RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	MET3	P08536	511 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	LCD1	Q04377	747 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	SWM1	Q12379	170 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	TRM11	Q12463	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	CTF13	P35203	478 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	CTF8	P38877	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	ERG5	P54781	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	IRC10	Q08118	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	CDC11	P32458	415 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	DAS1	P47005	663 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.73	□□□□□ -1.65	not detected
SYS1	YJL004C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	RPD3	P32561	433 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	REC104	P33323	182 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	VAC8	P39968	578 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	DLT1	Q04216	342 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SYS1	YJL004C	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	TOK1	P40310	691 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	ELO3	P40319	345 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	CEP3	P40969	608 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	YHR078W	P38799	552 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	FRE5	Q08908	694 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	TRM13	Q12383	476 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	STE5	P32917	917 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	MTH1	P35198	433 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	ATF1	P40353	525 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	PUS2	P53167	370 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	HDA1	P53973	706 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	MUK1	Q02866	612 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	MPH2	P0CD99	609 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	YBR184W	P38299	523 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	YHL017W	P38745	532 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	GND2	P53319	492 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	NGG1	P32494	702 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	SPC42	P36094	363 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	ERT1	P38140	529 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	RPP1	P38786	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	ALR2	P43553	858 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	PFD1	P46988	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	ADY4	Q05955	493 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	FMP25	Q08023	583 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	SDS3	P40505	327 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	NIT3	P49954	291 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	PKH1	Q03407	766 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	SPO75	Q07798	868 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	YPR071W	Q12346	211 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SYS1	YJL004C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	PPS1	P38148	807 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	FKH2	P41813	862 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	AMA1	P50082	593 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	ERP6	P53198	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	ASI2	P53895	289 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	PET10	P36139	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	YBR284W	P38150	797 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	VHR1	P40522	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	MUP1	P50276	574 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	BDF2	Q07442	638 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	ENV7	Q12003	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	PZF1	P39933	429 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	CRR1	Q05790	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	EAF1	Q06337	982 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	YJL163C	P46996	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	RIA1	P53893	1110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	NRG1	Q03125	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	UBX5	Q06682	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	HAL9	Q12180	1030 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	CDC43	P18898	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	ARE1	P25628	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	YBR053C	P38235	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYS1	YJL004C	YIR042C	P40586	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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