LPX1Q12405 WWM1YFL010C 636 nt13.51□□□□□ -0.25
LPX1Q12405 RPP2BYDR382W 333 nt13.5□□□□□ -0.25
LPX1Q12405 YGR021WYGR021W 873 nt13.46□□□□□ -0.25
LPX1Q12405 HOM6YJR139C 1080 nt13.45□□□□□ -0.26
LPX1Q12405 NPL3YDR432W 1245 nt13.44□□□□□ -0.26
LPX1Q12405 MNP1YGL068W 585 nt13.42□□□□□ -0.26
LPX1Q12405 SSA3YBL075C 1950 nt13.38□□□□□ -0.27
LPX1Q12405 BUD23YCR047C 828 nt13.35□□□□□ -0.27
LPX1Q12405 NAB2YGL122C 1578 nt13.31□□□□□ -0.28
LPX1Q12405 BDH2YAL061W 1254 nt13.28□□□□□ -0.28
LPX1Q12405 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.27□□□□□ -0.29
LPX1Q12405 BSC6YOL137W 1494 nt13.25□□□□□ -0.29
LPX1Q12405 RKM5YLR137W 1104 nt13.25□□□□□ -0.29
LPX1Q12405 YOL037CYOL037C 354 nt13.25□□□□□ -0.29
LPX1Q12405 INM2YDR287W 879 nt13.21□□□□□ -0.29
LPX1Q12405 DAL1YIR027C 1383 nt13.17□□□□□ -0.3
LPX1Q12405 LSM3YLR438C-A 270 nt13.15□□□□□ -0.3
LPX1Q12405 FPR4YLR449W 1179 nt13.15□□□□□ -0.3
LPX1Q12405 FIS1YIL065C 468 nt13.13□□□□□ -0.31
LPX1Q12405 YBL100CYBL100C 315 nt13.12□□□□□ -0.31
LPX1Q12405 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.08□□□□□ -0.32
LPX1Q12405 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.08□□□□□ -0.32
LPX1Q12405 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.08□□□□□ -0.32
LPX1Q12405 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.08□□□□□ -0.32
LPX1Q12405 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.08□□□□□ -0.32
LPX1Q12405 PHO4YFR034C 939 nt13.05□□□□□ -0.32
LPX1Q12405 TRM9YML014W 840 nt12.99□□□□□ -0.33
LPX1Q12405 FUN26YAL022C 1554 nt12.98□□□□□ -0.33
LPX1Q12405 YLR281CYLR281C 468 nt12.97□□□□□ -0.33
LPX1Q12405 PUS2YGL063W 1113 nt12.91□□□□□ -0.34
LPX1Q12405 WHI5YOR083W 888 nt12.89□□□□□ -0.35
LPX1Q12405 CCT6YDR188W 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
LPX1Q12405 ALF1YNL148C 765 nt12.73□□□□□ -0.37
LPX1Q12405 YPS1YLR120C 1710 nt12.71□□□□□ -0.37
LPX1Q12405 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.71□□□□□ -0.37
LPX1Q12405 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.7□□□□□ -0.38
LPX1Q12405 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.7□□□□□ -0.38
LPX1Q12405 YDR095CYDR095C 411 nt12.67□□□□□ -0.38
LPX1Q12405 YPR011CYPR011C 981 nt12.65□□□□□ -0.38
LPX1Q12405 DSK2YMR276W 1122 nt12.63□□□□□ -0.39
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