Protein–RNA interactions for Protein: Q08967

FLC1, Flavin carrier protein 1, yeast

Predictions only

Length 793 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FLC1	Q08967	YML009W-B	YML009W-B	477 nt		20.98	■□□□□ 0.95
FLC1	Q08967	NOP1	YDL014W	984 nt		20.55	■□□□□ 0.88
FLC1	Q08967	NSR1	YGR159C	1245 nt		20.48	■□□□□ 0.87
FLC1	Q08967	YKL036C	YKL036C	393 nt		19.27	■□□□□ 0.68
FLC1	Q08967	YJL027C	YJL027C	417 nt		18.08	■□□□□ 0.48
FLC1	Q08967	Q0297	Q0297	156 nt		18.03	■□□□□ 0.48
FLC1	Q08967	SRX1	YKL086W	384 nt		17.9	■□□□□ 0.46
FLC1	Q08967	MDJ1	YFL016C	1536 nt		17.85	■□□□□ 0.45
FLC1	Q08967	SCS3	YGL126W	1143 nt		17.68	■□□□□ 0.42
FLC1	Q08967	YCR051W	YCR051W	669 nt		17.09	■□□□□ 0.33
FLC1	Q08967	YOL085C	YOL085C	342 nt		16.64	■□□□□ 0.25
FLC1	Q08967	PKP1	YIL042C	1185 nt		16.39	■□□□□ 0.21
FLC1	Q08967	RPP1B	YDL130W	321 nt		16.2	■□□□□ 0.18
FLC1	Q08967	SCJ1	YMR214W	1134 nt		16.1	■□□□□ 0.17
FLC1	Q08967	TRN1	tP(UGG)A	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	SUF9	tP(UGG)F	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	SUF8	tP(UGG)H	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	tP(UGG)L	tP(UGG)L	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	SUF7	tP(UGG)M	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	tP(UGG)N1	tP(UGG)N1	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	tP(UGG)N2	tP(UGG)N2	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	tP(UGG)O1	tP(UGG)O1	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	SUF11	tP(UGG)O2	72 nt		15.94	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	ATS1	YAL020C	1002 nt		15.91	■□□□□ 0.14
FLC1	Q08967	CCC1	YLR220W	969 nt		15.89	■□□□□ 0.13
FLC1	Q08967	DBP2	YNL112W	1641 nt		15.85	■□□□□ 0.13
FLC1	Q08967	SCR1	SCR1	522 nt		15.45	■□□□□ 0.06
FLC1	Q08967	PET122	YER153C	765 nt		15.43	■□□□□ 0.06
FLC1	Q08967	tP(UGG)O3	tP(UGG)O3	72 nt		15.23	■□□□□ 0.03
FLC1	Q08967	RVS167	YDR388W	1449 nt		15.16	■□□□□ 0.02
FLC1	Q08967	YBR190W	YBR190W	312 nt		15.12	■□□□□ 0.01
FLC1	Q08967	RRN5	YLR141W	1092 nt		15.03	■□□□□ -0
FLC1	Q08967	RTC3	YHR087W	336 nt		14.91	□□□□□ -0.02
FLC1	Q08967	RSB1	YOR049C	1065 nt		14.89	□□□□□ -0.03
FLC1	Q08967	YER088W-B	YER088W-B	147 nt		14.72	□□□□□ -0.05
FLC1	Q08967	YDJ1	YNL064C	1230 nt		14.72	□□□□□ -0.05
FLC1	Q08967	Q0182	Q0182	405 nt		14.69	□□□□□ -0.06
FLC1	Q08967	PST2	YDR032C	597 nt		14.64	□□□□□ -0.07
FLC1	Q08967	SHR5	YOL110W	714 nt		14.64	□□□□□ -0.07
FLC1	Q08967	SSA3	YBL075C	1950 nt		14.47	□□□□□ -0.09
FLC1	Q08967	GAR1	YHR089C	618 nt		14.39	□□□□□ -0.11
FLC1	Q08967	YKL097C	YKL097C	411 nt		14.34	□□□□□ -0.11
FLC1	Q08967	MOT3	YMR070W	1473 nt		14.24	□□□□□ -0.13
FLC1	Q08967	DEP1	YAL013W	1218 nt		14.14	□□□□□ -0.15
FLC1	Q08967	URN1	YPR152C	1398 nt		14.03	□□□□□ -0.16
FLC1	Q08967	SHU1	YHL006C	453 nt		13.98	□□□□□ -0.17
FLC1	Q08967	RPN10	YHR200W	807 nt		13.96	□□□□□ -0.17
FLC1	Q08967	YNL208W	YNL208W	600 nt		13.94	□□□□□ -0.18
FLC1	Q08967	TIR1	YER011W	765 nt		13.87	□□□□□ -0.19
FLC1	Q08967	OPI9	YLR338W	858 nt		13.71	□□□□□ -0.21
FLC1	Q08967	PUT4	YOR348C	1884 nt		13.7	□□□□□ -0.22
FLC1	Q08967	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		13.7	□□□□□ -0.22
FLC1	Q08967	YOR139C	YOR139C	393 nt		13.61	□□□□□ -0.23
FLC1	Q08967	SSA1	YAL005C	1929 nt		13.58	□□□□□ -0.24
FLC1	Q08967	SAH1	YER043C	1350 nt		13.55	□□□□□ -0.24
FLC1	Q08967	NPL3	YDR432W	1245 nt		13.53	□□□□□ -0.24
FLC1	Q08967	YJR018W	YJR018W	363 nt		13.41	□□□□□ -0.26
FLC1	Q08967	YGR021W	YGR021W	873 nt		13.37	□□□□□ -0.27
FLC1	Q08967	PUN1	YLR414C	792 nt		13.36	□□□□□ -0.27
FLC1	Q08967	SRB2	YHR041C	633 nt		13.35	□□□□□ -0.27
FLC1	Q08967	WWM1	YFL010C	636 nt		13.31	□□□□□ -0.28
FLC1	Q08967	RPP2B	YDR382W	333 nt		13.3	□□□□□ -0.28
FLC1	Q08967	MNP1	YGL068W	585 nt		13.3	□□□□□ -0.28
FLC1	Q08967	HOM6	YJR139C	1080 nt		13.28	□□□□□ -0.28
FLC1	Q08967	ARE1	YCR048W	1833 nt		13.27	□□□□□ -0.29
FLC1	Q08967	YOL037C	YOL037C	354 nt		13.24	□□□□□ -0.29
FLC1	Q08967	POA1	YBR022W	534 nt		13.19	□□□□□ -0.3
FLC1	Q08967	YHR049C-A	YHR049C-A	297 nt		13.16	□□□□□ -0.3
FLC1	Q08967	YJR120W	YJR120W	351 nt		13.15	□□□□□ -0.3
FLC1	Q08967	PTC2	YER089C	1395 nt		13.13	□□□□□ -0.31
FLC1	Q08967	RKM5	YLR137W	1104 nt		13.11	□□□□□ -0.31
FLC1	Q08967	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		13.09	□□□□□ -0.31
FLC1	Q08967	tM(CAU)C	tM(CAU)C	72 nt		13.07	□□□□□ -0.32
FLC1	Q08967	IMT4	tM(CAU)E	72 nt		13.07	□□□□□ -0.32
FLC1	Q08967	IMT3	tM(CAU)J3	72 nt		13.07	□□□□□ -0.32
FLC1	Q08967	IMT1	tM(CAU)O1	72 nt		13.07	□□□□□ -0.32
FLC1	Q08967	IMT2	tM(CAU)P	72 nt		13.07	□□□□□ -0.32
FLC1	Q08967	BSC6	YOL137W	1494 nt		13.04	□□□□□ -0.32
FLC1	Q08967	SPT5	YML010W	3192 nt		13.03	□□□□□ -0.32
FLC1	Q08967	BDH2	YAL061W	1254 nt		13.02	□□□□□ -0.33
FLC1	Q08967	BUD23	YCR047C	828 nt		12.95	□□□□□ -0.34
FLC1	Q08967	PUS2	YGL063W	1113 nt		12.91	□□□□□ -0.34
FLC1	Q08967	LSM3	YLR438C-A	270 nt		12.91	□□□□□ -0.34
FLC1	Q08967	NAB2	YGL122C	1578 nt		12.9	□□□□□ -0.35
FLC1	Q08967	INM2	YDR287W	879 nt		12.89	□□□□□ -0.35
FLC1	Q08967	FPR4	YLR449W	1179 nt		12.87	□□□□□ -0.35
FLC1	Q08967	YLR281C	YLR281C	468 nt		12.86	□□□□□ -0.35
FLC1	Q08967	SSA4	YER103W	1929 nt		12.84	□□□□□ -0.35
FLC1	Q08967	YBL100C	YBL100C	315 nt		12.83	□□□□□ -0.36
FLC1	Q08967	DAL1	YIR027C	1383 nt		12.81	□□□□□ -0.36
FLC1	Q08967	WHI5	YOR083W	888 nt		12.8	□□□□□ -0.36
FLC1	Q08967	TRM9	YML014W	840 nt		12.76	□□□□□ -0.37
FLC1	Q08967	FIS1	YIL065C	468 nt		12.68	□□□□□ -0.38
FLC1	Q08967	FUN26	YAL022C	1554 nt		12.67	□□□□□ -0.38
FLC1	Q08967	PHO4	YFR034C	939 nt		12.66	□□□□□ -0.38
FLC1	Q08967	FMP45	YDL222C	930 nt		12.59	□□□□□ -0.39
FLC1	Q08967	DSK2	YMR276W	1122 nt		12.58	□□□□□ -0.4
FLC1	Q08967	IMP2'	YIL154C	1041 nt		12.55	□□□□□ -0.4
FLC1	Q08967	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		12.54	□□□□□ -0.4
FLC1	Q08967	CCT6	YDR188W	1641 nt		12.54	□□□□□ -0.4

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms