Protein–RNA interactions for Protein: P32916

SRP101, Signal recognition particle receptor subunit alpha homolog, yeastyeast

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP101P32916 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.74■□□□□ 0.91
SRP101P32916 NSR1YGR159C 1245 nt20.57■□□□□ 0.88
SRP101P32916 NOP1YDL014W 984 nt20.01■□□□□ 0.79
SRP101P32916 MDJ1YFL016C 1536 nt18.49■□□□□ 0.55
SRP101P32916 YKL036CYKL036C 393 nt18.4■□□□□ 0.54
SRP101P32916 SRX1YKL086W 384 nt17.49■□□□□ 0.39
SRP101P32916 Q0297Q0297 156 nt17.47■□□□□ 0.39
SRP101P32916 YJL027CYJL027C 417 nt17.21■□□□□ 0.35
SRP101P32916 SCS3YGL126W 1143 nt16.72■□□□□ 0.27
SRP101P32916 YCR051WYCR051W 669 nt16.69■□□□□ 0.26
SRP101P32916 DBP2YNL112W 1641 nt16.26■□□□□ 0.19
SRP101P32916 YOL085CYOL085C 342 nt15.96■□□□□ 0.15
SRP101P32916 CCC1YLR220W 969 nt15.88■□□□□ 0.13
SRP101P32916 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.87■□□□□ 0.13
SRP101P32916 PKP1YIL042C 1185 nt15.86■□□□□ 0.13
SRP101P32916 RPP1BYDL130W 321 nt15.71■□□□□ 0.11
SRP101P32916 YBR190WYBR190W 312 nt15.68■□□□□ 0.1
SRP101P32916 RTC3YHR087W 336 nt15.46■□□□□ 0.07
SRP101P32916 RVS167YDR388W 1449 nt15.24■□□□□ 0.03
SRP101P32916 SCJ1YMR214W 1134 nt15.19■□□□□ 0.02
SRP101P32916 PET122YER153C 765 nt15.08■□□□□ 0
SRP101P32916 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.02■□□□□ -0
SRP101P32916 ATS1YAL020C 1002 nt14.92□□□□□ -0.02
SRP101P32916 SCR1SCR1 522 nt14.84□□□□□ -0.03
SRP101P32916 SHR5YOL110W 714 nt14.67□□□□□ -0.06
SRP101P32916 RRN5YLR141W 1092 nt14.64□□□□□ -0.07
SRP101P32916 SSA3YBL075C 1950 nt14.48□□□□□ -0.09
SRP101P32916 YDJ1YNL064C 1230 nt14.46□□□□□ -0.09
SRP101P32916 DEP1YAL013W 1218 nt14.45□□□□□ -0.1
SRP101P32916 URN1YPR152C 1398 nt14.39□□□□□ -0.11
SRP101P32916 PUT4YOR348C 1884 nt14.35□□□□□ -0.11
SRP101P32916 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.33□□□□□ -0.12
SRP101P32916 RSB1YOR049C 1065 nt14.32□□□□□ -0.12
SRP101P32916 GAR1YHR089C 618 nt14.29□□□□□ -0.12
SRP101P32916 SAH1YER043C 1350 nt14.17□□□□□ -0.14
SRP101P32916 OPI9YLR338W 858 nt14.14□□□□□ -0.15
SRP101P32916 ARE1YCR048W 1833 nt14.08□□□□□ -0.15
SRP101P32916 RPN10YHR200W 807 nt14.06□□□□□ -0.16
SRP101P32916 YNL208WYNL208W 600 nt14.06□□□□□ -0.16
SRP101P32916 POA1YBR022W 534 nt13.97□□□□□ -0.17
SRP101P32916 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.93□□□□□ -0.18
SRP101P32916 PST2YDR032C 597 nt13.82□□□□□ -0.2
SRP101P32916 TIR1YER011W 765 nt13.76□□□□□ -0.21
SRP101P32916 YJR018WYJR018W 363 nt13.71□□□□□ -0.21
SRP101P32916 PUN1YLR414C 792 nt13.71□□□□□ -0.21
SRP101P32916 BUD23YCR047C 828 nt13.66□□□□□ -0.22
SRP101P32916 PTC2YER089C 1395 nt13.66□□□□□ -0.22
SRP101P32916 BSC6YOL137W 1494 nt13.65□□□□□ -0.22
SRP101P32916 SSA1YAL005C 1929 nt13.64□□□□□ -0.23
SRP101P32916 YJR120WYJR120W 351 nt13.46□□□□□ -0.25
SRP101P32916 SRB2YHR041C 633 nt13.45□□□□□ -0.26
SRP101P32916 NAB2YGL122C 1578 nt13.42□□□□□ -0.26
SRP101P32916 RPP2BYDR382W 333 nt13.38□□□□□ -0.27
SRP101P32916 FPR4YLR449W 1179 nt13.34□□□□□ -0.27
SRP101P32916 SHU1YHL006C 453 nt13.33□□□□□ -0.28
SRP101P32916 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.26□□□□□ -0.29
SRP101P32916 DAL1YIR027C 1383 nt13.23□□□□□ -0.29
SRP101P32916 YKL097CYKL097C 411 nt13.23□□□□□ -0.29
SRP101P32916 FIS1YIL065C 468 nt13.22□□□□□ -0.29
SRP101P32916 WWM1YFL010C 636 nt13.2□□□□□ -0.3
SRP101P32916 INM2YDR287W 879 nt13.17□□□□□ -0.3
SRP101P32916 PHO4YFR034C 939 nt13.13□□□□□ -0.31
SRP101P32916 YBL100CYBL100C 315 nt13.09□□□□□ -0.31
SRP101P32916 BDH2YAL061W 1254 nt13.08□□□□□ -0.32
SRP101P32916 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
SRP101P32916 MNP1YGL068W 585 nt12.97□□□□□ -0.33
SRP101P32916 YGR021WYGR021W 873 nt12.96□□□□□ -0.33
SRP101P32916 HOM6YJR139C 1080 nt12.95□□□□□ -0.34
SRP101P32916 FUN26YAL022C 1554 nt12.94□□□□□ -0.34
SRP101P32916 TRM9YML014W 840 nt12.89□□□□□ -0.35
SRP101P32916 YPS1YLR120C 1710 nt12.88□□□□□ -0.35
SRP101P32916 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.87□□□□□ -0.35
SRP101P32916 LSM3YLR438C-A 270 nt12.85□□□□□ -0.35
SRP101P32916 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.81□□□□□ -0.36
SRP101P32916 ALF1YNL148C 765 nt12.78□□□□□ -0.36
SRP101P32916 MEP2YNL142W 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
SRP101P32916 RKM5YLR137W 1104 nt12.77□□□□□ -0.37
SRP101P32916 YDR095CYDR095C 411 nt12.76□□□□□ -0.37
SRP101P32916 YOR139CYOR139C 393 nt12.74□□□□□ -0.37
SRP101P32916 CCT6YDR188W 1641 nt12.7□□□□□ -0.38
SRP101P32916 SSA4YER103W 1929 nt12.66□□□□□ -0.38
SRP101P32916 NPL3YDR432W 1245 nt12.66□□□□□ -0.38
SRP101P32916 DCW1YKL046C 1350 nt12.66□□□□□ -0.38
SRP101P32916 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.59□□□□□ -0.39
SRP101P32916 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.59□□□□□ -0.39
SRP101P32916 Q0182Q0182 405 nt12.57□□□□□ -0.4
SRP101P32916 YOL037CYOL037C 354 nt12.56□□□□□ -0.4
SRP101P32916 RPP2AYOL039W 321 nt12.55□□□□□ -0.4
SRP101P32916 SIS1YNL007C 1059 nt12.53□□□□□ -0.4
SRP101P32916 PTP1YDL230W 1008 nt12.52□□□□□ -0.41
SRP101P32916 CAC2YML102W 1407 nt12.5□□□□□ -0.41
SRP101P32916 EMI2YDR516C 1503 nt12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms