Protein–RNA interactions for Protein: Q12451

OSH2, Oxysterol-binding protein homolog 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OSH2Q12451 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.07■■□□□ 1.12
OSH2Q12451 NSR1YGR159C 1245 nt21.74■■□□□ 1.07
OSH2Q12451 NOP1YDL014W 984 nt21.55■■□□□ 1.04
OSH2Q12451 YKL036CYKL036C 393 nt20.08■□□□□ 0.81
OSH2Q12451 MDJ1YFL016C 1536 nt19.46■□□□□ 0.71
OSH2Q12451 Q0297Q0297 156 nt18.93■□□□□ 0.62
OSH2Q12451 SRX1YKL086W 384 nt18.82■□□□□ 0.6
OSH2Q12451 YJL027CYJL027C 417 nt18.78■□□□□ 0.6
OSH2Q12451 SCS3YGL126W 1143 nt18.39■□□□□ 0.53
OSH2Q12451 YCR051WYCR051W 669 nt17.87■□□□□ 0.45
OSH2Q12451 YOL085CYOL085C 342 nt17.38■□□□□ 0.37
OSH2Q12451 PKP1YIL042C 1185 nt17.07■□□□□ 0.32
OSH2Q12451 DBP2YNL112W 1641 nt16.99■□□□□ 0.31
OSH2Q12451 RPP1BYDL130W 321 nt16.99■□□□□ 0.31
OSH2Q12451 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.91■□□□□ 0.3
OSH2Q12451 YBR190WYBR190W 312 nt16.73■□□□□ 0.27
OSH2Q12451 CCC1YLR220W 969 nt16.7■□□□□ 0.26
OSH2Q12451 SCJ1YMR214W 1134 nt16.57■□□□□ 0.24
OSH2Q12451 ATS1YAL020C 1002 nt16.5■□□□□ 0.23
OSH2Q12451 RTC3YHR087W 336 nt16.33■□□□□ 0.2
OSH2Q12451 PET122YER153C 765 nt16.2■□□□□ 0.18
OSH2Q12451 SCR1SCR1 522 nt16.09■□□□□ 0.17
OSH2Q12451 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.05■□□□□ 0.16
OSH2Q12451 RVS167YDR388W 1449 nt16.03■□□□□ 0.16
OSH2Q12451 SSA3YBL075C 1950 nt15.75■□□□□ 0.11
OSH2Q12451 RRN5YLR141W 1092 nt15.74■□□□□ 0.11
OSH2Q12451 PUT4YOR348C 1884 nt15.57■□□□□ 0.08
OSH2Q12451 YDJ1YNL064C 1230 nt15.54■□□□□ 0.08
OSH2Q12451 SHR5YOL110W 714 nt15.53■□□□□ 0.08
OSH2Q12451 RSB1YOR049C 1065 nt15.49■□□□□ 0.07
OSH2Q12451 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.45■□□□□ 0.06
OSH2Q12451 PST2YDR032C 597 nt15.24■□□□□ 0.03
OSH2Q12451 GAR1YHR089C 618 nt15.14■□□□□ 0.01
OSH2Q12451 ARE1YCR048W 1833 nt15.13■□□□□ 0.01
OSH2Q12451 URN1YPR152C 1398 nt15.1■□□□□ 0.01
OSH2Q12451 POA1YBR022W 534 nt15.04■□□□□ -0
OSH2Q12451 SAH1YER043C 1350 nt15.01□□□□□ -0.01
OSH2Q12451 OPI9YLR338W 858 nt15□□□□□ -0.01
OSH2Q12451 DEP1YAL013W 1218 nt14.99□□□□□ -0.01
OSH2Q12451 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.95□□□□□ -0.02
OSH2Q12451 BSC6YOL137W 1494 nt14.82□□□□□ -0.04
OSH2Q12451 RPN10YHR200W 807 nt14.8□□□□□ -0.04
OSH2Q12451 YNL208WYNL208W 600 nt14.8□□□□□ -0.04
OSH2Q12451 YKL097CYKL097C 411 nt14.76□□□□□ -0.05
OSH2Q12451 TIR1YER011W 765 nt14.63□□□□□ -0.07
OSH2Q12451 Q0182Q0182 405 nt14.6□□□□□ -0.07
OSH2Q12451 BUD23YCR047C 828 nt14.57□□□□□ -0.08
OSH2Q12451 SHU1YHL006C 453 nt14.57□□□□□ -0.08
OSH2Q12451 PUN1YLR414C 792 nt14.55□□□□□ -0.08
OSH2Q12451 SPT5YML010W 3192 nt14.47□□□□□ -0.09
OSH2Q12451 PTC2YER089C 1395 nt14.46□□□□□ -0.1
OSH2Q12451 SSA1YAL005C 1929 nt14.4□□□□□ -0.1
OSH2Q12451 YJR018WYJR018W 363 nt14.37□□□□□ -0.11
OSH2Q12451 NAB2YGL122C 1578 nt14.34□□□□□ -0.11
OSH2Q12451 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.26□□□□□ -0.13
OSH2Q12451 SSA4YER103W 1929 nt14.22□□□□□ -0.13
OSH2Q12451 SRB2YHR041C 633 nt14.2□□□□□ -0.14
OSH2Q12451 YOR139CYOR139C 393 nt14.12□□□□□ -0.15
OSH2Q12451 YJR120WYJR120W 351 nt14.11□□□□□ -0.15
OSH2Q12451 FIS1YIL065C 468 nt14.09□□□□□ -0.15
OSH2Q12451 MOT3YMR070W 1473 nt14.08□□□□□ -0.16
OSH2Q12451 DAL1YIR027C 1383 nt14.06□□□□□ -0.16
OSH2Q12451 RPP2BYDR382W 333 nt14.05□□□□□ -0.16
OSH2Q12451 YGR021WYGR021W 873 nt14.03□□□□□ -0.16
OSH2Q12451 WWM1YFL010C 636 nt14.01□□□□□ -0.17
OSH2Q12451 FPR4YLR449W 1179 nt14□□□□□ -0.17
OSH2Q12451 HOM6YJR139C 1080 nt13.98□□□□□ -0.17
OSH2Q12451 MEP2YNL142W 1500 nt13.96□□□□□ -0.17
OSH2Q12451 NPL3YDR432W 1245 nt13.96□□□□□ -0.17
OSH2Q12451 MNP1YGL068W 585 nt13.94□□□□□ -0.18
OSH2Q12451 INM2YDR287W 879 nt13.93□□□□□ -0.18
OSH2Q12451 PHO4YFR034C 939 nt13.92□□□□□ -0.18
OSH2Q12451 YPS1YLR120C 1710 nt13.83□□□□□ -0.2
OSH2Q12451 YOL037CYOL037C 354 nt13.82□□□□□ -0.2
OSH2Q12451 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.81□□□□□ -0.2
OSH2Q12451 BDH2YAL061W 1254 nt13.81□□□□□ -0.2
OSH2Q12451 RKM5YLR137W 1104 nt13.78□□□□□ -0.2
OSH2Q12451 DCW1YKL046C 1350 nt13.73□□□□□ -0.21
OSH2Q12451 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.72□□□□□ -0.21
OSH2Q12451 YBL100CYBL100C 315 nt13.71□□□□□ -0.21
OSH2Q12451 BDF1YLR399C 2061 nt13.71□□□□□ -0.21
OSH2Q12451 YDR095CYDR095C 411 nt13.67□□□□□ -0.22
OSH2Q12451 LSM3YLR438C-A 270 nt13.67□□□□□ -0.22
OSH2Q12451 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.55□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.55□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.55□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.55□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.55□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 EMI2YDR516C 1503 nt13.54□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 FUN26YAL022C 1554 nt13.53□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 TAT1YBR069C 1860 nt13.53□□□□□ -0.24
OSH2Q12451 TRM9YML014W 840 nt13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.7 ms