Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 NSR1YGR159C 1245 nt17.31■□□□□ 0.36
TRM13Q12383 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.94■□□□□ 0.3
TRM13Q12383 NOP1YDL014W 984 nt16.29■□□□□ 0.2
TRM13Q12383 MDJ1YFL016C 1536 nt15.84■□□□□ 0.13
TRM13Q12383 YJL027CYJL027C 417 nt14.61□□□□□ -0.07
TRM13Q12383 YKL036CYKL036C 393 nt14.5□□□□□ -0.09
TRM13Q12383 SRX1YKL086W 384 nt14.2□□□□□ -0.14
TRM13Q12383 Q0297Q0297 156 nt14.05□□□□□ -0.16
TRM13Q12383 DBP2YNL112W 1641 nt13.76□□□□□ -0.21
TRM13Q12383 YBR190WYBR190W 312 nt13.68□□□□□ -0.22
TRM13Q12383 YCR051WYCR051W 669 nt13.42□□□□□ -0.26
TRM13Q12383 RTC3YHR087W 336 nt13.35□□□□□ -0.27
TRM13Q12383 SSA3YBL075C 1950 nt13.24□□□□□ -0.29
TRM13Q12383 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.15□□□□□ -0.3
TRM13Q12383 CCC1YLR220W 969 nt12.99□□□□□ -0.33
TRM13Q12383 RVS167YDR388W 1449 nt12.93□□□□□ -0.34
TRM13Q12383 SCS3YGL126W 1143 nt12.89□□□□□ -0.35
TRM13Q12383 PUT4YOR348C 1884 nt12.79□□□□□ -0.36
TRM13Q12383 SCJ1YMR214W 1134 nt12.67□□□□□ -0.38
TRM13Q12383 RPP1BYDL130W 321 nt12.6□□□□□ -0.39
TRM13Q12383 YOL085CYOL085C 342 nt12.54□□□□□ -0.4
TRM13Q12383 PKP1YIL042C 1185 nt12.4□□□□□ -0.42
TRM13Q12383 ARE1YCR048W 1833 nt12.39□□□□□ -0.43
TRM13Q12383 POA1YBR022W 534 nt12.36□□□□□ -0.43
TRM13Q12383 SHR5YOL110W 714 nt12.32□□□□□ -0.44
TRM13Q12383 URN1YPR152C 1398 nt12.29□□□□□ -0.44
TRM13Q12383 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.27□□□□□ -0.45
TRM13Q12383 SAH1YER043C 1350 nt12.26□□□□□ -0.45
TRM13Q12383 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.25□□□□□ -0.45
TRM13Q12383 OPI9YLR338W 858 nt12.22□□□□□ -0.45
TRM13Q12383 BSC6YOL137W 1494 nt12.21□□□□□ -0.46
TRM13Q12383 DEP1YAL013W 1218 nt12.09□□□□□ -0.47
TRM13Q12383 PET122YER153C 765 nt12.08□□□□□ -0.48
TRM13Q12383 RPN10YHR200W 807 nt12.04□□□□□ -0.48
TRM13Q12383 SPT5YML010W 3192 nt11.97□□□□□ -0.49
TRM13Q12383 BUD23YCR047C 828 nt11.94□□□□□ -0.5
TRM13Q12383 YNL208WYNL208W 600 nt11.91□□□□□ -0.5
TRM13Q12383 PUN1YLR414C 792 nt11.89□□□□□ -0.51
TRM13Q12383 YDJ1YNL064C 1230 nt11.88□□□□□ -0.51
TRM13Q12383 SCR1SCR1 522 nt11.87□□□□□ -0.51
TRM13Q12383 SSA4YER103W 1929 nt11.85□□□□□ -0.51
TRM13Q12383 PTC2YER089C 1395 nt11.79□□□□□ -0.52
TRM13Q12383 NAB2YGL122C 1578 nt11.75□□□□□ -0.53
TRM13Q12383 YJR018WYJR018W 363 nt11.69□□□□□ -0.54
TRM13Q12383 GAR1YHR089C 618 nt11.67□□□□□ -0.54
TRM13Q12383 RRN5YLR141W 1092 nt11.67□□□□□ -0.54
TRM13Q12383 Q0182Q0182 405 nt11.55□□□□□ -0.56
TRM13Q12383 MEP2YNL142W 1500 nt11.51□□□□□ -0.57
TRM13Q12383 FIS1YIL065C 468 nt11.51□□□□□ -0.57
TRM13Q12383 DAL1YIR027C 1383 nt11.48□□□□□ -0.57
TRM13Q12383 FPR4YLR449W 1179 nt11.44□□□□□ -0.58
TRM13Q12383 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.43□□□□□ -0.58
TRM13Q12383 BDF1YLR399C 2061 nt11.42□□□□□ -0.58
TRM13Q12383 INM2YDR287W 879 nt11.37□□□□□ -0.59
TRM13Q12383 PHO4YFR034C 939 nt11.37□□□□□ -0.59
TRM13Q12383 ATS1YAL020C 1002 nt11.37□□□□□ -0.59
TRM13Q12383 RPP2BYDR382W 333 nt11.36□□□□□ -0.59
TRM13Q12383 YJR120WYJR120W 351 nt11.34□□□□□ -0.59
TRM13Q12383 YPS1YLR120C 1710 nt11.32□□□□□ -0.6
TRM13Q12383 TIR1YER011W 765 nt11.31□□□□□ -0.6
TRM13Q12383 RSB1YOR049C 1065 nt11.3□□□□□ -0.6
TRM13Q12383 TAT1YBR069C 1860 nt11.28□□□□□ -0.6
TRM13Q12383 DCW1YKL046C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
TRM13Q12383 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.27□□□□□ -0.61
TRM13Q12383 SSA1YAL005C 1929 nt11.26□□□□□ -0.61
TRM13Q12383 MOT3YMR070W 1473 nt11.24□□□□□ -0.61
TRM13Q12383 YDR095CYDR095C 411 nt11.18□□□□□ -0.62
TRM13Q12383 YMR090WYMR090W 684 nt11.18□□□□□ -0.62
TRM13Q12383 YBL100CYBL100C 315 nt11.17□□□□□ -0.62
TRM13Q12383 EMI2YDR516C 1503 nt11.15□□□□□ -0.62
TRM13Q12383 YBR220CYBR220C 1683 nt11.11□□□□□ -0.63
TRM13Q12383 YDL221WYDL221W 552 nt11.04□□□□□ -0.64
TRM13Q12383 BDH2YAL061W 1254 nt11□□□□□ -0.65
TRM13Q12383 SDH1YKL148C 1923 nt10.99□□□□□ -0.65
TRM13Q12383 FUN26YAL022C 1554 nt10.99□□□□□ -0.65
TRM13Q12383 ALF1YNL148C 765 nt10.99□□□□□ -0.65
TRM13Q12383 RPP2AYOL039W 321 nt10.97□□□□□ -0.65
TRM13Q12383 CAC2YML102W 1407 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM13Q12383 PTP1YDL230W 1008 nt10.93□□□□□ -0.66
TRM13Q12383 PAC11YDR488C 1602 nt10.92□□□□□ -0.66
TRM13Q12383 SRB2YHR041C 633 nt10.91□□□□□ -0.66
TRM13Q12383 TRM9YML014W 840 nt10.89□□□□□ -0.67
TRM13Q12383 SCC4YER147C 1875 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM13Q12383 SEC11YIR022W 504 nt10.85□□□□□ -0.67
TRM13Q12383 PCH2YBR186W 1695 nt10.83□□□□□ -0.68
TRM13Q12383 CCT6YDR188W 1641 nt10.8□□□□□ -0.68
TRM13Q12383 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.8□□□□□ -0.68
TRM13Q12383 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.8□□□□□ -0.68
TRM13Q12383 SIS1YNL007C 1059 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM13Q12383 IRC15YPL017C 1500 nt10.79□□□□□ -0.68
TRM13Q12383 GUT2YIL155C 1950 nt10.77□□□□□ -0.68
TRM13Q12383 LSM3YLR438C-A 270 nt10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.1 ms