RNA–Protein interactions for RNA: YMR212C

EFR3, Transcript of Protein required for Stt4-containing PI kinase complex localization, yeast

Gene EFR3, Length 2,349 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFR3	YMR212C	EMC1	P25574	760 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	SRP101	P32916	621 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	BET3	P36149	193 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	ZRG8	P40021	1076 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	EAF1	Q06337	982 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	TPO1	Q07824	586 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	YPR071W	Q12346	211 aa		2.73	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	TOK1	P40310	691 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	CHA4	P43634	648 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	MET12	P46151	657 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	YGR012W	P53206	393 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	TAF8	Q03750	510 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	PPM2	Q08282	695 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	FLC1	Q08967	793 aa		2.72	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	YCR015C	P25616	317 aa		2.71	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	RTA1	P53047	317 aa		2.71	□□□□□ -1.97
EFR3	YMR212C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YRO2	P38079	344 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YER158C	P40095	573 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	TIM54	P47045	478 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.71	□□□□□ -1.98	not detected
EFR3	YMR212C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	NSE3	Q05541	303 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YLR224W	Q05947	369 aa		2.71	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	CIT1	P00890	479 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ENA1	P13587	1091 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	PPH3	P32345	308 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YGR125W	P53273	1036 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ENA2	Q01896	1091 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	RXT3	Q07458	294 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	SPO75	Q07798	868 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	LAS17	Q12446	633 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ENA5	Q12691	1091 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ADE8	P04161	214 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	CAN1	P04817	590 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	HIS5	P07172	385 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	SPE1	P08432	466 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	FBP1	P09201	348 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ARE1	P25628	610 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	RPD3	P32561	433 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	PET10	P36139	283 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	CCC2	P38995	1004 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	PLB1	P39105	664 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	GIP4	P39732	760 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	NCS6	P53088	359 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ERP6	P53198	216 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	LCD1	Q04377	747 aa		2.7	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YLR358C	O13565	187 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	STE14	P32584	239 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	BUD6	P41697	788 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YJL049W	P47048	450 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	TMA10	Q06177	86 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YOL098C	Q12496	1037 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	HSF1	P10961	833 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	CTS1	P29029	562 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	POA1	P38218	177 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	TY4A-J	P47023	414 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	NNF1	P47149	201 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	HDA1	P53973	706 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YOR352W	Q08816	343 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	KCS1	Q12494	1050 aa		2.69	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ERR1	P0CX10	437 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ERR2	P0CX11	437 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	REC104	P33323	182 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	SHM2	P37291	469 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	GYP8	P43570	497 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	MAL11	P53048	616 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	YPR196W	Q06595	470 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	ENV7	Q12003	364 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	UPC2	Q12151	913 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	STE13	P33894	931 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	PHO23	P50947	330 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	EXG2	P52911	562 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	OSH2	Q12451	1283 aa		2.68	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	RPC82	P32349	654 aa		2.67	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	DCG1	P32460	244 aa		2.67	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected
EFR3	YMR212C	RPN4	Q03465	531 aa		2.67	□□□□□ -1.98
EFR3	YMR212C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.67	□□□□□ -1.98	not detected

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